ラン薬由来の新規なプラストシアニンのX線構造解析および分子進化に関する研究
ラン薬由来の新規なプラストシアニンのX線構造解析および分子進化に関する研究
批准号:
11780495
负责人:
井上 豪
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 2000
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英文摘要
ラン藻Synechococcus sp.PCC7942由来の光合成電子伝達蛋白質であるプラストシアニン(PC)の酸化体および還元体のX線構造解析をそれぞれ1.9Å分解能、1.8Å分解能で行った。通常PCは、高等植物では99残基、緑藻類では97残基で、そのアミノ酸総数が保存されている。平成11年度に論文報告を行ったシダ植物由来のPCでは102残基で、これまで発見されている高等植物由来のPC中では最長であったが、本研究課題で取り組んだPCは、その逆で、これまで発見された中では最も短い91残基で構成される。蛋白質レベルでは発見されず、その存在は遺伝子から見つけられた。もう1つの特徴として、電子伝達のパ-トナーの認識部位と考えられている酸性を帯びた結合部位の構造を持たない。本研究では、新規なラン藻由来PCを大腸菌を使って大量発現させ、結晶化と構造解析を行ったものである。解析の結果、アミノ酸の相同性が極めて低いにも関わらず、全体構造は類似していた。電子伝達の入り口と考えられているTyr83の芳香環の上にAgr88が覆い被さり、π-πスタッキング相互作用が見られた。pH5.0で結晶が得られたが、その酸化体と還元体のX線構造の平均の構造のずれが0.08Åと小さいにも関わらず、His配位子が0.36Åもずれたり、銅イオンから約12A離れたArg88が0.42Åずれていた。銅から遠隔の場所で微細ではあるが有意な構造変化が得られ、電子伝達の窓口であるTyr83の役割が重要であり、分子進化によって失われることなく
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Y.Kai et al.: "Three-Dimensional Structure of Phosphoenolphruvate Carboxylase: A Proposed Novel Mechanism for Allosteric Inhibition"Proc. Natl. Acad. Sci. USA,. 96,. 823-828 (1999)
Y.Kai 等人:“磷酸烯醇酸羧化酶的三维结构:一种提议的变构抑制新机制”Proc。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
H.Sugawara et al.: "Cryatal Structure of Wild-type and Mutant Plastocyanins from Higher Plant Silene"J. Biochem.,. 125,. 899-903 (1999)
H.Sukawara 等:“来自高等植物 Silene 的野生型和突变型质体蓝素的晶体结构”J。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
T.Kohzuma et al.: "The Structure and Unusual pH-dependence of Pastocyanin from Fern Drypeteris crassirhizoma: the Protonation of an Active-Site Histidine is Hindered by p-p interactions"J. Biol. Chem.,. 274,. 11817-11823 (1999)
T.Kohzuma 等人:“来自 Fern Drypeteris crassirhizoma 的 Pastocyanin 的结构和异常 pH 依赖性:活性位点组氨酸的质子化受到 p-p 相互作用的阻碍”J.
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
H.Hishimoto et al.: "Crystallographic Studies on a Family B DNA Polymerase from Hyperthermophilic Archaeon Pyrococcus kodakaraensis Strain KOD1"J. Biochem.,. 125,. 983-986 (1999)
H.Hishimoto 等人:“来自超嗜热古菌火球菌 kodakaraensis 菌株 KOD1 的 B 族 DNA 聚合酶的晶体学研究”J。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
H.Matsumura et al.: "Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of C4-form phosphoenolpyruvate carboxylase from maize"Acta Cryst.,. 55,. 1937-1938 (1999)
H.Matsumura 等人:“来自玉米的 C4 型磷酸烯醇丙酮酸羧化酶的结晶和初步 X 射线衍射研究”Acta Cryst.,。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 16 条
クライオ電顕を用いた時分割構造解析による破傷風毒素の膜侵入機構解明
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批准号:23K23821
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$3.99万
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财政年份:2024
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负责人:井上 豪
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依托单位:
クライオ電顕を用いた時分割構造解析による破傷風毒素の膜侵入機構解明
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批准号:22H02557
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.98万
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财政年份:2022
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负责人:井上 豪
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依托单位:
Molecular Design of Streptavidin Mutant with specificity for artificial biotin derivatives
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批准号:18F18765
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2018
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负责人:井上 豪
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依托单位:
超原子価硫黄原子を有する超分子複合体蛋白質による過酸化水素還元反応の制御機構解明
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批准号:18054019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.39万
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财政年份:2006
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负责人:井上 豪
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依托单位:
2008年に大阪で開催される第21回国際結晶学連合会議の学術プログラムの素案策定
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批准号:18637002
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.79万
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财政年份:2006
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负责人:井上 豪
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依托单位:
電子伝達蛋白質と超分子複合体を形成する亜硝酸還元酵素の構造と分子進化に関する研究
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批准号:16710156
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2004
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负责人:井上 豪
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依托单位:
寄生虫由来プロスタグランジンF合成酵素の阻害剤開発とその作用機構の解明
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批准号:16017260
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.01万
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财政年份:2004
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负责人:井上 豪
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依托单位:
ズッキーニ由来新規ブルー銅蛋白質マビシアニンのX線構造解析と分子進化に関する研究
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批准号:13780556
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2001
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负责人:井上 豪
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依托单位:
耐pH高活性を備えた新種のプラストシアニンのX線結晶構造解析と構造機能相関
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批准号:09780632
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:井上 豪
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依托单位:
X線構造解析の手法を用いた脳特異的カルシウム受容タンパク質S100の構造機能相関
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批准号:09249212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1997
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负责人:井上 豪
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依托单位:
X線構造解析の手法を用いた脳特異的カルシウム受容タンパク質S100の構造と機能相関
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批准号:08260211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:井上 豪
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依托单位:
X線構造解析の手法を用いた脳特異的カルシウム受容タンパク質S100の構造と機能相関
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批准号:08260211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:井上 豪
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依托单位:
脱窒細菌の産出する新種のアズリンのX線構造解析と生体内電子伝達機構の解明
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批准号:07780572
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1995
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负责人:井上 豪
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依托单位: