AP-PCR-SSCPを用いた病態特異的な遺伝子多型の網羅的探索法の確立と応用

AP-PCR-SSCP疾病特异性基因多态性综合检索方法的建立及应用

基本信息

  • 批准号:
    15659133
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.24万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 财政年份:
    2003
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2003 至 2004
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

特定の病態などの表現型に関連している遺伝子多型を直接検出する方法として、SNPから表現型へ進むのではなく、特定の表現型を説明できる遺伝型を探索するという逆のプロセスをたどるための基本的手法として、AP-PCR (arbitrary primed PCR)-SSCP (single strand conformation polymorphism)を利用した。1)長寿者とそれ以外のDNAを混合したDNAプールを作成する。100歳以上の百寿者1グループ(9人)、90歳3グループ(8本ずつ)、60歳1グループ(10人)から抽出したgenomic DNAをプールした。2)13種類のプライマーでAP-PCR (arbitrary primed PCR)を施行した.アガロースゲルで増幅産物を確認後、10%PAG、15℃、3.5時間のSSCP泳動を行った.銀染色による可視化で、表現型によって移動度の異なるバンド、濃さが変化しているバンドを切り出し、再PCRの後、TAクローニングを行い、ベクタープライマーで塩基配列を決定した。3)BLAST検索により得られた塩基配列から該当する遺伝子を同定した。4)遺伝子特異プライマーを用いて各表現型の個体それぞれをPCR-SSCP法で解析し、表現型と遺伝型との関連性について検証した。また、塩基配列決定によりSNPを同定した。その結果判明したSNPのうち、高齢者に高頻度に見いだされたSNPを1つ同定した。高齢者の例数も少なかったことから、医学部学生をコントロールとして分析し、SNPの頻度を比較したところ、Homosapiens 3 BAC RP11-61K12 (AC130566)の8768C>G polymorphismが見いだされた.この方法の考え方は、絨毯爆撃的にSNPを検出してから意味付けするのではなく、まとまったポピュレーションを説明できるSNPを探していこうというものである。方法として用いたAP-PCR-SSCPは、網羅的な遺伝子増幅プラスSSCPによる一本鎖としての分離と定量性である。今後、本法をさらにブラッシュアップして、プロテオミクス解析で用いられている2次元電気泳動と蛍光標識プライマーによる遺伝子増幅を組み合わせると、より詳細な解析が可能と考える.
Specific pathologic symptoms such as table type, subtype, AP-PCR (arbitrary primed PCR)-SSCP (single strand conformation polymorphism), and so on, respectively. 1) in addition to those who have a long life, they mix it with DNA, mix it with DNA, and make it into a mixture. Over 100 years old (9), 90

项目成果

期刊论文数量(22)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
遺伝子検査をとりまく環境と現状・将来
基因检测环境、现状与未来
  • DOI:
  • 发表时间:
    2003
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Miyakura Y;Sugano K;Akasu T;Yoshida T;Maekawa M;Saitoh S;Sasaki H;Nomizu T;Konishi F;前川 真人;前川 真人
  • 通讯作者:
    前川 真人
Inactivating mutations of the human base excision repair gene NEIL1 in gastric cancer
  • DOI:
    10.1093/carcin/bgh267
  • 发表时间:
    2004-12-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Shinmura, K;Tao, H;Sugimura, H
  • 通讯作者:
    Sugimura, H
Three-dimensional microarray compared with PCR-single-strand conformation polymorphism analysis/DNA sequencing for mutation analysis of K-ras codons 12 and 13
  • DOI:
    10.1373/clinchem.2004.032060
  • 发表时间:
    2004-08-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    9.3
  • 作者:
    Maekawa, M;Nagaoka, T;Kanno, T
  • 通讯作者:
    Kanno, T
Problem with Detection of an Insertion-Type Mutation in the BCHE Gene in a Patient with Butyrylcholinesterase Deficiency.
丁酰胆碱酯酶缺陷患者 BCHE 基因插入型突变检测的问题。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Maekawa M;Taniguchi T;Ishikawa J;Toyoda S;Takahata N
  • 通讯作者:
    Takahata N
Extensive but Hemiallelic Methylation of the hMLH1 Promoter Region in Early-Onset Sporadic Colon Cancers With Microsatellite Instability
  • DOI:
    10.1016/s1542-3565(03)00314-8
  • 发表时间:
    2004-02-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    12.6
  • 作者:
    Miyakura, Yasuyuki;Sugano, Kokichi;Nagai, Hideo
  • 通讯作者:
    Nagai, Hideo
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

前川 真人其他文献

気道上皮細胞におけるToll-like receptor 3を介した炎症性サイトカインの産生は,IL-17Aにより相乗的に増強される
IL-17A 协同增强气道上皮细胞中 Toll 样受体 3 介导的炎症细胞因子的产生
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    森  和貴;藤澤 朋幸;草ヶ谷 英樹;山中 勝正;橋本  大;榎本 紀之;中村 祐太郎;乾  直輝;前川 真人;須田 隆文
  • 通讯作者:
    須田 隆文
地域のCOVID-19クラスター介入支援活動の報告と今後の課題
关于区域性 COVID-19 集群干预支持活动和未来挑战的报告
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鈴木 利史;古橋 一樹;片橋 一人;澤木 ゆかり;高岡 雅代;名倉 理教;片桐 由起子;脇坂 浩;前川 真人
  • 通讯作者:
    前川 真人
臨床検査データに影響を及ぼす要因―年齢、性別、食事、運動などの生理的変動、採血条件など―
影响临床检测数据的因素——年龄、性别、饮食、运动等生理变化、采血条件等。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    前川 真人;濵田悦子
  • 通讯作者:
    濵田悦子
当院入院患者における新型コロナウイルスのヌクレオカプシド(N)及びスパイク(S)タンパク質に対する血清抗体の保有率調査
我院收治患者血清新型冠状病毒核衣壳(N)和刺突(S)蛋白抗体流行情况调查
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    古橋 一樹;片橋 一人;鈴木 利史;高岡 雅代;澤木 ゆかり;脇坂 浩;片桐 由起子;望月 啓志;戸口 明宏;名倉 理教;前川 真人
  • 通讯作者:
    前川 真人
甲状腺刺激ホルモン(TSH)測定値のハーモナイゼーション
促甲状腺激素 (TSH) 测量的统一
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    竹岡 啓子;日高 洋;菱沼 昭;池田 勝義;大久保 滋夫;土屋 達行;橋口 照人;堀田 多恵子;古田 耕;松下 一之;松本 祐之;村上 正巳;前川 真人
  • 通讯作者:
    前川 真人

