フザリウム病原菌の分生胞子形成時における発現遺伝子群のカタログ化
フザリウム病原菌の分生胞子形成時における発現遺伝子群のカタログ化
批准号:
16658019
负责人:
柘植 尚志
金额:
$2.37万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 --
中文摘要
土壌伝染性糸状菌Fusarium oxysporumは、小型胞子、大型胞子および厚膜胞子の3種の分生(無性)胞子を形成し、これらが自然界での伝染源、耐久生存器官として重要な機能を果たしている。本菌は、栄養豊富な完全培地では胞子を形成しないが、カルボキシメチルセルロース(CMC)を唯一の炭素源とする培地では、ほとんど菌糸生育せず、小型胞子と大型胞子を大量に形成する。本研究では、両培養条件下でのEST(expressed sequence tag)解析に基づき、胞子形成時特異的な遺伝子群を同定するとともに、それら遺伝子の胞子形成変異株における発現解析によって、発現遺伝子群のカタログ化を行った。研究成果の概要は以下のとおりである。1.完全培地培養時とCMC培地培養時のEST解析によって、それぞれ約540個の異なる遺伝子由来のcDNAクローンを同定した。データベース相同性解析によってこれらクローンを推定機能別に分類したところ、半数以上が機能未知の新規遺伝子であることが明らかとなった。さらに、両ライブラリーを比較したところ、共通なクローンは約20%であり、栄養成長時と胞子形成時の発現遺伝子群が顕著に異なることが明らかとなった。2.リアルタイムRT-PCR法によって、CMC培地培養時に特異的に高発現する173クローンを選抜した。さらに、これらクローンについて、胞子形成に関与する2つの転写制御遺伝子(REN1およびFoSTUA)の変異株における発現を野生株と比較解析し、両遺伝子が発現制御する遺伝子群を同定した。以上の結果に基づき、胞子形成時の発現遺伝子群をそれらの推定機能、栄養成長時と胞子形成時の発現レベル、REN1またはFoSTUAによる制御の有無などの項目についてカタログ化した。
英文摘要
土壌伝染性糸状菌Fusarium oxysporumは、小型胞子、大型胞子および厚膜胞子の3種の分生(無性)胞子を形成し、これらが自然界での伝染源、耐久生存器官として重要な機能を果たしている。本菌は、栄養豊富な完全培地では胞子を形成しないが、カルボキシメチルセルロース(CMC)を唯一の炭素源とする培地では、ほとんど菌糸生育せず、小型胞子と大型胞子を大量に形成する。本研究では、両培養条件下でのEST(expressed sequence tag)解析に基づき、胞子形成時特異的な遺伝子群を同定するとともに、それら遺伝子の胞子形成変異株における発現解析によって、発現遺伝子群のカタログ化を行った。研究成果の概要は以下のとおりである。1.完全培地培養時とCMC培地培養時のEST解析によって、それぞれ約540個の異なる遺伝子由来のcDNAクローンを同定した。データベース相同性解析によってこれらクローンを推定機能別に分類したところ、半数以上が機能未知の新規遺伝子であることが明らかとなった。さらに、両ライブラリーを比較したところ、共通なクローンは約20%であり、栄養成長時と胞子形成時の発現遺伝子群が顕著に異なることが明らかとなった。2.リアルタイムRT-PCR法によって、CMC培地培養時に特異的に高発現する173クローンを選抜した。さらに、これらクローンについて、胞子形成に関与する2つの転写制御遺伝子(REN1およびFoSTUA)の変異株における発現を野生株と比較解析し、両遺伝子が発現制御する遺伝子群を同定した。以上の結果に基づき、胞子形成時の発現遺伝子群をそれらの推定機能、栄養成長時と胞子形成時の発現レベル、REN1またはFoSTUAによる制御の有無などの項目についてカタログ化した。
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会议论文
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DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Matsumoto, S., K.Kitahara, H.Komatsu, K.Abe, K.Tsutsui, D.X.Li et al., Yasukouchi A, K.Ukena et al., 柘植尚志]
通讯作者:
柘植尚志
DOI:
10.1534/genetics.166.1.113
发表时间:
2004-01-01
期刊:
GENETICS
影响因子:
3.3
作者:
[Ohara, T, Inoue, I, Tsuge, T]
通讯作者:
Tsuge, T
DOI:
10.1128/ec.3.6.1412-1422.2004
发表时间:
2004-12-01
期刊:
EUKARYOTIC CELL
影响因子:
--
作者:
[Ohara, T, Tsuge, T]
通讯作者:
Tsuge, T
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批准号:23K18032
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.08万
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财政年份:2023
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
フザリウム病原菌の各種病原性変異株を用いた生物防除活性の遺伝学的検証
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批准号:19658017
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2007
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
イチゴ黒斑病菌の病原性を決定するCD染色体の機能マッピング
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批准号:18658018
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2006
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
宿主特異的毒素生合成遺伝子クラスターに存在する毒素生産抑制遺伝子の機能
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批准号:17658022
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2005
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
フザリウム病原菌の無性胞子形成に関与する遺伝子クラスターの同定
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批准号:14656017
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2002
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
植物病原糸状菌におけるトランスポゾンを用いた遺伝子ギングシステ開発
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批准号:10876009
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1998
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
植物病原糸状菌におけるトランスポゾンタギング
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批准号:09876013
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1997
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
植物病原糸状菌におけるメラニン生合成遺伝子群の機能分化
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批准号:08876009
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
植物病原糸状菌の宿主特異的毒素生合成の分子機構
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批准号:07660055
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1995
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
植物病原糸状菌の宿主選択的病原性の分子機構
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批准号:06660048
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1994
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
植物病原糸状菌の病原性遺伝子の単離
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批准号:03660042
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1991
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
植物病原糸状菌の生成する宿主特異的毒素に関する研究
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批准号:62790234
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.13万
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财政年份:1987
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负责人:柘植 尚志
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依托单位:
国内基金
海外基金
Fusarium oxysporum α-L-鼠李糖苷酶理性改造及其催化淫羊藿素合成研究
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批准号:22301068
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2023
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负责人:贾浩宇
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依托单位: