ゲノム情報に基づくファイトプラズマの人工培養系の確立と形質転換換の試み

基于基因组信息的植原体人工培养体系的建立及转化尝试

• 批准号: 17658151
• 负责人: 難波 成任
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17658151/
• 关键词: ファイトプラズマ; ゲノム; 退行的進化; トランスポーター; 微量元素

ファイトプラズマを人工培養するための培地条件および環境条件の検討を行うため、Phytoplasma asteris OY strainのゲノムプロジェクトより得られた配列情報をもとに、代謝系およびトランスポーター遺伝子について詳細な解析を行い、昨年度は、ファイトプラズマが多くの物質を宿主に依存して生活する退行的進化を遂げた生物であることを明らかにした。今年度は、OY strainと近縁なAYWB strainのゲノムが2006年に米国で解読されたことを受けて、両者の比較ゲノム解析を行い、地理的に隔離されたこれらのゲノムにおける可塑性と保存性を調べるとともに、ファイトプラズマに共通して欠けている代謝系を調べた。まず、両ゲノムのGC-skew値を調べたところ、他のグラム陽性細菌と異なり、ゲノム全域にわたって不規則であり、ゲノムの再編成が頻繁に起こった痕跡を示唆した。また、両strain間におけるオーソログ遺伝子の構成を比較したところ、並び方の保存されていない約300kbpのゲノム領域が認められた。これらの結果は、ファイトプラズマゲノムが可塑性に富んでいることを示唆しており、ファイトプラズマが周囲の環境に柔軟に対応して進化してきたためではないかと考えられた。一方、OY strainと同様に、アミノ酸合成系や脂肪酸合成系、ペントースリン酸回路、F_0F_1型ATP合成酵素の遺伝子がゲノム中にコードされていないことが明らかとなり、これらの遺伝子欠損はファイトプラズマに共通した特徴であることが示唆された。これらの結果から、ファイトプラズマを人工培養するためには、アミノ酸、脂肪酸に加えて、ATPなどの核酸類を培地に添加することの重要性が示唆された。

The culture conditions and environmental conditions of Phytoplasma asteris OY strain were studied. The metabolic system was analyzed in detail. The evolution of life depends on the host. This year, OY strain and recent AYWB strain have been analyzed and compared. The plasticity and preservation of the strain have been adjusted. The GC-skew value of the virus is adjusted to the maximum value of the virus. The virus is positive for bacteria and other bacteria. The virus is irregular in the whole domain. The virus is reorganized frequently. A comparison of the composition of the protein between the two strains shows that the protein is about 300kbp in size and the protein is about 300 bp in size. The results of this study are as follows: One side, OY strain, acid synthesis system, fatty acid synthesis system, F_0F_1 type ATP synthase gene transfer system, OY strain, fatty acid synthesis system, F_0F_1 type ATP synthase gene transfer system. The results of this study demonstrate the importance of adding amino acids, fatty acids and nucleic acids to artificial cultures.

项目成果

Presence of two glycolytic gene clusters in a severe pathogenic line of Candidatus Phytoplasma asteris.

• DOI: 10.1111/j.1364-3703.2007.00408.x
• 发表时间: 2007-07
• 期刊: Molecular plant pathology
• 影响因子: 4.9
• 作者: K. Oshima;S. Kakizawa;R. Arashida;Y. Ishii;A. Hoshi;Y. Hayashi;S. Kagiwada;S. Namba

Mycoplasmas: Molecular Biology, Pathogenicity, and Strategies for Control

支原体：分子生物学、致病性和控制策略

• DOI: 10.1128/microbe.1.541.1
• 发表时间: 2006
• 作者: C. Stadtländer

Positive selection acting on a surface membrane protein of plant-pathogenic phytoplasmas.

作用于植物病原植原体表面膜蛋白的正选择。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Journal of Bacteriology 188
• 作者: Kakizawa;S.;Oshima;K.;Jung;H.Y.;Suzuki;S.;Nishigawa;H.;Arashida;R.;Miyata;S.;Ugaki;M.;Kishino;H.;Namba,S.
• 通讯作者: Namba,S.

Recent Research Developments in Bioenergetics

生物能量学的最新研究进展

• 发表时间: 2006
• 作者: Oshima;K.;Namba;S.
• 通讯作者: S.

Interaction between the membrane protein of a pathogen and insect microfilament complex determines insect-vector specificity

• DOI: 10.1073/pnas.0508668103
• 发表时间: 2006-03-14
• 期刊: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
• 影响因子: 11.1
• 作者: Suzuki, S;Oshima, K;Namba, S
• 通讯作者: Namba, S