前川 真人的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('前川 真人', 18)}}的其他基金

血中遊離核酸検査の質保証と技能試験の開発;精確な結果に基づくゲノム医療をめざして
无血核酸检测的质量保证和能力验证的开发以基于准确结果的基因组医学为目标;
  • 批准号:
    23K27503
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
血中遊離核酸検査の質保証と技能試験の開発;精確な結果に基づくゲノム医療をめざして
无血核酸检测的质量保证和能力验证的开发以基于准确结果的基因组医学为目标;
  • 批准号:
    23H02812
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
循環腫瘍細胞の統合型オミックス解析による生物学的性状、病態診断に関する研究
利用整合组学分析循环肿瘤细胞的生物学特性和病理诊断研究
  • 批准号:
    21659147
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
ミトコンドリアDNAのメチル化を指標とした癌の体液診断に関する研究
以线粒体DNA甲基化为指标的体液癌症诊断研究
  • 批准号:
    14657625
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
ヒト乳酸脱水素酵素サブユニット欠損症モデルとしてのAサブユニット欠損マウスの解析
A亚基缺陷小鼠作为人乳酸脱氢酶亚基缺陷模型的分析
  • 批准号:
    05671920
  • 财政年份:
    1993
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
血清酵素の遺伝性変異に関する研究
血清酶遗传变异的研究
  • 批准号:
    04772018
  • 财政年份:
    1992
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
乳酸脱水素酸素Aサブユニット欠損症におけるAサブユニット遺伝子の発現機構について
关于乳酸脱氢A亚基缺陷中A亚基基因的表达机制
  • 批准号:
    63772030
  • 财政年份:
    1988
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
乳酸脱水素酵素Aサブユニット欠損症におけるAサブユニット遺伝子の発現機構について
关于乳酸脱氢酶A亚基缺陷中A亚基基因的表达机制
  • 批准号:
    62771983
  • 财政年份:
    1987
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似国自然基金

内毒素致线粒体DNA突变检测SSCP方法的建立及阳离子保护效应研究
  • 批准号:
    30360079
  • 批准年份:
    2003
  • 资助金额:
    17.0 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
猪GH基因及其连锁群的PCR_RFLP和PCR_SSCP研究
  • 批准号:
    39370510
  • 批准年份:
    1993
  • 资助金额:
    6.5 万元
  • 项目类别:
    面上项目
SSCP-PCR法检测人肠癌P53突变的诊断研究
  • 批准号:
    39270755
  • 批准年份:
    1992
  • 资助金额:
    5.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Science and Solutions for a Changing Planet (SSCP) DTP
改变地球的科学与解决方案 (SSCP) DTP
  • 批准号:
    NE/S007415/1
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Training Grant
SSCP DTP NPIF Studentships
SSCP DTP NPIF 学生奖学金
  • 批准号:
    NE/R011613/1
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Training Grant
Development and clinical application of highly sensitive detection method (AL-COLD-PCR-SSCP) for somatic mutations in cancer
癌症体细胞突变高灵敏检测方法(AL-COLD-PCR-SSCP)的开发及临床应用
  • 批准号:
    22790524
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Fast Mutation Detection by Tandem SSCP/HA on Microchips
通过微芯片上的串联 SSCP/HA 进行快速突变检测
  • 批准号:
    7485498
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
Fast Mutation Detection by Tandem SSCP/HA on Microchips
通过微芯片上的串联 SSCP/HA 进行快速突变检测
  • 批准号:
    7422303
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
ALF Express-SSCP法によるABO血液型遺伝子の法医学、人類学的応用
使用 ALF Express-SSCP 方法对 ABO 血型基因进行法医和人类学应用
  • 批准号:
    16922159
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
(DNAプール)PLACE‐SSCP法による自己免疫疾患の病因遺伝子の網羅的探索
(DNA pool)利用PLACE-SSCP方法全面寻找自身免疫性疾病的致病基因
  • 批准号:
    16012247
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
Fast Mutation Detection by Tandem SSCP/HA on Microchips
通过微芯片上的串联 SSCP/HA 进行快速突变检测
  • 批准号:
    7267709
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
(DNAプール)PLACE-SSCP法による自己免疫疾患の病因遺伝子の網羅的探索
(DNA pool)利用PLACE-SSCP方法全面寻找自身免疫性疾病的致病基因
  • 批准号:
    15012238
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
SSCP equipment to examine the ecological and evolutionary influences on speciation and population genetics of metazoan parasites
SSCP 设备用于检查生态和进化对后生动物寄生虫物种形成和群体遗传学的影响
  • 批准号:
    300441-2004
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Research Tools and Instruments - Category 1 (<$150,000)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了