(DNAプール)PLACE‐SSCP法による自己免疫疾患の病因遺伝子の網羅的探索

(DNA pool)利用PLACE-SSCP方法全面寻找自身免疫性疾病的致病基因

• 批准号: 16012247
• 负责人: 堀内 孝彦
• 金额: $ 3.84万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16012247/
• 关键词: 遺伝子解析; 一塩基多型; 全身性エリテマトーデス

本研究の目的は、我々が開発した新しい解析システム(DNAプール)PLACE-SSCP法を用いて、自己免疫疾患の病因遺伝子を明らかにすることにより、病態解明を行い、最終的にはその知見を疾患特異的な治療法開発、難治病態の効果的な制御へと応用することにある。(DNAプール)PLACE-SSCP法は、数百人規模の検体について、一気に、迅速かつ正確なアレル頻度の解析が可能であり、多数の疾患候補遺伝子について、網羅的な疾患関連解析を行う本研究の目的に適している。合計61個の遺伝子についてその全エクソン領域ならびにプロモーター領域について、プライマーの設定を行った。SLE患者11名、健常人1名についてPLACE-SSCP法、塩基配列決定を行ってSNP同定を進めた。なお61遺伝子のうち8遺伝子は、SSCPパターンなどから、SNPの同定、解析が困難であった。残りの53遺伝子について1056STSを作成し、その解析をすべて終了した。これらの遺伝子の全エクソン、プロモーター領域の中に合計314のポリモルフィズムを同定した。ほとんどが、SNPであったが、うち15はins/delであった。エクソンの解析に際しては、隣接するイントロン部にプライマーを設定しているため、一部イントロンも解析している。53遺伝子に同定したSNP(ごく一部ins/delを含む)は、プロモーター領域に103個、5'UTRに19個、翻訳領域に72個、3'UTRに54個、イントロンに66個で合計314個であった。このうちの約半数が、dbSNPに登録のない新規のSNPであった。SLE患者264名(女性95%)、対照269名(女性100%)について、それぞれDNAをプールしてPLACE-SSCP法で解析し、314SNPすべてのアレル頻度を決定して、疾患との関連を検討した。いくつかのSNPについて有意な疾患との関連を見い出した。

The purpose of this study is to develop new methods for analyzing the pathogenesis of immune disorders, to identify the etiology of immune disorders, to identify the pathogenesis of immune disorders, to develop new methods for the treatment of disease-specific diseases, and to prevent and treat the effects of refractory diseases. (DNA PLACE-SSCP method is suitable for the analysis of disease association among hundreds of samples, one sample, one sample, Total 61 entries are included in the list. 11 SLE patients and 1 healthy person were selected by PLACE-SSCP method and SNP identification.なお61遗伝子のうち8遗伝子は、SSCPパターンなどから、SNPの同定、解析が困难であった。The 53-bit code is 1056 STS, and the analysis is complete. The total of 314 files in the field of mobile phones are fixed at the same time.ほとんどが、SNPであったが、うち15はins/delであった。The analysis of the software is based on the setting of the adjacent software component. 53 SNPs were identified in the same domain, 103 in the 5'UTR domain, 72 in the 5'UTR domain, 54 in the 3'UTR domain, and 66 in the 3'UTR domain. About half of the new SNP entries were made. Among 264 SLE patients (95% female), 269 (100% female) were analyzed by DNA sequencing and PLACE SSCP, 314 SNPs were analyzed by DNA sequencing and the frequency of SLE was determined. There is no doubt that the SNPs are related to intentional diseases.

项目成果

OPGand RANKL expression in the fibroblast-like synoviocytes from RA and OA patients

RA和OA患者成纤维样滑膜细胞中OPG和RANKL的表达

• 发表时间: 2004
• 期刊: Rheumatology(Oxford) 43
• 作者: Harashima S;Horiuchi T;et al.
• 通讯作者: et al.

Remission of hepatitis B virus-related vasculitis with lamivudine

拉米夫定缓解乙型肝炎病毒相关血管炎

• 发表时间: 2004
• 期刊: Ann.Intern.Med. 140
• 作者: Sawabe T;Uenotsuchi T;et al.
• 通讯作者: et al.

Association of a four-amino-acid-residue-insertion polymorphism of the HS1 gene with systemic lupus erythematosus

HS1基因的四个氨基酸残基插入多态性与系统性红斑狼疮的关联

• 发表时间: 2004
• 期刊: Arthritis Rheum. 50
• 作者: Otsuka J;Horiuchi T;et al.
• 通讯作者: et al.

Novel mutations in TNFRSF1A in patients with typical tumor necrosis factor receptor-associated periodic syndrome and with SLE

典型肿瘤坏死因子受体相关周期性综合征和 SLE 患者中 TNFRSF1A 的新突变

• 发表时间: 2004
• 期刊: Int.J.Mol.Med. 14
• 作者: Horiuchi T;Tsukamoto H;et al.
• 通讯作者: et al.

Binding activities of infliximab and etanercept to transmembrane TNF-α

英夫利昔单抗和依那西普与跨膜 TNF-α 的结合活性

• 发表时间: 2004
• 期刊: Gastroenterology 126
• 作者: Mitoma H;Horiuchi T;et al.
• 通讯作者: et al.