ズッキーニ由来新規ブルー銅蛋白質マビシアニンのX線構造解析と分子進化に関する研究
ズッキーニ由来新規ブルー銅蛋白質マビシアニンのX線構造解析と分子進化に関する研究
批准号:
13780556
负责人:
井上 豪
金额:
$1.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2002
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英文摘要
マビシアニンは、ズッキーニの皮から単離される糖蛋白質で、活性中心に銅イオンをもつブルー銅蛋白質である。他のフィトシアニンファミリーに属するステラシアニンやBasic Blue Proteinと比べ、アミノ酸残基の数と相同性に大きな違いがあり、分子進化的にも興味がある。本研究では、スペクトル等の機能と配位構造との相互の関係、他のブルー銅蛋白質との構造比較、および分子進化に関する知見を得るために、新規なブルー銅蛋白質であるマビシアニンの高分解能のX線構造解析を目指して、結晶化から着手し、運良く結晶が得られたSubmitted to Acta Cyrst. Sect D.)これまで、再現性の良い結晶化方法を確立し(空間群P6_1,a= b= 62.78Å,c=243.78Å)、大型放射光実験施設SPring-8において、低温下、銅イオンの異常分散効果を利用したMADデータの収集を行った。ピーク(1.379Å)、エッジ(1.380Å)、リモート1(1.393Å)、リモート2(1.305Å)でのデータ収集を、それぞれ2.0Å分解能まで収集することに成功した。異常分散差パターソンの計算およびその解釈にも成功し、位相の確からしさを示すFigure-of-meritの値も0.565と比較的高い値を示し、良好な電子密度を得ることに成功した。分子モデルの構築を行い、酸化体については、1.6Å分解能までの構造精密化を終えている。還元体結晶についても結晶を調整し、大型放射光実験施設SPring-8において1.9Å分解能までのデータ収集を行い、現在構造の精密化を進めている。今後は、還元体構造についての構造精密化を行い、両者の構造の比較を行って、酸化還元にともなう構造変化について検討する。またステラシアニンとの構造比較を行って、酸化還元電位の違い、スペクトルの違い等について構造化学的に検討を加え、論文発表を行う予定である。
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Matsumura, H., et al.: "Crystal Structure of C4 Form Maize and Quaternary Complex of E. coli Phosphoenolpyruvate Carboxylases"Structure. 10. 1721-1730 (2002)
Matsumura,H.,等人:“C4 型玉米和大肠杆菌磷酸烯醇丙酮酸羧化酶的季复合物的晶体结构”结构。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
H.Hashimoto, et al.: "Crystal structure of DNA polymerase from hyperthermophilic archaeon Pyrococcus Kodakaraensis KOD1"J. Mol. Biol.. 306. 469-477 (2001)
H.Hashimoto 等人:“来自超嗜热古菌 Pyrococcus Kodakaraensis KOD1 的 DNA 聚合酶的晶体结构”J.
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Okano, Y., et al.: "X-ray structure of Galdieria Rubisco complexed with one sulfate ion per active site"FEBS Letters. 572. 33-36 (2002)
Okano, Y. 等人:“每个活性位点与一个硫酸根离子复合的 Galdieria Rubisco 的 X 射线结构”FEBS Letters。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
E.Mizohata, et al.: "Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of glutathione-dependent dehydroascorbate reductase from spinach chloroplasts."Acta Cryst.. D57. 1726-1728 (2001)
E.Mizohata 等人:“菠菜叶绿体中谷胱甘肽依赖性脱氢抗坏血酸还原酶的结晶和初步 X 射线衍射分析。”Acta Cryst.. D57。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Yamamoto, T., et al.: "Crystallization and preliminary X-ray analysis of TBP-interacting protein from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis strain KOD1"Acta Cryst.. D59. 372-374 (2003)
Yamamoto, T. 等人:“来自超嗜热古菌 Thermococcus kodakaraensis KOD1 菌株的 TBP 相互作用蛋白的结晶和初步 X 射线分析”Acta Cryst.. D59。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 9 条
クライオ電顕を用いた時分割構造解析による破傷風毒素の膜侵入機構解明
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批准号:23K23821
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$3.99万
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财政年份:2024
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负责人:井上 豪
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依托单位:
クライオ電顕を用いた時分割構造解析による破傷風毒素の膜侵入機構解明
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批准号:22H02557
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.98万
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财政年份:2022
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负责人:井上 豪
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依托单位:
Molecular Design of Streptavidin Mutant with specificity for artificial biotin derivatives
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批准号:18F18765
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2018
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负责人:井上 豪
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依托单位:
2008年に大阪で開催される第21回国際結晶学連合会議の学術プログラムの素案策定
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批准号:18637002
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.79万
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财政年份:2006
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负责人:井上 豪
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依托单位:
超原子価硫黄原子を有する超分子複合体蛋白質による過酸化水素還元反応の制御機構解明
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批准号:18054019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.39万
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财政年份:2006
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负责人:井上 豪
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依托单位:
電子伝達蛋白質と超分子複合体を形成する亜硝酸還元酵素の構造と分子進化に関する研究
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批准号:16710156
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2004
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负责人:井上 豪
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依托单位:
寄生虫由来プロスタグランジンF合成酵素の阻害剤開発とその作用機構の解明
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批准号:16017260
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.01万
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财政年份:2004
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负责人:井上 豪
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依托单位:
ラン薬由来の新規なプラストシアニンのX線構造解析および分子進化に関する研究
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批准号:11780495
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:井上 豪
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依托单位:
耐pH高活性を備えた新種のプラストシアニンのX線結晶構造解析と構造機能相関
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批准号:09780632
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:井上 豪
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依托单位:
X線構造解析の手法を用いた脳特異的カルシウム受容タンパク質S100の構造機能相関
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批准号:09249212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1997
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负责人:井上 豪
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依托单位:
X線構造解析の手法を用いた脳特異的カルシウム受容タンパク質S100の構造と機能相関
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批准号:08260211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:井上 豪
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依托单位:
X線構造解析の手法を用いた脳特異的カルシウム受容タンパク質S100の構造と機能相関
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批准号:08260211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:井上 豪
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依托单位:
脱窒細菌の産出する新種のアズリンのX線構造解析と生体内電子伝達機構の解明
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批准号:07780572
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1995
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负责人:井上 豪
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依托单位:
海外基金