光回復酵素と損傷DNAの複合体のX線結晶解析

光活化酶与受损 DNA 复合物的 X 射线晶体分析

• 批准号: 10780409
• 负责人: 北所 健悟
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 1999
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-10780409/
• 关键词: 構造生物学; 結晶化; X線構造解析; 光回復酵素; 損傷DNA

ラン色細菌の光回復酵素とチミン二量体を含んだDNAオリゴマー分子(13塩基対)との共存下、この両者の複合体の結晶化条件を検討した。電気泳動の手法を用いて光回復酵素とDNAオリゴマー分子の結合していることを確認した結果、その混合比が酵素:DNA=1:1.5の条件で溶液を混合した後、沈殿剤として硫酸アンモニウムを用いた場合に針状の単結晶が得られた。この結晶を用いて得られた高エネルギー加速器研究機構でX線回折データを使って構造解析した。その結果、光回復酵素と損傷DNAオリゴマーの複合体の結晶学的データは空間群並びに格子定数DNA分子を含まない光回復酵素のみのデータと非常に良く似ていた。構造解析の結果、補酵素の近傍にDNA分子とみられる電子密度が見られることがわかった。現在この解析を続けているが、DNA分子のつながりが悪く一部分しか観察できていない状況である。格子定数などのNative結晶との同一性からも考えあわせると、この条件下では光回復酵素とDNA分子の正確な結合様式を確認できないと考えられる。

The crystallization conditions of the complex of the photoreverser and the photoreverser containing the DNA molecule (13) were investigated. The method of electromigration is to combine the enzyme with DNA and confirm the result. The mixture ratio of enzyme and DNA is 1:1.5. The solution is mixed and the solution is precipitated. The X-ray diffraction pattern of the X-ray diffraction pattern is analyzed by the X-ray diffraction pattern of the X-ray diffraction pattern. The result is that the DNA molecule contains photorevertase, which is very similar to that of the crystallographic complex of photorevertase. The results of structural analysis, complement enzymes and nearby DNA molecules are as follows: Now the analysis of DNA molecules is part of the investigation. The number of cells is determined by the identity of the Native crystal. Under these conditions, the correct binding formula of the photorevertase DNA molecule is confirmed.

项目成果

Kengo Kitadokoro: "Crystal Structure of Cyanobacterial Photolyase at 1.8Å resolution." PHOTON FACTORY ACTIVITY REPORT. 15. 37 (1998)

Kengo Kitadokoro：“1.8Å 分辨率下的蓝藻光解酶的晶体结构。” 15. 37 (1998)

北所健悟: "光回復酵素の結晶構造と補欠分子認識機構" 日本結晶学会誌. 40. 322-328 (1998)

Kengo Kitasho：“光活化酶的晶体结构和假体分子识别机制”日本晶体学会杂志 40. 322-328 (1998)。

北所健悟: "ラン色細菌由来DNA光回復酵素の立体構造" 構造生物. vol4,2. 14-18 (1998)

Kengo Kitasho：“源自兰花细菌的 DNA 光活化酶的 3D 结构”《结构生物学》第 4 卷，2 期（1998 年）。