Bacteroides fragilisのノイラミニダーゼ遺伝子の発現調節

脆弱拟杆菌中神经氨酸酶基因表达的调控

• 批准号: 09770183
• 负责人: 桑原 知巳
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 1998
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09770183/
• 关键词: Bacteroides fragilis; 病原性; neurammlnidase; β-N-acetythexosaminidase; esterase; β-mannosldase; 閉鎖分解; 遺伝子スラクター; ノイラミニダーゼ; 遺伝子発現調節; β-N-acetyl hexosaminidase; pathogenicity island; パルスフィールドゲル電気泳動

Bacteroides fragilis は臨床検体より頻繁に分離される偏性嫌気性グラム陰性桿菌であり、特に本菌による敗血症は致命率が高い。Bacteroides fragilisの病原因子のーつとして考えられているノイラミニダーゼ遺伝子nanHの下流にはシアル酸の代謝に関与するsia1icacid permiase や lyase遺伝子の存在が推測されているがその証明は未だなされていない。本研究ではnanH遺伝子の下流にシアル酸代謝に関与する遺伝子群が存在するか否かを調べた。既にクローン化しているnanH遺伝子を含む約5.4kbのDNA断片からnanH遺伝子の下流約2.8kbの領域をpBluescript II KS+にサブクローニングし、塩基配列を決定した。さらにその下流領域は、上記決定配列の一部を用いて増幅したinverse PCR産物をpT7blueにクローニング後、塩基配列を決定した。nanH遺伝子下流8,170bpのDNA断片中には、4つのORFと、3′側が中断された5番目のORFが存在した。ORF1,とORF5から予想されるアミノ酸配列は共にPorphyromonas gingivalisのβ-N-acetylhexosaminidaseと高いホモロジーを示した。ORF2がコードし得る220アミノ酸配列は、ウシのplatelet-activating factor acethylhydrolase Ibのa sununitやE.coliのthioesterase Iなどのesterase類と相同性が認められた(それぞれ 29.0% および30.6%の相同性)。ORF3から予想される690アミノ酸配列は、N末端領域(220残基)においてVibrio mimicus arylesteraseと、またC末端領域(470残基)においてマウスのsialate9-O-acetylesteraseとそれぞれ25.5%および29.2%の相同性が認められた。またORF4は856アミノ酸残基をコードし得ると予測され、相同性検索の結果ヤギのβ-mannosidaseと29.2%の相同性を示した。以上よりnanH遺伝子下流には糖鎖分解に関与する遺伝子群がクラスターを形成している可能性が示唆された。

Bacteroides fragilis are frequently isolated from clinical specimens, and the fatal rate of hematotoxicity is high. The pathogenic factors of Bacteroides fragilis were examined in the downstream of nanH, and the existence of acid permiase and lyase genes was speculated. In this study, the relationship between the downstream of nanH gene and acid metabolism was investigated. The DNA fragment of the nanH gene contains about 5.4kb, and the downstream region of the nanH gene contains about 2.8kb. The pBluescript II KS+ DNA fragment contains about 5.4kb, and the nucleotide sequence is determined. A part of the downstream region is determined by the amplification of the inverse PCR product pT7 blue. The ORFs of 8 and 170bp DNA fragments in the downstream of nanH gene were interrupted at the 4 and 3′ sides. ORF1, ORF5 are shown as β-N-acetylhexaminidase from Porphyromonas gingivalis. ORF2 has a nucleotide sequence of 220 amino acids, and its platelet-activating factor acetylhydrolase Ib has a sununit and E.coli thioesterase I has an esterase identity of 29.0% to 30.6%. ORF3 contains 690 amino acid residues, Vibrio mimicus arylesterase in the N-terminal domain (220 residues), and sialate9-O-acetylesterase in the C-terminal domain (470 residues). ORF4 was identified by a 29.2% identity test for β-mannosidase. The above results indicate the possibility of formation of a genetic subgroup in relation to sugar lock decomposition.

项目成果

S.M.Shaheduzzaman et al.: "Genome analysis of Bacteroides by pulsed-field gel electrophoresis:Chromosome sizes and restriction patterns." DNA Research. 4. 19-25 (1997)

S.M.Shaheduzzaman 等人：“通过脉冲场凝胶电泳对拟杆菌进行基因组分析：染色体大小和限制性模式。”

H.Arimochi et al.: "Effect of intestional bacteria on formation of azoxymethane-induced aberrant crypt foci in the rat colon." Biochemical Biophysical Research Communications. 238. 753-757 (1997)

H.Arimochi 等人：“肠道细菌对氧化偶氮甲烷诱导的大鼠结肠异常隐窝病灶形成的影响。”

T.Kuhara et al.: "Hemolytic urenmic syndrome in a patient with Bacterides fragilis infection." The Journal of the Japanese Association for infectious Diseases. 72(2). 162-166 (1998)

T.Kuhara 等人：“脆弱拟杆菌感染患者的溶血性尿毒症综合征。”

T.Kinouchi et al.: "Culture supernatants of Lactobacihis acidophilus and Bindobacterium adolescentis repress ileal ulcer formation in rats treated with a nonsteroidal antinflammatory drug by suppressing unbalanced growth of aerobic bacteria and lipid pero

T.Kinouchi 等人：“在接受非甾体类抗炎药治疗的大鼠中，嗜酸乳杆菌和青少年结合杆菌的培养上清液通过抑制需氧菌和脂质过氧化物的不平衡生长来抑制回肠溃疡的形成。

H.Nakayama et al.: "Intestinal anacrobic bacteria hydrolyse sorivudine,producing the high blood concentration of 5-(E)0(2-bromoving)oracil that increases the level and tozicity of 5-fluorouracil" Pharmacogenetics. 7. 35-43 (1997)

H.Nakayama 等人：“肠道厌氧菌水解索立夫定，产生高血液浓度的 5-(E)0(2-溴代)oracil，从而增加 5-氟尿嘧啶的水平和毒性”药物遗传学。