课题基金 / 基金详情

脱塩基オリゴDNAを用いた表面プラズモン共鳴による一塩基多型検出

脱塩基オリゴDNAを用いた表面プラズモン共鳴による一塩基多型検出
使用脱碱基寡聚 DNA 通过表面等离子共振检测单核苷酸多态性
批准号：
06F06075
负责人：
寺前 紀夫
金额：
$1.54万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2006
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2006 至 2007
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06F06075/
关键词：
NDASNP電気化学計測チトクロムc脱塩基部位表面プラズモン共鳴一塩基多型塩基特異性

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
遺伝的先天性疾患の診断を目的として、個々人のDNA配列を解析することの重要性が高まっている。特に、DNA配列内の一塩基多型(Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs)検出法の開発は、個人個人に最適化された「テーラーメイド医療」の実現に向けて重要な研究課題の一つである。これまで、蛍光検出型DNAマイクロアレイが主に開発されてきたが、標的DNAへの蛍光ラベル化などの煩雑な操作が必要であることが問題とされており、これに代わる迅速、簡便かつ安価な手法の開発が期待されている。本研究では蛍光ラベル化を必要としない手法として、金電極表面に固定化した脱塩基部位含有DNA単分子膜への水素結合性小分子の結合について検討を行った。DNA単分子膜上に吸着したチトクロムcの電気化学応答を計測したところ、水素結合性小分子存在下で良好な電気化学シグナルが得られたのに対して、非存在下では電流量の減少並びに応答の鈍化が観測された。これはチトクロムc-電極間の電荷移動に対するDNA中の脱塩基部位の影響であると考えられる。また、脱塩基部位向かい側の標的塩基に対しても電流応答の依存性があることがあきらかとなった。用いた水素結合性分子であるナフチリジン誘導体と相補的な三点水素結合形成をするシトシンにおいて最も良好な応答が得られたことから、脱塩基部位への水素結合性分子の結合ならびに脱塩基部位向かい側の標的塩基の識別をチトクロムcをレポータ分子として読み出すことに成功した。現在表面プラズモン共鳴分光法による評価について検討中である。
英文摘要
遺伝的先天性疾患の診断を目的として、個々人のDNA配列を解析することの重要性が高まっている。特に、DNA配列内の一塩基多型(Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs)検出法の開発は、個人個人に最適化された「テーラーメイド医療」の実現に向けて重要な研究課題の一つである。これまで、蛍光検出型DNAマイクロアレイが主に開発されてきたが、標的DNAへの蛍光ラベル化などの煩雑な操作が必要であることが問題とされており、これに代わる迅速、簡便かつ安価な手法の開発が期待されている。本研究では蛍光ラベル化を必要としない手法として、金電極表面に固定化した脱塩基部位含有DNA単分子膜への水素結合性小分子の結合について検討を行った。DNA単分子膜上に吸着したチトクロムcの電気化学応答を計測したところ、水素結合性小分子存在下で良好な電気化学シグナルが得られたのに対して、非存在下では電流量の減少並びに応答の鈍化が観測された。これはチトクロムc-電極間の電荷移動に対するDNA中の脱塩基部位の影響であると考えられる。また、脱塩基部位向かい側の標的塩基に対しても電流応答の依存性があることがあきらかとなった。用いた水素結合性分子であるナフチリジン誘導体と相補的な三点水素結合形成をするシトシンにおいて最も良好な応答が得られたことから、脱塩基部位への水素結合性分子の結合ならびに脱塩基部位向かい側の標的塩基の識別をチトクロムcをレポータ分子として読み出すことに成功した。現在表面プラズモン共鳴分光法による評価について検討中である。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Sequence dependence of cytochrome c electrochemistry on DNA modified electrodes: Effect of hydrogen bonding of a ligand to nucleobases opposite an abasic site
DOI： 10.1016/j.elecom.2008.01.008
发表时间： 2008-03
期刊： Electrochemistry Communications
影响因子： 5.4
作者： [Yong Shao;Kotaro Morita;Qing Dai;S. Nishizawa;N. Teramae]
通讯作者： Yong Shao;Kotaro Morita;Qing Dai;S. Nishizawa;N. Teramae
RNA非翻訳領域を標的とする核酸検出リガンドの創製と機能性RNA研究への応用
  • 批准号：
    22245010
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额：
    $10.48万
  • 财政年份：
    2010
  • 负责人：
    寺前 紀夫
  • 依托单位：
    Tohoku University
アプタマー含有メソポーラス材料を用いたバイオセンサーの開発
  • 批准号：
    10F00342
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $1.47万
  • 财政年份：
    2010
  • 负责人：
    寺前 紀夫
  • 依托单位：
    Tohoku University
生理活性物質の高選択的高感度検出用電気化学バイオセンサーの開発
  • 批准号：
    07F07057
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $1.41万
  • 财政年份：
    2007
  • 负责人：
    寺前 紀夫
  • 依托单位：
    Tohoku University
原始地球環境を模擬した水熱条件下でのRNA合成について
  • 批准号：
    06F06168
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $1.54万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    寺前 紀夫
  • 依托单位：
    Tohoku University
国内基金
海外基金
RBM38基因SNP对人红细胞卟啉代谢的影响
  • 批准号：
    2025JJ81130
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    --
  • 批准年份：
    2025
  • 负责人：
    刘康
  • 依托单位：
    湘潭市中心医院
风险SNP介导的增强子通过FAM13A在哮喘 肺泡巨噬细胞中引发M1型炎症的机制研 究
FST基因调控猪乳腺原基上皮细胞功能研究及其因果SNP位点鉴定
  • 批准号：
    2025JJ60129
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    --
  • 批准年份：
    2025
  • 负责人：
    刘晨曦
  • 依托单位：
    湖南农业大学
图表示学习的SNP模型研究
  • 批准号：
  • 项目类别：
    省市级项目
  • 资助金额：
    --
  • 批准年份：
    2025
  • 负责人：
    郭平
  • 依托单位：
    重庆城市科技学院