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廃棄物埋立地土壌の微生物生態構造解析に基づく温暖化ガス放出の土木工学的抑制対策

基于废弃填埋场土壤微生物生态结构分析抑制温室气体排放的土木工程措施

基本信息

批准号：
18656151
负责人：
原田秀樹
金额：
$ 2.24万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

埋立地から放出されるメタンについて、その生成経路および酸化経路については十分な知見は得られていない。そこでこのメタンエミッションに関与している微生物群集の把握を最終的な目的として研究を行った。微生物生態を把握するためには、どのような種がどれだけ居るか、またどのような生息分布になっているかを知る必要がある。これらを把握するのに、微生物をシングルセルレベルで検出可能なfluorescence in situ hybridization(FISH)法は有用なツールである。FISH法は通常rRNAを標的として行われるが、埋立地などに生息する微生物は検出に十分なrRNAを有していないことが多い。また、これまでFISH法の多くはrRNAを標的としてもっぱら行われてきたが、昨今の分子生物学的手法を用いた解析から、rRNA遺伝子配列に基づいた分子系統解析によるグルーピングだけでは、微生物の機能を十分に反映しないことが分かってきた。そこで本研究では、微生物を分子系統(rRNA)および機能(mRNA、遺伝子)に基づいて検出するための高感度FISH法の開発を行った。FISH法の高感度化には2つのアプローチを採用した。1つはシグナル増幅技術、もう1つはプローブの交雑効率改善技術である。シグナル増幅技術にはtyramide signal amplification(TSA)法に着目し、TSA-FISH法をより高感度にしたtwo-pass TSA-FISH法を開発し、メタン生成古細菌のmcr mRNAおよび遺伝子の検出に成功した。交雑効率改善技術にはlocked nucleic acid(LNA)に着目し、プローブにLNAを数カ所導入することで交雑効率が著しく改善することを証明した。これらの研究結果は、今後埋立地に生息する微生物群集を解析していく上で重要な知見となるだけでなく、海洋や土壌に生息する微生物群集生態解析にも適用することができ、微生物生態解析の基盤となる技術となる。更にはメタン生成に関与する新たな古細菌の分離培養にも成功したことで、埋立地の微生物生態を理解するための重要な知見が得られた。

Buried in the ground, released the されるメタンについて, the そのgenerated 経路および acidified 経路については十な知见は得られていない. The final purpose of the microbial cluster control and microbial cluster control is the research and development of the microorganisms.微生物生態を把握するためには、どのような種がどれだけ居るか、またどのような生生distributionになっているかをknow がある. The fluorescence in situ hybridization (FISH) method is useful for microorganisms and microorganisms. In the FISH method, rRNA is usually used as a target, and rRNA can be used as a target.また, これまでFISH methodの多くはrRNAをstandard としてもっぱら行われてきたが, yesterday and today's technique of molecular biology を Use いたanalysis から, The molecular system analysis of rRNA gene sequence and molecular system analysis, and the function of microorganisms are reflected in the analysis of molecular system.そこでThis research is based on the function of the molecular system (rRNA) of microorganisms (mRNA, leftover) and the にづいて検出するためのHigh-sensitivity FISH method の开発を行った. The high sensitivity of the FISH method was adopted in the 2015 FISH method. 1つはシグナルAmplification technology, もう1つはプローブの Interchange efficiency improvement technology. Sterile amplification technology, tyramide signal amplification (TSA) method, high sensitivity, TSA-FISH method, high sensitivity, two-pass TSA-FISH method, archaeal generation, mcr The success of the mRNA is achieved. The efficiency improvement technology of locked nucleic acid (LNA) has been introduced, and the efficiency improvement of LNA has been proven. The results of the research are as follows: Analysis of the microorganism clusters that live in the buried soil is important in the future, and the sea The ecological analysis of microbial clusters in the foreign soil is suitable for the ecological analysis of foreign soil, and the basic technology of microbial ecological analysis is the same. The success of the isolation and cultivation of new archaeal bacteria and the importance of understanding the microbial ecology of the buried site are more important.