Bacteroidesの表層抗原性を制御する部位特異的組換え酵素の同定

控制拟杆菌表面抗原性的位点特异性重组酶的鉴定

• 批准号: 17019050
• 负责人: 桑原 知巳
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17019050/
• 关键词: Bacteroides; DNA inversion; 遺伝子発現調節; 莢膜多糖; 外膜タンパク質; 表層抗原性; 病原性; 常在性

Bacteroides fragilisはヒト大腸に常在する偏性嫌気性グラム陰性桿菌である。本菌種のゲノム上には外膜蛋白質や莢膜多糖などの菌体表層構造の構築に関与する遺伝子群の発現をpromoter領域のDNA inversionによってon-off制御している領域が少なくとも31箇所存在する。本菌種の病原性に関与する莢膜多糖生合成領域の7領域とその他の7領域における遺伝子発現のon-off制御はMpiと呼ばれる一つの部位特異的組換え酵素によって行われているが、その他の領域のDNA inversionを制御する部位特異的組換え酵素遺伝子は同定されていない。本研究は、B.fragilisの多様な表層抗原性を生み出すゲノムシステムを理解するため、promoter領域のDNA inversionに関与する全ての部位特異的組換え酵素遺伝子群を同定することを目的としている。本研究において我々は、莢膜生合成遺伝子のpromoter領域のDNA inversionを制御する部位特異的組換え酵素遺伝子(BF2765)と近接して存在するClass IV領域のDNA inversionを制御する部位特異的組換え酵素遺伝子、BF2766を同定した。Class IV領域はB.fragilisのゲノムに2箇所存在するが、そのうちの1つに部位特異的組換え酵素遺伝子BF2766が近接している。B.fragilis YCH46株においてBF2766の欠損変異株を作成し、Class IV領域のDNA inversionの状態をPCRで確認した結果、BF2766の欠損変異株では2領域ともにpromoterの向きが1方向に固定されており、BF2766がclass IV領域のDNA inversionを制御する責任遺伝子であることを明らかにした。現在、B.fragilisのゲノムに存在する全ての部位特異的組換え酵素遺伝子を標的として遺伝子破壊株の作成を進めている。

Bacteroides fragilis ヒト the large intestine に is often found in する biased, anaerobic グラム negative bacilli である. On this species の ゲ ノ ム に は outer membrane protein や capsular polysaccharide な ど の bacteria surface structure の build に masato and す る heritage 伝 subgroup の 発 now を の DNA promoter field inversion に よ っ て on - off suppression し て い る domain が less な く と も existing 31 す る. This strain の pathogenicity に masato and す る capsular polysaccharide biosynthesis areas の 7 と そ の his の 7 field に お け る heritage 伝 son 発 の now on - off suppression は Mpi と shout ば れ る a つ の site specific group change え enzyme に よ っ て line わ れ て い る が, そ の の DNA he の field inversionを controls the する site-specific group exchange え enzyme progeny 伝 and <s:1> な な な. This study は, b. ragilis の others more な surface antigenicity を raw み out す ゲ ノ ム シ ス テ ム を understand す る た め, の DNA promoter field inversion に masato and す る full て の group in え enzyme of site specific 伝 subgroup を be す る こ と を purpose と し て い る. This study に お い て I 々 は, capsular biosynthesis heritage 伝 son の の DNA promoter field inversion を suppression す る group in え enzyme of site specific 伝 child (BF2765) と nearly meet し て exist す る の DNA Class IV field inversionを is used to control the する site-specific group exchange え enzyme progeny 伝, and BF2766を is used to determine <s:1> た. Class IV areas は b. ragilis の ゲ ノ ム に two existing す る が, そ の う ち の 1 つ に group in え enzyme of site specific 伝 son BF2766 が nearly meet し て い る. B.fragilis YCH46 strain にお て てBF2766 <s:1> underdamaged variant を was used to create <s:1>, Class IV domain <s:1> DNA Inversion の state を PCR で confirm し た results, BF2766 の owe loss - different strains で は 2 areas と も に promoter の to き が 1 direction に fixed さ れ て お り, BF2766 が の DNA class IV field inversionを is responsible for する, 伝, である, とを, ら, に and た. Now, b. ragilis の ゲ ノ ム に exist す る full て の group in え enzyme of site specific 伝 を son mark と し て heritage 伝 son broken 壊 strains の made を into め て い る.

项目成果

Rapid species identification an partial strain differentiation of Clostridium butyricum by PCR using 16S-23S rDNA intergenic spacer regions.

使用 16S-23S rDNA 基因间间隔区通过 PCR 快速鉴定丁酸梭菌的部分菌株分化。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Microbiol.Immunol. 49・7
• 作者: Masaki M.et al.;Arimochi H.et al.;Nakanishi S.et al.
• 通讯作者: Nakanishi S.et al.

Inhibitory effect of fluvastatin on ileal ulcer formation in rats induced by nonsteroidal anti-inflammatory drug.

氟伐他汀对非甾体类抗炎药所致大鼠回肠溃疡形成的抑制作用。

• 发表时间: 2005
• 期刊: World J.Gastroenterol. 11・7
• 作者: Masaki M.et al.;Arimochi H.et al.;Nakanishi S.et al.;Miki T.et al.;Bunpo P.et al.;Hagiwara M.et al.
• 通讯作者: Hagiwara M.et al.

Suppressive effect of Clostridium Perfringens-produced heat-stable substance(s) on proliferation of human colon adenocarcinoma HT29 cells in culture

• DOI: 10.1016/j.canlet.2005.10.016
• 发表时间: 2006-09-28
• 期刊: CANCER LETTERS
• 影响因子: 9.7
• 作者: Arimochi, Hideki;Morita, Kyoji;Ohnishi, Yoshinari
• 通讯作者: Ohnishi, Yoshinari

Simultaneous detection of Bacteroides fragilis group species by leuB-directed PCR.

通过 leuB 引导的 PCR 同时检测脆弱拟杆菌群。

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Med.Invest. 52・1-2
• 作者: Masaki M.et al.;Arimochi H.et al.;Nakanishi S.et al.;Miki T.et al.
• 通讯作者: Miki T.et al.

Inhibitory effects of asiatic acid and CPT-11 on growth of HT-29 cells

• DOI: 10.2152/jmi.52.65
• 发表时间: 2005-02-01
• 期刊: JOURNAL OF MEDICAL INVESTIGATION
• 影响因子: 0.7
• 作者: Bunpo, Piyawan;Kataoka, Keiko;Ohnishi, Yoshinari
• 通讯作者: Ohnishi, Yoshinari