CADシステムのための演繹オブジェクト指向データベースの関する研究

CAD系统演绎面向对象数据库研究

• 批准号: 04219208
• 负责人: 高木 利久
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1992
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1992 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-04219208/
• 关键词: 演繹データベース; オブジェクト指向データベース; CADシステム; 質問処理効率; 利用者インタフェース; ゲノム情報処理; ゲノムデータベース; ソフトウェアオブジェクトベース

本年度は,平成3年度に作成したDADシステムのための演繹データベース(DDB)の推論エンジンのプロトタイプに対し,処理効率・利用者インタフェースの点から改良を行った。具体的な研究成果を以下に示す。1.複合項の処理効率を改善するためにデータ構造の共有に対応するハッシュ関数を用いる手法を評価した。2.テンプレートを用いて検索条件を入力する利用者インタフェースを提案した。3.2.のインターフェースを使って入力された検索条件から実行効率のよいルールを生成する手法を提案した。演繹オブジェクト指向データベース(DOOD)に関しては,応用分野をDADに限らず,ゲノム情報処理への応用も考え,開発を行った。ゲノムとは生物の遺伝情報の総体のことであり,ゲノムのデータにはDNAの塩基配列データ,タンパク質のアミノ酸配列データ,タンパク質の3次構造のデータ,染色体地図など多種多様かつ大量のデータがあり,それらのデータは相互に複雑な関連を持っている。具体的な成果を以下に示す。1.DNA中の生物学的に意味のある配列や2次構造の検索に,平成3年度までに開発してきたDDBを適用した。その結果,ゲノム情報処理におけるDDBの有効性や問題点を明らかにすることができた。2.DNAの塩基配列に関するデータをオブジェクト指向の概念で整理し,商用のオブジェクト指向データベース(OODB)であるGemStoneを用いて,ゲノム情報処理のためのOODBを実現した。3.2.のOODBの演繹インタフェースを構築した。上記の研究を通して,DDBおよびOODBそれぞれの有効性とこれらの統合の必要性が明らかになった。本研究で得られた知見を利用して,ソフトウェアオブジェクトベースの実現にDOODという枠組が利用できると期待される。

This year, we have been working on improving the efficiency of processing and the utilization of data in the context of deductive data (DDB) in Heisei 3. Specific research results are shown below. 1. The processing efficiency of the compound is improved. 2. Use of information 3.2. The method of generating the input force and the output force Deduction of the information points to the information (DOOD), which is related to the use of DAD to limit the display, information processing, and development. In order to solve the problem of biological genetic information, we must use the DNA base alignment data, the DNA base alignment data, the three Specific results are shown below. 1. The development of DDB in Heisei 3 is applicable to the analysis of biological significance and secondary structure in DNA. As a result, the DDB has the ability to process information. 2. DNA base alignment related to the concept of "point of view" and organize, commercial "point of view"(OODB)"GemStone" in use, information processing and OODB implementation. 3.2. The interpretation of OODB is built. The above study shows that DDB and OODB have different characteristics and the necessity of integration is obvious. This study was conducted to investigate the effects of different factors on the development and utilization of DOOD.

项目成果

Kenji Satou: "A Deductive Database System PACADE for Analyzing Three Dimensional and Secondary Structures of Protein" Computer Applications in the Bioscience.

Kenji Satou：“用于分析蛋白质三维和二级结构的演绎数据库系统 PACADE”计算机在生物科学中的应用。

Norihiro Sakamoto: "Development of Overlapping Oligonucleotide Database and Application to Signal Sequence Search of the Human Genome" Computer Applications in the Bioscience.

Norihiro Sakamoto：“重叠寡核苷酸数据库的开发及其在人类基因组信号序列搜索中的应用”计算机在生物科学中的应用。

Toshihisa Takagi: "ODS:Overlapping Oligonucleotide Database with Deductive Engine for Signal Sequence Search" Proceedings of the Sencond International Conference on Bio-informatics,Supercomputing,and Complex Genome Analysis.

Toshihisa Takagi：“ODS：带有信号序列搜索演绎引擎的重叠寡核苷酸数据库”第二届生物信息学、超级计算和复杂基因组分析国际会议论文集。

五斗 進: "ゲノム情報解析のための演繹オブジェクト指向データベース" 情報学シンポジウム講演集. 29-38 (1993)

Susumu Goto：“用于基因组信息分析的演绎对象导向数据库”信息学研讨会论文集 29-38（1993）。

高木 利久: "ゲノムデータベース" 情報処理. 33. 1126-1133 (1992)

Toshihisa Takagi：“基因组数据库”信息处理 33. 1126-1133 (1992)。