Bacteroides fragilisのノイラミニダーゼ遺伝子の発現調節

脆弱拟杆菌中神经氨酸酶基因表达的调控

• 批准号: 09770183
• 负责人: 桑原 知巳
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 1998
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09770183/
• 关键词: Bacteroides fragilis; 病原性; neurammlnidase; β-N-acetythexosaminidase; esterase; β-mannosldase; 閉鎖分解; 遺伝子スラクター; ノイラミニダーゼ; 遺伝子発現調節; β-N-acetyl hexosaminidase; pathogenicity island; パルスフィールドゲル電気泳動

Bacteroides fragilis は臨床検体より頻繁に分離される偏性嫌気性グラム陰性桿菌であり、特に本菌による敗血症は致命率が高い。Bacteroides fragilisの病原因子のーつとして考えられているノイラミニダーゼ遺伝子nanHの下流にはシアル酸の代謝に関与するsia1icacid permiase や lyase遺伝子の存在が推測されているがその証明は未だなされていない。本研究ではnanH遺伝子の下流にシアル酸代謝に関与する遺伝子群が存在するか否かを調べた。既にクローン化しているnanH遺伝子を含む約5.4kbのDNA断片からnanH遺伝子の下流約2.8kbの領域をpBluescript II KS+にサブクローニングし、塩基配列を決定した。さらにその下流領域は、上記決定配列の一部を用いて増幅したinverse PCR産物をpT7blueにクローニング後、塩基配列を決定した。nanH遺伝子下流8,170bpのDNA断片中には、4つのORFと、3′側が中断された5番目のORFが存在した。ORF1,とORF5から予想されるアミノ酸配列は共にPorphyromonas gingivalisのβ-N-acetylhexosaminidaseと高いホモロジーを示した。ORF2がコードし得る220アミノ酸配列は、ウシのplatelet-activating factor acethylhydrolase Ibのa sununitやE.coliのthioesterase Iなどのesterase類と相同性が認められた(それぞれ 29.0% および30.6%の相同性)。ORF3から予想される690アミノ酸配列は、N末端領域(220残基)においてVibrio mimicus arylesteraseと、またC末端領域(470残基)においてマウスのsialate9-O-acetylesteraseとそれぞれ25.5%および29.2%の相同性が認められた。またORF4は856アミノ酸残基をコードし得ると予測され、相同性検索の結果ヤギのβ-mannosidaseと29.2%の相同性を示した。以上よりnanH遺伝子下流には糖鎖分解に関与する遺伝子群がクラスターを形成している可能性が示唆された。

细菌片状叶片是一种强性的厌氧革兰氏阴性杆菌，比临床标本更频繁地分离出来，并且该细菌引起的败血症的死亡人数特别高。神经氨酸酶基因NANH的下游是被认为是菌群中的致病因素，是sia1icacid许可和酶基因涉及唾液酸代谢的存在，但尚未证明证据。在这项研究中，我们研究了NANH基因下游的唾液酸代谢是否涉及任何基因。从大约5.4 kb的DNA片段中，将NANH基因下游的大约2.8 kb的区域从包含已经克隆的NANH基因的大约5.4 kb DNA片段中取代，并确定基本序列。此外，在使用上述确定序列的一部分扩增后，将下游区域克隆到PT7Blue中。在NANH基因下游的8,170 bp DNA片段中，有四个ORF和一个中断3'的ORF。从ORF1和ORF5预测的氨基酸序列均与牙龈卟啉单胞菌的β-N-乙酰己糖胺酶具有高的同源性。发现ORF2可以编码的220个氨基酸序列被发现与诸如牛血小板激活因子抗甲基水解酶IB和硫代酯酶I的酯酶（分别为29.0％和30.6％同源性）同源。发现在N末端区域（220个残基）和C-C末端区域的N末端区域（220个残基）（220个残基）（220个残基）（220个残基）（220个残基）（220个残基）中，从ORF3预测的690个氨基酸序列具有25.5％和29.2％的同源性（470个残基）。预计ORF4也能够编码856个氨基酸残基，同源搜索与山羊β-甘露糖苷酶的同源性29.2％。从以上，已经提出，参与糖酵解的一组基因在NANH基因的下游形成了一个簇。

项目成果

S.M.Shaheduzzaman et al.: "Genome analysis of Bacteroides by pulsed-field gel electrophoresis:Chromosome sizes and restriction patterns." DNA Research. 4. 19-25 (1997)

S.M.Shaheduzzaman 等人：“通过脉冲场凝胶电泳对拟杆菌进行基因组分析：染色体大小和限制性模式。”

H.Arimochi et al.: "Effect of intestional bacteria on formation of azoxymethane-induced aberrant crypt foci in the rat colon." Biochemical Biophysical Research Communications. 238. 753-757 (1997)

H.Arimochi 等人：“肠道细菌对氧化偶氮甲烷诱导的大鼠结肠异常隐窝病灶形成的影响。”

T.Kuhara et al.: "Hemolytic urenmic syndrome in a patient with Bacterides fragilis infection." The Journal of the Japanese Association for infectious Diseases. 72(2). 162-166 (1998)

T.Kuhara 等人：“脆弱拟杆菌感染患者的溶血性尿毒症综合征。”

T.Kinouchi et al.: "Culture supernatants of Lactobacihis acidophilus and Bindobacterium adolescentis repress ileal ulcer formation in rats treated with a nonsteroidal antinflammatory drug by suppressing unbalanced growth of aerobic bacteria and lipid pero

T.Kinouchi 等人：“在接受非甾体类抗炎药治疗的大鼠中，嗜酸乳杆菌和青少年结合杆菌的培养上清液通过抑制需氧菌和脂质过氧化物的不平衡生长来抑制回肠溃疡的形成。

Shaheduzzamann S.M.et al.: "Genome analysis of Bacteroides by pulse-field gel electrophoresis : chromosome sizes and restriction patterns." DNA Research. 4. 19-25 (1997)

Shaheduzzamann S.M.等人：“通过脉冲场凝胶电泳对拟杆菌进行基因组分析：染色体大小和限制性模式。”