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RNA非翻訳領域を標的とする核酸検出リガンドの創製と機能性RNA研究への応用

针对RNA非翻译区的核酸检测配体的创建及其在功能性RNA研究中的应用

基本信息

批准号：
22245010
负责人：
寺前紀夫
金额：
$ 10.48万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
起止时间：
2010 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

タンパク質に翻訳されずに機能するRNAは,ノンコーディングRNA (ncRNA)と呼ばれる。ここ10年程の間に,ncRNAが関与する生物現象の発見が相次ぎ,生物学の知見が新しいものに塗替えられつつある。なかでもリボスイッチは,低分子化合物との特異的結合によって遺伝子発現調節を行うユニークなncRNAで,抗生物質の新たな標的として,あるいは遺伝子発現を制御しうる技術開発に繋がる研究対象として,特に注目されているncRNAファミリーの1つである。本研究では,新たな研究領域への新たな分析ツールの提供を目指し,『ノンコーディングRNA,特にリボスイッチを標的とする蛍光性の小分子(リガンド)を開発し,これらの化合物に基づくRNA解析法並びに薬剤ハイスループットスクリーニング法を開発する』ことを目的とする。また,リボスイッチの他,『ヒト免疫不全ウイルス(HIV)のTrans-activation responsive region (TAR RNA)や16SリボソームRNAAサイト』といった遺伝子発現調節に関わるRNAの非翻訳領域を標的とする蛍光性リガンド開発も併せて試みる。本年度(平成22年4月～5月)は,ピラジン誘導体(蛍光極大波長:～400nm)が抗生物質とほぼ同等の結合親和力でTAR RNAと結合しうることを見出すとともに(K_d=770nM),蛍光性ナフチリジン誘導体(蛍光極大波長:～400nm)がアミノグリコシド類に匹敵する結合力でAサイトに結合することを見出した(K_d=530nM)。現在,より詳細な相互作用解析を進めており,それらの知見に基づいて結合機能及び蛍光応答特性の改良をさらに行うことで,ncRNAの新しい分析ツールになることが期待できる。

非编码RNA（ncRNA）是一种非编码RNA。在10年过程中，ncRNA核糖核酸与RNA生物学特征相互作用时，生物学已知的新的核糖核酸替代物将被发现。免疫荧光检测试剂盒，低分子化合物特异性的复合免疫原性核酸检测试剂盒，抗生物素抗体新试剂盒的试剂盒，免疫荧光检测试剂盒核酸抑制剂制备技术的研究，特异性核酸检测试剂盒，特异性核酸检测试剂盒，1种新型核酸检测试剂盒。本研究将为新研究领域的新研究提供新的分析手段，包括基因组DNA、特异性寡核苷酸RNA、特异性寡核苷酸的荧光性小分子（寡核苷酸）荧光探针、特异性寡核苷酸化合物碱基寡核苷酸RNA解析法等。HIV，艾滋病病毒，免疫不全病毒（HIV），反式激活反应区（TAR RNA），16S核糖核酸酶激活的核糖核酸酶激活的核糖核酸酶（RNA），非病毒区域内的非特异性荧光素酶激活的核糖核酸酶。本年度（平均22年4月~5月），荧光素酶抑制剂（荧光光波长：~400nm）抗生物素TAR RNA酶抑制剂和力敏TAR RNA酶抑制剂均能产生荧光素酶抑制剂（K_d=770nM），荧光性荧光素酶抑制剂（荧光光波长：~400nm）荧光素酶抑制剂A荧光素酶抑制剂能产生荧光素酶抑制剂（K_d=530nM）。在此，申请人必须进行相互作用的分析，申请人必须知道基础药物的合成能力以及荧光抗体应答特性的改善情况进行分析，ncRNA新的荧光分析方法将被期待。