蛋白質結晶構造解析に必要なデータセットを1秒以内に完全測定するシステムの開発

开发可在1秒内完整测量蛋白质晶体结构分析所需数据集的系统

• 批准号: 20651060
• 负责人: 足立 伸一
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: High Energy Accelerator Research Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20651060/
• 关键词: 高速高精度測定; タンパク質結晶; 分子動画

タンパク質分子は酵素反応において様々な化学反応を触媒し、多くの場合、ミリ秒から秒オーダーの時間領域に特有の反応時定数を持っている。このようなタンパク質の酵素反応過程を原子レベル分解能の動画として観測することは生物科学研究者の究極の夢である。本研究課題は、放射光から得られる高輝度単色X線と高速試料回転ゴニオメータを組み合わせることにより、秒オーダーで進行する反応を触媒する酵素タンパク質を対象として、1回の測定で1秒以内に1個の結晶から独立な領域の高精度X線回折データを測定する装置の開発し、新規データ解析ソフトウエアを開発と合わせて、酵素反応中間体の構造解析をこれまでの方法では実現不可能であった高精度で行うためのシステム開発することを目的とした。本研究では、目標値である1秒以内のデータ測定の実現までには最終的に至らなかったものの、その基盤的な検討のために高速回転ゴニオメータを組み込んだX線回折装置の開発を進め、装置上は原理的に1秒以内のデータ測定が実現可能であることを確認した。また一方で、タンパク質結晶試料を低温条件下に冷却しながらパルスレーザー照射を行うことにより、ミリ秒から秒オーダーで進行する反応を分オーダーまで減速し、高精度にX線回折データ測定するシステムの開発を平行して行った。この測定方法を一酸化炭素結合型ミオグロビン結晶に適用し、ミオグロビン分子の小分子輸送ダイナミクスに関する新たな知見を得ることに成功した。

Molecular enzyme reaction, chemical reaction, chemical reaction, reaction time and time domain. In the process of enzyme reaction, the process of atomic decomposition is very important for bioscience researchers. In this study, the results of high-resolution color X-ray high-speed material return equipment, integrated equipment, second-order test, reverse-catalyst enzyme test, one-second test within 1 second, independent domain high-precision X-ray foldback test equipment on-off and in one second. In the new regulation analysis, it is not possible to improve the precision of the system in order to improve the performance of the system, the analysis of the system and the analysis of the enzyme in the system. In this study, the target and target were tested within 1 second to determine that it is possible to verify that it is possible to improve the performance of the X-ray foldback device and the principle of the device within 1 second. it is possible to verify that it is possible to verify that it is possible to make sure that it is possible to do so within 1 second. Under the condition of low temperature, the cooling temperature, cooling temperature, temperature, The method for the determination of acidified carbon was used to determine the results of the combination of acidified carbon and carbon. The results showed that the small molecules were successfully obtained.

项目成果

Visualizing breathing motion of internal cavities in concert with ligand migration in myoglobin

• DOI: 10.1073/pnas.0807774106
• 发表时间: 2009-02-24
• 期刊: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
• 影响因子: 11.1
• 作者: Tomita, Ayana;Sato, Tokushi;Adachi, Shin-ichi
• 通讯作者: Adachi, Shin-ichi