Bacteroidesの多様な表層抗原性を生み出すゲノムシステムの解明

阐明产生拟杆菌多样化表面抗原性的基因组系统

基本信息

批准号：
18018029
负责人：
桑原知巳
金额：
$ 4.93万
依托单位：
The University of Tokushima
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

ヒト大腸常在菌であるBacteroides fragilisのゲノム上に存在するinvertible領域のうち、Class I領域は莢膜多糖、II、III、IVおよびVI領域は外膜蛋白質の発現制御に関わっている。昨年度の研究においてClassIV領域のDNA inversionに関与するtyrosine recombinase遺伝子(BF2766)を同定し、この領域が本菌種におけるouter membrane vesicleの形成に関与することを明らかにした。本年度はClass II領域のDNA inversionを制御するrecombinase遺伝子を同定するため、候補遺伝子の破壊株を作成し、Class II領域のDNA inversionが消失する変異株を検索した。その結果、Class V領域の外膜蛋白質SusC/Dshufflon内部に存在するtyrosine recombinase遺伝子(BF0667)の変異株において、10箇所全てのClassII領域でのDNA inversionの消失もしくは逆位頻度の減少が認められた。この変異株にBF0667をプラスミドで相補するとClass II領域におけるDNA inversionが回復したことから、BF0667はグローバルにClass II領域のDNA inversionを制御するtyrosine recombinaseをコードしていると考えられた。さらにBF0667欠損変異株においては外膜蛋白質SusC/DshufflonであるClass VおよびVI領域においてもDNA inversionが消失していた。この結果、BF0667がClass II領域のみならず、他の2箇所の外膜蛋白質SusC/D sbufflonのDNA inversionをも包括的に制御しており、BF0667は配列認識特異性の低いユニークなsite-specificrecombinaseをコードしていると考えられた。さらに、BF0667の欠損変異株を野生株と1対1の菌数になるように混合後、無菌マウスに経口接種し、糞便内での残存率を比較した。その結果、BF0667欠損変異株の糞便内生菌数は野生株の約1%であり、BF0667によるこれら領域の発現制御が腸管への定着に重要な役割を果たしていると考えられる。

在人类结肠细菌的基因组中存在的可逆区域中，I类区域参与了囊囊多糖表达的调节，以及II，III，III，IV和VI区域参与外膜蛋白的调节。在去年的一项研究中，我们确定了参与IV类区域的DNA反转的酪氨酸重组酶基因（BF2766），并揭示了该区域与该物种中外膜的形成有关。在今年，为了确定控制II类区域DNA倒置的重组酶基因，我们造成了候选基因的破坏，并搜索了突变菌株II类区域DNA倒置消失的突变菌株。结果，在所有10类II类区域中，DNA反转的酪氨酸重组基因基因突变株（BF0667）（BF0667）（BF0667）（BF0667）的突变菌株中存在的DNA反转频率或反转频率降低。用该突变体补充BF0667质粒恢复了II类区域的DNA反转，而BF0667被认为编码酪氨酸重组酶，该酪氨酸重组酶在全球范围内调节II类区域的DNA倒置。此外，在BF0667缺陷型突变株中，DNA反转在V类和VI类区域，外膜外蛋白SUSC/DSHUFFLON中也丢失。结果，BF0667不仅对II类区域进行了全面调节，还可以在另外两个位置进行外膜蛋白SUSC/D SBUFFLON的DNA反转，而BF0667被认为编码具有低序列识别特异性的独特位点特异性组合酶。此外，将不足的BF0667突变体与野生应变混合以具有1：1细菌的计数，并将无菌小鼠进行口服接种，以比较粪便中的残留率。结果，BF0667缺陷型突变菌株中粪便细菌的数量约为野生菌株的1％，人们认为BF0667对这些区域的调节在肠道中的定殖中起着重要作用。

项目成果

期刊论文数量（13）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

An improved DNA isolation method for metagenomics analysis of the microbial flora of the human intestine.

一种改进的 DNA 分离方法，用于人体肠道微生物菌群的宏基因组学分析。

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
Microbes Environ. 22
影响因子：
0
作者：
Morita;H.;et. al.
通讯作者：
et. al.

Bcateroides fragilisにおける包括的作動性部位特異的組換え酵素による菌体表層構造の可変性

脆弱拟杆菌中全局作用的位点特异性重组酶引起的细胞表面结构的变异

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
今大路治之;他
通讯作者：
他

眼結膜由来のコリネバクテリウムにおけるフルオロキノロン耐性

眼结膜棒状杆菌对氟喹诺酮类药物的耐药性

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
桑原知巳;他
通讯作者：
他

Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbes.

比较宏基因组学揭示了人类肠道微生物中普遍富集的基因集。

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
DNA Res. 14
影响因子：
0
作者：
Kurokawa;K.;et. al.
通讯作者：
et. al.

Bcateroides fragilisのsusC/D shufflonにおける多重逆位を制御する部位特異的組換え酵素の同定

鉴定脆弱拟杆菌 susC/D 洗牌中控制多个倒位的位点特异性重组酶

DOI：
发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
0
作者：
今大路治之;他
通讯作者：
他

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