慢性関節リウマチ疾患遺伝子DR3の重複及びゲノムインプリンティングの可能性

类风湿性关节炎基因 DR3 复制和基因组印记的可能性

• 批准号: 14657117
• 负责人: 大澤 佳代
• 金额: $ 1.92万
• 依托单位: Kobe University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 2003
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14657117/
• 关键词: 関節リウマチ(RA); 遺伝子重複; FISH(fluorescence in situ hybridization)法; DR(death receptor 3); ゲノムインプリンティング; メチル化; DR3(death receptor 3)

関節リウマチについて当研究室が同定した第1染色体に座位する遺伝子Death receptor 3(DR3)に対して次の研究を行った。BLASTNによる遺伝子重複の検索:DR3遺伝子に関してNCBI、Sanger、DDBJ等のデータバンクを用いて行った遺伝子重複の検索において、重複の事実は認められなかった。FISH(fluorescence in situ hybridization)法を用いたマッピング:DR3遺伝子を含むクローンと近傍にあるクローンを用いてmappingを行ったところ、DR3遺伝子にのみ遺伝子重複が観察された。この遺伝子重複を確認したところ、RA患者においては特に遺伝子変異のみられたRA患者に遺伝子重複が多く認められた。Fiber-FISH法を用いたマッピング:Fiber-FISH法によるマッピングにより、FISH法で示されたDR3遺伝子の遺伝子重複がセントロメア側の約200-300kbの位置にあることが示された。定量PCR法による遺伝子重複とSNPsの関係:SNPsに特異的なプライマーを用いて遺伝子重複とSNPsの関係を調べた。変異率の計算より、SNPsにおける遺伝子重複の確認ができた。ゲノムインプリンティングの可能性について:DR3遺伝子のプロモーター領域のメチル化の有無を確認した。プロモーター領域の一部ではアレル特異的なメチル化が認められた。また、RA患者における滑膜細胞では、末梢血リンパ球には認められなかったプロモーター領域のメチル化が起こっていた。学会発表:本研究の内容は第25回及び第26回日本分子生物学会年会にて発表した。今後の展望:遺伝子重複に関しては論文投稿中であり、ゲノムインプリンティングについてはさらなる症例での確認、および転写開始点等の検索を行っている。

Masato section リ ウ マ チ に つ い て when laboratory が with fixed し た chromosome 1 に seat す る heritage 伝 child Death receptor 3 (DR3) に し seaborne の research line を っ て times た. BLASTN に よ る heritage 伝 son repeat の 検 suo: DR3 posthumous son 伝 に masato し て NCBI, Sanger, DDBJ の デ ー タ バ ン ク を with い て line っ た heritage 伝 son repeat の 検 cable に お い て, repetitive の things be は recognize め ら れ な か っ た. を FISH (fluorescence in situ hybridization) method with い た マ ッ ピ ン グ : DR3 posthumous son 伝 を containing む ク ロ ー ン と nearly alongside に あ る ク ロ ー ン を with い て mapping を line っ た と こ ろ, DR3 but 伝 に の み heritage 伝 son repeat が 観 examine さ れ た. こ の heritage 伝 son repeat を confirm し た と こ ろ, RA patients に お い て は, に heritage 伝 sub - different の み ら れ に た RA patients survived 伝 son of repeat が く recognize め ら れ た. Fiber を FISH method with い た マ ッ ピ ン グ : Fiber - FISH method に よ る マ ッ ピ ン グ に よ り, FISH で shown さ れ た DR3 heritage 伝 の but 伝 son repeat が セ ン ト ロ メ ア side の is about 200-300 KB の に あ る こ と が shown さ れ た. Quantitative PCR method に よ る heritage 伝 son repeat と SNPs の masato: SNPs に specific な プ ラ イ マ ー を with い て heritage 伝 son repeat と SNPs の masato is を adjustable べ た. The variation rate <s:1> calculation よ, SNPsにおける remnant 伝 repetition <s:1> confirmation がで た た た. ゲ ノ ム イ ン プ リ ン テ ィ ン グ の possibility に つ い て : DR3 posthumous son 伝 の プ ロ モ ー タ ー field の メ チ ル change の presence of を confirm し た. Youdaoplaceholder0, プロモ, タ, タ the field of <s:1> a で, アレ, アレ a specific なメチ, アレ, が recognition められた. ま た, RA patients に お け る synovial cell で リ は, peripheral blood ン パ ball に は recognize め ら れ な か っ た プ ロ モ ー タ ー field の メ チ ル change が up こ っ て い た. The main content of this study is にて the 25th and び the 26th annual meeting of the Japanese Society for Molecular Biology にて the main content is た. の future: heritage 伝 son repeat に masato し て は paper submitted in で あ り, ゲ ノ ム イ ン プ リ ン テ ィ ン グ に つ い て は さ ら な る cases で の confirmation, お よ び planning to write the starting point and の 検 cable line を っ て い る.

项目成果

大澤 佳代: "関節リウマチ(RA)の疾患遺伝子DR3の遺伝子重複とSNPsについて"リウマチ. 43・2. 266 (2003)

Kayo Osawa：“类风湿性关节炎（RA）中疾病基因 DR3 的基因重复和 SNP”类风湿性关节炎 43・2。

Kayo Osawa: "Evidence for gene duplication in a small chromosome region Ip36 containing death receptor 3 (DR3) gene : increased frequency of Gene…"Arthritis & Rheumatism. 47・9(suppple). S6778 (2003)

Kayo Osawa：“含有死亡受体 3 (DR3) 基因的小染色体区域 Ip36 中基因重复的证据：基因频率增加……”关节炎与风湿病 (Arthritis & Rheumatism) (2003)。

Nozomi Takami: "Evidence for gene duplication in the death receptor 3 (DR3) gene that shows genetic association with Rheumatoid arthritis."Arthritis & Rheumatism. 47・9(suppple). S142 (2003)

Nozomi Takami：“死亡受体 3 (DR3) 基因中的基因重复与类风湿性关节炎有遗传关联。”关节炎与风湿病 (Arthritis & Rheumatism)，47·9（增刊）。

大澤 佳代: "第1染色体上RA疾患感受性遺伝子のDR#のduplication(遺伝子重複)に関する研究"リウマチ. 42・2. 363 (2002)

Kayo Osawa：“1 号染色体上 RA 疾病易感基因的重复研究”风湿病学 (2002)。

高見 希: "RAの疾患遺伝子DR3の定量PCR法によるSNPs解析"リウマチ. 43・2. 266 (2003)

高见希：“使用定量PCR方法进行RA疾病基因DR3的SNP分析”风湿病学43·266（2003年）。