Analysis of TGF-beta signaling modulation by lung cancer specific transcription factors using ChIP-sequense

使用 ChIP 序列分析肺癌特异性转录因子对 TGF-β 信号传导的调节

• 批准号: 24890039
• 负责人: ISOGAYA Kazunobu
• 金额: $ 1.66万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-08-31 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24890039/
• 关键词: 癌の浸潤転移; TGF-βシグナル; 肺癌; 転写因子; ChIP-seq; TTF-1; 肺腺癌; 浸潤転移; TGF-β; 癌の浸潤・転移; 転写制御

We performed genome wide analysis using ChIP-seq and RNA-seq in lung adenocarcinoma cell lines, and we revealed TTF-1, which is the master regulator of lung epithelial cells, interact with Smad3, and co-localizes at the chromatin. Moreover, TTF-1 competes with Smad4 on Smad3, and inhibits part of TGF-beta signaling especially expression of EMT-related genes. TTF-1 and Smad3 also bind to the chromatin in the absence of TGF-beta stimulation, and regulate expression of some genes including LMO3 oncogene. We bring up new model of TGF-beta regulation, and tumor suppression mechanism of TTF-1.These data will contribute to development of new therapy of lung adenocarcinoma. These results are published in Cell Research as an original article.

我们使用 ChIP-seq 和 RNA-seq 在肺腺癌细胞系中进行全基因组分析，发现 TTF-1（肺上皮细胞的主要调节因子）与 Smad3 相互作用，并共定位于染色质。此外，TTF-1与Smad4竞争Smad3，并抑制部分TGF-β信号传导，特别是EMT相关基因的表达。在没有 TGF-β 刺激的情况下，TTF-1 和 Smad3 也会与染色质结合，并调节包括 LMO3 癌基因在内的一些基因的表达。我们提出了TGF-β调控的新模型，以及TTF-1的肿瘤抑制机制。这些数据将有助于肺腺癌新疗法的开发。这些结果作为原创文章发表在《Cell Research》上。

项目成果

Molecular mechanisms of TGF-βsignal modification by TTF-1

TTF-1修饰TGF-β信号的分子机制

• 发表时间: 2013
• 作者: Isogaya K;Koinuma D;Tsutsumi S;Saito RA;Miyazawa K;Aburatani H;Miyazono K
• 通讯作者: Miyazono K

肺腺癌細胞株におけるFoxA1/2によるSmad3のクロマチン上への結合の制御

FoxA1/2在肺腺癌细胞系中对Smad3与染色质结合的调节

• 发表时间: 2012
• 作者: Isogaya K;Koinuma D;Tsutsumi S;Aburatani H;Miyazono K;大熊加惠;M Sunohara;磯谷一暢
• 通讯作者: 磯谷一暢

Regulation of Smad3 binding by FoxA1/2 in lung adenocarcinoma cells

FoxA1/2对肺腺癌细胞中Smad3结合的调节

• 发表时间: 2012
• 作者: Isogaya K;Koinuma D;Tsutsumi S;Aburatani H;Miyazono K
• 通讯作者: Miyazono K

Smad3-TTF-1 complex regulates genes independently of Smad4

Smad3-TTF-1 复合物独立于 Smad4 调节基因

• 发表时间: 2013
• 作者: Isogaya K;Koinuma D;Tsutsumi S;Saito RA;Miyazawa K;Aburatani H;Miyazono K
• 通讯作者: Miyazono K

Smad3 and TTF-1/NKX2-1 Complex Regulates Smad3-Independent Gene Expression

Smad3 和 TTF-1/NKX2-1 复合物调节不依赖于 Smad3 的基因表达

• 发表时间: 2014
• 期刊: Cell Res.
• 作者: Isogaya K;Koinuma D;Tsutsumi S;Saito RA;Miyazawa K;Aburatani H;Miyazono K
• 通讯作者: Miyazono K