Bacteroidesの多様な表層抗原性を生み出すゲノムシステムの解明

阐明产生拟杆菌多样化表面抗原性的基因组系统

• 批准号: 18018029
• 负责人: 桑原 知巳
• 金额: $ 4.93万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18018029/
• 关键词: Bacteroides; 表層抗原性; DNA逆位; Recominase; 莢膜多糖; 外膜蛋白質; 腸管; 定着; 遺伝子発現調節; 外膜空胞; 部位特異的組換え酵素; ネットワーク

ヒト大腸常在菌であるBacteroides fragilisのゲノム上に存在するinvertible領域のうち、Class I領域は莢膜多糖、II、III、IVおよびVI領域は外膜蛋白質の発現制御に関わっている。昨年度の研究においてClassIV領域のDNA inversionに関与するtyrosine recombinase遺伝子(BF2766)を同定し、この領域が本菌種におけるouter membrane vesicleの形成に関与することを明らかにした。本年度はClass II領域のDNA inversionを制御するrecombinase遺伝子を同定するため、候補遺伝子の破壊株を作成し、Class II領域のDNA inversionが消失する変異株を検索した。その結果、Class V領域の外膜蛋白質SusC/Dshufflon内部に存在するtyrosine recombinase遺伝子(BF0667)の変異株において、10箇所全てのClassII領域でのDNA inversionの消失もしくは逆位頻度の減少が認められた。この変異株にBF0667をプラスミドで相補するとClass II領域におけるDNA inversionが回復したことから、BF0667はグローバルにClass II領域のDNA inversionを制御するtyrosine recombinaseをコードしていると考えられた。さらにBF0667欠損変異株においては外膜蛋白質SusC/DshufflonであるClass VおよびVI領域においてもDNA inversionが消失していた。この結果、BF0667がClass II領域のみならず、他の2箇所の外膜蛋白質SusC/D sbufflonのDNA inversionをも包括的に制御しており、BF0667は配列認識特異性の低いユニークなsite-specificrecombinaseをコードしていると考えられた。さらに、BF0667の欠損変異株を野生株と1対1の菌数になるように混合後、無菌マウスに経口接種し、糞便内での残存率を比較した。その結果、BF0667欠損変異株の糞便内生菌数は野生株の約1%であり、BF0667によるこれら領域の発現制御が腸管への定着に重要な役割を果たしていると考えられる。

Coliform bacteria often exist in the invertible domain, Class I domain, capsular polysaccharide, II, III, IV and VI domain, which are related to the production and control of outer membrane proteins. The DNA inversion in Class IV domain is related to the identification of tyrosine recombinase gene (BF2766) and the formation of outer membrane vesicles in this domain. This year, the Class II domain DNA inversion was controlled, the recombinase gene was identified, the candidate gene was generated, and the Class II domain DNA inversion was eliminated. As a result, the presence of cytosine recombinase gene (BF0667) in the outer membrane protein SusC/Dshufflon of Class V domain was detected, and the disappearance of DNA inversion in Class II domain of 10 sites was detected. The BF0667 variant is complementary to the Class II domain DNA inversion control tyrosine recombinase. BF0667 is deficient in DNA inversion and is absent from the outer membrane protein SusC/Dshufflon. These results, BF 0667 for Class II domain detection, his two outer membrane protein SusC/D bufflon DNA inversion included in the control, BF0667 for recognition of low specificity of site-specific recombination In addition, the number of bacteria in the wild strain of BF0667 was compared with that in the mixture, the number of bacteria in the mouth and the survival rate in the feces. The number of fecal endophytes in BF0667 was about 1% of that in wild plants. The number of fecal endophytes in BF0667 was about 1% of that in wild plants.

项目成果

Bacteroides fragilisのsusC/D shufflonを制御するsite-specificrecombinaseの同定

脆弱拟杆菌中控制 susC/D 洗牌的位点特异性重组酶的鉴定

• 发表时间: 2007
• 作者: 今大路 治之;他
• 通讯作者: 他

発酵玄米の摂取が腸内菌叢及び腸内環境におよぼす影響.

发酵糙米摄入量对肠道菌群和肠道环境的影响。

• 发表时间: 2008
• 作者: 井形和枝;その他
• 通讯作者: その他

High-level fluoroquinolone resistance in ophthalmic clinical isolates belonging to the species Corynebacterium macginleyi

• DOI: 10.1128/jcm.01741-07
• 发表时间: 2008-02-01
• 期刊: JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY
• 影响因子: 9.4
• 作者: Eguchi, Hiroshi;Kuwahara, Tomomi;Shiota, Hiroshi
• 通讯作者: Shiota, Hiroshi

Modifying effects of fermented brown rice on fecal microbiota in rats

• DOI: 10.1016/j.anaerobe.2007.07.001
• 发表时间: 2007-10-01
• 期刊: ANAEROBE
• 影响因子: 2.3
• 作者: Kataoka, Keiko;Kibe, Ryoko;Ohnishi, Yoshinari
• 通讯作者: Ohnishi, Yoshinari

An improved DNA isolation method for metagenomics analysis of the microbial flora of the human intestine.

一种改进的 DNA 分离方法，用于人体肠道微生物菌群的宏基因组学分析。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Microbes Environ. 22
• 作者: Morita;H.;et. al.
• 通讯作者: et. al.