Structure-based design of a bioactive small molecule

生物活性小分子的基于结构的设计

• 批准号: 21870016
• 负责人: SATO Shinichi
• 金额: $ 1.73万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21870016/
• 关键词: X線結晶解析; 標的タンパク質同定; 生理活性化合物; 分子設計; 分子認識

The goal of this project is to solve the X-ray structure of wrenchnolol-target-protein complex and to obtain a wrenchnolol analogue which has a good potency by structure-based design.: Research results :1. Three kinds of S100 protein (S100A11, A13 and A16), which are purified as protein targets of wrenchnolol, were prepared by using E. coli expression system.2. 1g of wrenchnolol was prepared by chemical synthesis.3. The S100 protein-wrenchnolol complex was formed by mixing and incubating on ice for 30min, and then concentrated by ultrafiltration.4. The initial crystallization conditions for the complex were screened by using crystal screening kits. In this screening, several protein crystals were obtained.

本课题的目标是通过基于结构的设计，求解扳手诺酚-靶蛋白复合物的x射线结构，获得具有良好药效的扳手诺酚类似物。研究成果：利用大肠杆菌表达系统制备了三种S100蛋白（S100A11、A13和A16），作为扳手酚的蛋白靶点。采用化学合成法制备了1g的扳手酚。3 .将S100蛋白-扳手酚复合物混合在冰上孵育30min，然后进行超滤浓缩。利用晶体筛选试剂盒对配合物的初始结晶条件进行筛选。在这种筛选中，获得了几个蛋白质晶体。

项目成果

海洋天然物のケミカルジェネティクス

海洋天然产物的化学遗传学

• 发表时间: 2009
• 期刊: 細胞工学 28(4)
• 作者: Sato;S.;Murata;A.;Uesugi;M.
• 通讯作者: M.

化合物推理ゲーム

复合谜题游戏

• 发表时间: 2010
• 期刊: ファルマシア 46(1)
• 作者: Sato;S.;Uesugi;M.
• 通讯作者: M.

細胞工学(海洋天然物のケミカルジェネティクス) 28

细胞工程（海洋天然产物的化学遗传学）28

• 发表时间: 2009
• 作者: 佐藤慎一;村田亜沙子;上杉志成
• 通讯作者: 上杉志成

生理活性物質による創薬標的同定のコツ(創薬研究のためのタンパク質・プロテオミクス解析) 別冊

使用生理活性物质识别药物发现靶标的技巧（用于药物发现研究的蛋白质/蛋白质组学分析）单独的卷

• 发表时间: 2010
• 作者: 佐藤慎一;村田亜沙子;白川貴詩;上杉志成
• 通讯作者: 上杉志成

ファルマシア(化合物推理ゲーム) 45(12)

法玛西亚（复合解谜游戏）45（12）

• 发表时间: 2009
• 作者: 佐藤慎一;村田亜沙子;上杉志成;佐藤慎一,上杉志成
• 通讯作者: 佐藤慎一,上杉志成