(DNAプール)PLACE-SSCP法による自己免疫疾患の病因遺伝子の網羅的探索

(DNA pool)利用PLACE-SSCP方法全面寻找自身免疫性疾病的致病基因

• 批准号: 15012238
• 负责人: 堀内 孝彦
• 金额: $ 4.54万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15012238/
• 关键词: 遺伝子解析; 一塩基多型(SNP); 全身性エリテマトーデス

今年度は40個の遺伝子を第一次の病因遺伝子スクリーニングの対象として選択した。それぞれの遺伝子のすべてのエクソンについて特異的に増幅させうるプライマーをイントロン部位に作成した。またプロモーター領域と考えられる部分についても増幅できるプライマーを作成した。全身性エリテマトーデス(SLE)患者11名、健常人1名について、PLACE-SSCP、塩基配列決定を行い、SNP同定を進めた。40個の遺伝子のうち29遺伝子についてプロモーター、エクソンの全領域の解析を終了した。合計150個のSNPを同定した。内訳はプロモーター領域52個、翻訳領域31個うちアミノ酸の変化を伴うもの10個、非翻訳領域45個、イントロン領域22個であった。残りの11個の遺伝子についても解析を進めている。今後、多数のSLE患者ならびに健常人について、DNAをプールしてPLACE-SSCPを行い、SNPの頻度を明らかにするとともに、有意に差があるものを探索する。以上が終了すれば、さらに第二次のスクリーニングとしてさらに対象遺伝子を選定して、同様の解析を進める。また機能解析についても、アミノ酸が変化したものについて順次解析を進める予定である。我々が開発した(DNAプール)PLACE-SSCP法は、SNPの頻度を一度に数百人の単位で正確かつ迅速に解析できる方法であり、高度に自動化されたものである(Am.J.Hum.Genet.2001)。この方法を用いることにより、極めて効率よくSNPの頻度を決定することが可能となった。大規模にSNP頻度を解析できる独自のシステムを有していることは、他のグループにない特徴である。なお、すでに我々は、従来の遺伝子解析システムを用いて、いくつかのSLEの病因となりうる遺伝子異常を明らかにしてきたが、これらの成果は世界的な水準にあると考えられる。

For the first time this year, 40 genes were identified. All kinds of products are produced in different parts of the world. The domain of the game is the domain of the game, and the game is the domain of the game. There were 11 systemic SLE patients and 1 healthy person. PLACE-SSCP and SNP alignment determination were carried out and SNP determination was advanced. The analysis of 40 pieces of information and 29 pieces of information has been completed. A total of 150 SNPs were identified. 52 in the internal domain, 31 in the reverse domain, 10 in the non-reverse domain, and 22 in the reverse domain. The remaining 11 pieces of information are analyzed and processed. In the future, most SLE patients will not be able to detect the presence of DNA in healthy individuals, and the frequency of SNPs will be explored. The above is the second time to select and analyze the image. The function analysis is performed in sequence. The PLACE-SSCP method is highly automated and rapid in the detection of SNPs, with frequencies ranging from one degree to hundreds of individuals per locus (Am.J.Hum.Genet.2001). This method is used to determine the frequency of SNPs. Large scale SNP frequency analysis is based on the characteristics of individual SNP clusters. Since the genetic analysis system has been used in the past, the cause of SLE and genetic abnormalities have been clarified, and the results are at a world-class level.

项目成果

Mitoma H, Horiuchi T, et al.: "Binding activities of infliximab and etanercept to transmembrane tumor necrosis factor-α"Gastroenterology. 126. 934-935 (2004)

Mitoma H、Horiuchi T 等人：“英夫利昔单抗和依那西普与跨膜肿瘤坏死因子-α 的结合活性”胃肠病学 126. 934-935 (2004)。

Harashima S, Tsukamoto H, et al.: "Osteoprotegerin and receptor activator of nuclear factor kBligand expression in fibroblast-like synoviocytes from RA and OA patients"Rheumatology. 43. 396-397 (2004)

Harashima S、Tsukamoto H 等人：“骨保护素和核因子 kBligand 受体激活剂在 RA 和 OA 患者的成纤维样滑膜细胞中的表达”风湿病学。

Koyama T, Tsukamoto H, et al.: "Novel polymorphism of the human APRIL gene is associated with systemic lupus erythematosus"Rheumatology. 42. 980-985 (2003)

Koyama T、Tsukamoto H 等人：“人类 APRIL 基因的新多态性与系统性红斑狼疮相关”风湿病学。

Harashima S, Tsukamoto H, et al.: "Successful treatment of invasive pulmonary aspergillosis by transbronchial injection of urinary trypsin inhibitor and amphotericin B"Acta Haematol. 109. 156-157 (2003)

Harashima S、Tsukamoto H 等人：“通过经支气管注射尿胰蛋白酶抑制剂和两性霉素 B 成功治疗侵袭性肺曲霉病”Acta Haematol。

Sawabe T, Horiuchi T, et al.: "Aberrant HS-1 molecule in a patient with systemic lupus erythematosus"Genes Immun.. 4. 123-131 (2003)

Sawabe T、Horiuchi T 等：“系统性红斑狼疮患者中的异常 HS-1 分子”Genes Immun.. 4. 123-131 (2003)