Rational design of protein-protein interaction inhibitors

蛋白质-蛋白质相互作用抑制剂的合理设计

• 批准号: 23510277
• 负责人: SATO Shinichi
• 金额: $ 3.49万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23510277/
• 关键词: X線結晶構造解析; ケミカルバイオロジー

Protein-protein interactions are central to most biological processes and expected to represent an important class of drug targets near future. However, it remains challenging to design small-molecule inhibitors of protein-protein interaction, in part due to the lack of structural information of the small molecule-protein complexes. We recently identified S100 protein as a target protein of wrenchnolol which is a bioactive compound we found. Biological experiment revealed that the wrenchonolol inhibits the protein-protein interaction between S100 protein and its partner protein Annexin. In this project, we identified a crystallization condition of a complex between wrenchnolol and Annexin. Structural determination of the complex would permit the design of new wrenchnolol analogs with better activities.

蛋白质-蛋白质相互作用是大多数生物过程的核心，并有望在不久的将来成为一类重要的药物靶点。然而，设计蛋白质-蛋白质相互作用的小分子抑制剂仍然具有挑战性，部分原因是缺乏小分子-蛋白质复合物的结构信息。我们最近鉴定出S100蛋白是我们发现的一种生物活性化合物扳手酚的靶蛋白。生物学实验表明，苦参酚可抑制S100蛋白与其伴侣蛋白膜联蛋白之间的蛋白相互作用。在这个项目中，我们确定了一种柳兰酚和膜联蛋白配合物的结晶条件。该复合物的结构确定将允许设计具有更好活性的新的扳手诺尔类似物。

项目成果

海洋天然物オーリライドの標的タンパク質決定

海洋天然产物aurilide的靶蛋白测定

• 作者: 佐藤慎一;村田亜沙子;折原翼;白川貴詩;末永聖武;木越英夫;上杉志成
• 通讯作者: 上杉志成

Concepts and Case Studies in Chemical Biology

化学生物学的概念和案例研究

• 发表时间: 2014
• 作者: Sato S;Uesugi M
• 通讯作者: Uesugi M

Development of small-molecule fluorescent probes for live imaging of endogenous RNAs

开发用于内源RNA实时成像的小分子荧光探针

• 发表时间: 2012
• 作者: Sato;S.
• 通讯作者: S.

転写因子SREBPの活性化を阻害する内因性化合物

抑制转录因子 SREBP 激活的内源性化合物

• 发表时间: 2013
• 作者: 領田優太;渡邉瑞貴;Bilon KHAMB;白川貴詩;佐藤慎一;川添嘉徳;酒井寿郎;上杉志成
• 通讯作者: 上杉志成

A Small-Molecule Based Method for Live-Cell Imaging of an Endogenous RNA

一种基于小分子的内源性 RNA 活细胞成像方法

• 发表时间: 2014
• 作者: Sato;S.
• 通讯作者: S.