躁鬱病原因遺伝子の探索
躁鬱病原因遺伝子の探索
批准号:
11770560
负责人:
浅川 修一
金额:
$1.54万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 2000
中文摘要
我々は21番染色体完全決定の一翼を担って34Mbのシーケンスを完成させ、コンピュータ解析により225個の遺伝子を発見した(Nature 405:311-319(2000))。躁鬱病の原因遺伝子がマップされている21q22.3上のマーカーMXI-D21S1259-D21S171間からはCBR1,HLCS,ETS2,MX1,CRYAA,PDXK,CSTB,NNP-1,TMEM1,PWP2,PFKLなど26個の既知遺伝子を同定した。またGRAILやGENESCANなどのプログラムを用いたエキソン予測とcDNAクローニングからCBR3,LPAAT,KNP1,KNP3/TRPC7,KNP5,AIRE,TMPRSS3など14個の新規遺伝子を同定しゲノム構造を決定した。これらの遺伝子のエキソンを増幅するPCRプライマーを作製し、21番染色体上にマップされている疾患の患者家系特異的な変異の検索を行った。その結果、躁鬱病と同様に21q22.3上にマップされていた家族性聴覚障害(DFNB8/10)の原因遺伝子TMPRSS3を特定することができた(Nature Genet.27:59-63(2001))。現在、躁鬱病についても引き続き患者特異的な変異の検索を進めている。またシーケンスデータから予測された遺伝子の存在を実験的に検定するのとともに、これまででコンピュータ解析で予測できなかった遺伝子の存在についても、比較ゲノム解析、実験によって検証を進め、同領域の遺伝カタログを完成させる予定である。新たに遺伝子が得られれば、それらについても患者特異的変異の検索を行い、躁鬱病原因遺伝子の特定を目指したい。
英文摘要
我々は21番染色体完全決定の一翼を担って34Mbのシーケンスを完成させ、コンピュータ解析により225個の遺伝子を発見した(Nature 405:311-319(2000))。躁鬱病の原因遺伝子がマップされている21q22.3上のマーカーMXI-D21S1259-D21S171間からはCBR1,HLCS,ETS2,MX1,CRYAA,PDXK,CSTB,NNP-1,TMEM1,PWP2,PFKLなど26個の既知遺伝子を同定した。またGRAILやGENESCANなどのプログラムを用いたエキソン予測とcDNAクローニングからCBR3,LPAAT,KNP1,KNP3/TRPC7,KNP5,AIRE,TMPRSS3など14個の新規遺伝子を同定しゲノム構造を決定した。これらの遺伝子のエキソンを増幅するPCRプライマーを作製し、21番染色体上にマップされている疾患の患者家系特異的な変異の検索を行った。その結果、躁鬱病と同様に21q22.3上にマップされていた家族性聴覚障害(DFNB8/10)の原因遺伝子TMPRSS3を特定することができた(Nature Genet.27:59-63(2001))。現在、躁鬱病についても引き続き患者特異的な変異の検索を進めている。またシーケンスデータから予測された遺伝子の存在を実験的に検定するのとともに、これまででコンピュータ解析で予測できなかった遺伝子の存在についても、比較ゲノム解析、実験によって検証を進め、同領域の遺伝カタログを完成させる予定である。新たに遺伝子が得られれば、それらについても患者特異的変異の検索を行い、躁鬱病原因遺伝子の特定を目指したい。
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International Human Genome Mapping Consortium: "A physical map of the human genome、"Nature. 409. 934-940 (2001)
国际人类基因组图谱联盟:“人类基因组的物理图谱”,《自然》,409. 934-940 (2001)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Suzuki K.: "Construction and evaluation of a porcine bacterial artificial library"Anim. Genet.. 31. 8-12 (2000)
铃木K.:“猪细菌人工文库的构建和评估”动画。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Ozaki H.: "Structure and chromosome mapping of the human SIX 4 and murine Six 4 genes"Cytogenet.Cell Genet.. 87. 108-112 (1999)
Ozaki H.:“人类 SIX 4 和鼠类 6 4 基因的结构和染色体图谱”Cytogenet.Cell Genet.. 87. 108-112 (1999)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Yamauchi T.: "Assignment of the human poly(A) polymerase (PAP) gene to chromosome 14q32.1-q32.2 and isolation of a polymorphic CA repeat sequence"J.Hum.Genet.. 44. 253-255 (1999)
Yamauchi T.:“将人类聚腺苷酸聚合酶(PAP)基因分配给染色体 14q32.1-q32.2 并分离多态性 CA 重复序列”J.Hum.Genet.. 44. 253-255 (1999
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Scott HS et al.: "Insertion of beta-satellite repeats identifies a transmembrane protease causing both congenital and childhood onset autosomal recessive deafness."Nature Genetics. 27. 59-63 (2001)
Scott HS 等人:“β-卫星重复序列的插入识别出一种跨膜蛋白酶,可导致先天性和儿童期发病的常染色体隐性耳聋。”《自然遗传学》。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
共 10 条
デジタルゲノムマッピング法の確立と新規ゲノム解析への応用
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批准号:23H00342
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$30.28万
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财政年份:2023
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负责人:浅川 修一
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依托单位:
Elucidation of the function of piRNAs ubiquitously expressed in mollusks
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批准号:20F20395
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2020
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负责人:浅川 修一
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依托单位:
Generation of a high-resolution genome map using haploid and hybrid organisms and its application to genetic analysis
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批准号:20H00429
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$29.12万
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财政年份:2020
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负责人:浅川 修一
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依托单位:
Elucidation of molecular mechanism of indeterminate growth of skeletal muscle in fish
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批准号:18F18389
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2018
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负责人:浅川 修一
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依托单位:
ヒトBACライブラリーを用いた脳神経系疾患原因遺伝子の探索
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批准号:10176231
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1998
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负责人:浅川 修一
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依托单位:
脳神経特異的に発現される遺伝子の探索と機能解析
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批准号:09280232
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1997
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负责人:浅川 修一
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依托单位:
家族性聾原因遺伝子の解明
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批准号:09771377
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:浅川 修一
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依托单位:
遺伝性自己免疫疾患関連遺伝子のポジショナルクローニング
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批准号:08770331
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:浅川 修一
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依托单位:
ダウン症関連遺伝子の網羅的同定を目指した実験系の確立と候補遺伝子の単離
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批准号:07770924
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.7万
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财政年份:1995
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负责人:浅川 修一
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依托单位: