家族性聾原因遺伝子の解明

阐明导致家族性耳聋的基因

• 批准号: 09771377
• 负责人: 浅川 修一
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 1998
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09771377/
• 关键词: BAC; DFNB8; DFNB10; ポジショナルクローニング; 21番染色体特異的コスミド; 家族性ろう; ゲノムシーケンス; 聴覚障害; 21番染色体特異的コスミドライブラリー; APECED

21q22.3上には2種類の家族性聾原因遺伝子(DFNB8、DFNB10)がマップされている。我々は従来から21q22.3のマーカーMX1-D21S171間約3MbのBAC・コスミドコンティグの作成しゲノムシーケンシングを進めてきたが、本年もさらにシーケンスデータを蓄積し、新規遺伝子の探索や新たなマーカーの単離を進めた。従来この2遺伝子は同じ遺伝子の可能性もあると推測されていたが、我々の行ったゲノムシーケンスデータに基づく新たなマイクロサテライトマーカーを用いた連鎖解析によって、これらの遺伝子がマーカーLJ106を境にしてセントロメア側とテロメア側に分離される別個のものであることが分かった。また決定した塩基配列をもとに昨年と同じくGenBank、DDBJなどの塩基配列データベースに登録されている既知遺伝子、EST配列との照合を行い遺伝子と予想される配列のマッピングを行った。またエキソン予測ソフトGrail.GeneScan等を用いて遺伝子の予測を行った。これらは遺伝子の部分的な推定情報であるため、実際に発現していることを確認し、遺伝子構造を決定するため、ノーザン解析、cDNAスクリーニング、RT-PCR、RACE法をおこなった。このようにした明らかにした遺伝子の中でCyclic nucleotide phosphodiesterase gene(PDE9A)など新たな遺伝子を5個、既知cDNAに対応する遺伝子1個を発見した。現在それらの遺伝子と家族性聾との関連を調べている。

21q22.3 に に 2 types of familial deafness causes 伝 offspring (DFNB8, DFNB10)が ップされて る る. I 々 は 従 to か ら 21 q22. 3 の マ ー カ ー MX1 - about 3 MB の BAC, between D21S171 コ ス ミ ド コ ン テ ィ グ の made し ゲ ノ ム シ ー ケ ン シ ン グ を into め て き た が, this year も さ ら に シ ー ケ ン ス デ ー タ を accumulation し, new rules but 伝 の explore new た や な マ ー カ ー の 単 from を into め た. 従 to こ の 2 heritage 伝 son は with じ heritage 伝 son の possibility も あ る と speculation さ れ て い た が, I 々 の line っ た ゲ ノ ム シ ー ケ ン ス デ ー タ に base づ く new た な マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト マ ー カ ー を with い た chain analytic に よ っ て, こ れ ら の heritage 伝 son が マ ー カ ー LJ106 を condition に し て セ ン ト ロ メ ア side と テ ロ メ ア side さ に separation Youdaoplaceholder0 other れる である である である である とが とが った った. ま た decided し た salt base with column を も と に yesterday in と with じ く GenBank, DDBJ な ど の salt base with column デ ー タ ベ ー ス に login さ れ て い る both survived 伝 of children, EST match column と の do close を い heritage 伝 と son to think さ れ る match column の マ ッ ピ ン グ を line っ た. Youdaoplaceholder0 ソフト pre-test ソフトGrail.GeneScan et al. を used the 伝 て test 伝 sub-test った. こ れ ら は posthumous son 伝 の part of presumption な intelligence で あ る た め, be interstate に 発 now し て い る こ と を decision confirming し, but 伝 tectonic を す る た め, ノ ー ザ ン parsing, cDNA ス ク リ ー ニ ン グ, rt-pcr, RACE を お こ な っ た. こ の よ う に し た Ming ら か に し た heritage 伝 child の で Cyclic nucleotide phosphodiesterase gene (PDE9A) な ど new た な posthumous son 伝 を 5, both known cDNA に 応 seaborne す る heritage 伝 child 1 を 発 see し た. Now, the それら cultural heritage 伝 is related to と familial deafness と <e:1> and を tune べて る る る.

项目成果

K.Nagamine: "Genomic organization and complete nucleotide sequence of the human PWP2 gene on chromosome21" Genomics. 44. 528-531 (1997)

K.Nagamine：“21 号染色体上人类 PWP2 基因的基因组组织和完整核苷酸序列”基因组学。

Hattori N: "Point mutations(Thr240Arg and Ala311Stop)in the Parkin gene.." Biochem.Biophys.Res.Commun.62. 1515-1521 (1998)

Hattori N：“Parkin 基因中的点突变（Thr240Arg 和 Ala311Stop）..”Biochem.Biophys.Res.Commun.62。

浅川 修一: "慶應BACライブラリーを用いた疾患原因遺伝子の探索" 別冊・医学のあゆみ 神経細胞死制御. 139-144 (1998)

Shuichi Asakawa：“使用 Keio BAC 库寻找致病基因”单独卷：医学史：神经细胞死亡的控制 139-144（1998）。

浅川 修一: "BACライブラリーの作製とヒト遺伝子クローニングへの活用" 医学のあゆみ. 185. 831-835 (1998)

Shuichi Asakawa：“BAC 文库的创建及其在人类基因克隆中的应用”医学史 185. 831-835 (1998)。

K.Nagamine: "Posision cloning of the APECED gene" Nature Genet.17. 393-398 (1997)

K.Nagamine：“APECED 基因的定位克隆”Nature Genet.17。