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Research on information fusion methods for multiple genomic data sources with heterogeneity based on hierarchical statistical modeling

Research on information fusion methods for multiple genomic data sources with heterogeneity based on hierarchical statistical modeling
基于层次统计模型的多异质基因组数据源信息融合方法研究
批准号：
17200020
负责人：
HIGUCHI Tomoyuki
金额：
$29.95万
依托单位：
The Institute of Statistical Mathematics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2005
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2005 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17200020/
关键词：
階層ベイズ状態空間モデルグラフィカルモデルベイジアンネットワークマイクロアレイデータ遺伝子ネットワークカルバックライブラーカーネルスペクトル判別ゲノムマイクロアレイモデル化ソフトコンピューティングプロテオーム

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项目成果

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一般に生物学的知識は,データベースの形に具現化されることが多い.データベースに登録された情報にも信頼度の属性を与え,つまりそれを確率変数として取り扱うことで,データベースの登録上の過誤やその情報の不確実さをモデル化し,今までのモデルをさらに階層化したベイズモデルを構成した.これにより,マイクロアレイデータからの情報抽出,既存の生物学的知識の有効活用,データベースの信頼性の検証などを統一的に可能にする枠組みを構築した.
期刊论文(49)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Estimating gene networks with cDNA microarray Data Using State-space models
使用状态空间模型利用 cDNA 微阵列数据估计基因网络
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： Proceedings of 2005 International Workshop on Data Mining and Bioinformatics 3482
影响因子： --
作者： [R. Yamaguchi, S. Yamashita, T. Higuchi]
通讯作者： T. Higuchi
パターン認識と機械学習 下-ベイズ理論による統計的予測[翻訳&監訳]
模式识别与机器学习2-利用贝叶斯理论进行统计预测【翻译&监督】
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [Ogata, Yosihiko, 樋口知之, K. Imamura, 樋口知之]
通讯作者： 樋口知之
Statistical inference of transcriptional module-based gene networks from time course gene expression profiles by using state space models
DOI： 10.1093/bioinformatics/btm639
发表时间： 2008-04-01
期刊： BIOINFORMATICS
影响因子： 5.8
作者： [Hirose, Osamu, Yoshida, Ryo, Miyano, Satoru]
通讯作者： Miyano, Satoru
Modeling and estimation of dynamic EGFR pathway by data assimilation approach using time series proteomic data.
DOI： 10.11234/gi1990.17.2_226
发表时间： 2006
期刊： Genome informatics. International Conference on Genome Informatics
影响因子： --
作者： [S. Tasaki;Masao Nagasaki;M. Oyama;H. Hata;Kazuko Ueno;Ryo Yoshida;T. Higuchi;S. Sugano;S. Miyano]
通讯作者： S. Tasaki;Masao Nagasaki;M. Oyama;H. Hata;Kazuko Ueno;Ryo Yoshida;T. Higuchi;S. Sugano;S. Miyano
共 29 条
    Potential of ark clam as a processed food with beneficial effects on iron-deficiency anemia
    • 批准号：
      20K02341
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.83万
    • 财政年份：
      2020
    • 负责人：
      HIGUCHI Tomoyuki
    • 依托单位：
      Hirosaki University
    Mathematical platform for creating the emulator-based design science as the foundation of next-generation manufacturing technology
    • 批准号：
      15K11999
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.25万
    • 财政年份：
      2015
    • 负责人：
      HIGUCHI Tomoyuki
    • 依托单位：
      The Institute of Statistical Mathematics
    Study on Nonlinear Filtering Method for Streaming Computing under Edge Heavy Data Environment
    • 批准号：
      26280010
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $10.07万
    • 财政年份：
      2014
    • 负责人：
      HIGUCHI Tomoyuki
    • 依托单位：
      The Institute of Statistical Mathematics
    Research on advancement of computer-intensive methods for statistical estimations along with Graphical Processing Units and development of application software
    • 批准号：
      23300108
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $12.65万
    • 财政年份：
      2011
    • 负责人：
      HIGUCHI Tomoyuki
    • 依托单位：
      The Institute of Statistical Mathematics
    海外基金