バクテリオファージによる微生物叢制御技術に有効な革新的宿主城同定技術の開発

开发创新的宿主识别技术,有效利用噬菌体控制微生物群

基本信息

项目摘要

本研究課題では、従来の宿主域同定実験とは全く異なる、以下の4つのステップから構成される新規なファージの宿主域同定技術を開発することが目的である。(1)核酸染色剤で染めたファージを微生物叢に感染させ微生物を光らせる。(2)FACS(fluorescence activated cell sorting)技術により、ファージに感染した'光った'微生物細胞を特異的に回収する。(3)回収された微生物細胞からDNAを抽出し、16S rRNA遺伝子を決定することで、どのような種類の微生物がファージの感染を受けたのかを決定する。(4)そのクロスチェックとして、回収されてきた微生物細胞の16S rRNAに特異的なDNAプローブをデザインし、先の(1)の核酸染色剤によるファージ標識技術と微生物の16S rRNAを標的としたFISH(fluorescence in situ hybridization)法による2重染色により確認を行う。本手法の開発にはT4ファージと大腸菌をモデルとして用いている。昨年度の本研究においてステップ(1)の検討は終了していたので、本年度はそれ以降のステップについて検討を行った。その後、本手法の適用例として下水を用いて研究を行ったところ、複合微生物群の中からT4ファージに感染した微生物細胞をFACSにより回収、16S rRNA遺伝子を決定およびFISH法の適用という一連のステップを行った。その結果、T4ファージが大腸菌以外の微生物も宿主とする可能性があることが示唆される非常に興味深いデータを得た。
This research topic is aimed at the development of new host domain identity technology for the following four aspects: (1)Nucleic acid staining can cause infection in microbial flora, and can cause light damage in microbial flora. (2)FACS(fluorescence activated cell sorting) technology is used to detect, detect and detect microbial cells. (3)DNA extraction, 16S rRNA gene determination, and infection determination of microbial species (4)The identification of microbial 16S rRNA by FISH(fluorescence in situ hybridization) method was confirmed by DNA staining technique and DNA staining technique. The development of this method is based on the use of Escherichia coli. Last year's study was conducted on the basis of the results of the study. This year's study was conducted on the basis of the results of the study. The application of this method in water research is discussed in detail below. The results of FACS analysis are as follows: The results show that the possibility of microbial host other than Escherichia coli is very high.

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
深海底熱水噴出孔周辺のバクテリオファージの生態調査
深海热液喷口周围噬菌体的生态学研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    D. Anh Van;K. Hayakawa;N. Tang;A. Toriba;Y. Hayashi and T. Kawanishi;大野さやか;大野さやか
  • 通讯作者:
    大野さやか
Development of a novel host range evaluation method for bacteriophages
开发一种新型噬菌体宿主范围评估方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ohno;S.
  • 通讯作者:
    S.
A novel host range evaluation method of bacteriophages
一种新的噬菌体宿主范围评估方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Imachi;H.;井町 寛之
  • 通讯作者:
    井町 寛之
バクテリオファージの新規宿主域評価法
噬菌体宿主范围评估新方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ohno;S.;井町 寛之
  • 通讯作者:
    井町 寛之
新規蛍光標識法を利用したバクテリオファージの宿主域評価方法
使用新型荧光标记方法评估噬菌体宿主范围的方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    D. Anh Van;K. Hayakawa;N. Tang;A. Toriba;Y. Hayashi and T. Kawanishi;大野さやか
  • 通讯作者:
    大野さやか
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医薬品類の塩素処理による分解生成物発生および毒性の調査
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hatamoto;M.;酒井 早苗;井町 寛之;宮下藍;酒井早苗;幡本将史
  • 通讯作者:
    幡本将史
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    吉田 奈央子;井町 寛之;片山 新太;由里本 博也;阪井 康能;玉置仁;塚田真妃,田島慎也,渡部容子,浦丸直人,杉原数美,清水 良,北村繁幸;堀川謙太,高田鑑,大上凌,増田莉奈,清水良,北村繁幸,杉原数美;Daisuke MURAOKA and Hitoshi TAMAKI;村岡大祐,坂見知子,吉田吾郎,堀正和,島袋寛盛,山北剛久,玉置仁;玉置仁,福田民治,村岡大祐
  • 通讯作者:
    玉置仁,福田民治,村岡大祐
東日本大震災による宮城県沿岸の岩礁藻場生態系への影響
东日本大地震对宫城县沿海岩石海藻床生态系统的影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    吉田 奈央子;井町 寛之;片山 新太;由里本 博也;阪井 康能;玉置仁;塚田真妃,田島慎也,渡部容子,浦丸直人,杉原数美,清水 良,北村繁幸;堀川謙太,高田鑑,大上凌,増田莉奈,清水良,北村繁幸,杉原数美;Daisuke MURAOKA and Hitoshi TAMAKI;村岡大祐,坂見知子,吉田吾郎,堀正和,島袋寛盛,山北剛久,玉置仁;玉置仁,福田民治,村岡大祐;粟河大史,堀川謙太,三間昭平,伊藤格,清水良,太田茂,杉原数美;高田鑑,大上凌,増田莉奈,清水良,小林秀丈,太田茂,杉原数美;鈴木まゆみ,小瀬知洋,川田邦明,坂口祐亮,玉置仁;清水良,山口雅史,浦丸直人,黒木広明,太田茂,北村繁幸,杉原数美;村岡大祐,高見秀輝,河村知彦,玉置仁
  • 通讯作者:
    村岡大祐,高見秀輝,河村知彦,玉置仁

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Understanding the origin of eukaryotes through marine benthic archaea
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海底アーキアの生き方から探る私たち真核生物の成り立ち
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相似国自然基金

油桐尺蛾核型多角体病毒宿主域决定的分子机制
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  • 批准年份:
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パラミクソウイルスの糖鎖受容体認識機構と宿主域・トロピズムの解明
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    2885606
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    2023
  • 资助金额:
    $ 2.18万
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    Studentship
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    2023
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知道了