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転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識

转录因子的模块域结构和信号识别

基本信息

批准号：
09249208
负责人：
郷通子
金额：
$ 1.15万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1997
资助国家：
日本
起止时间：
1997 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究ではDNAとの複合体のX線結晶解析がなされている転写因子やDNAポリメラーゼ、修復酵素などを対象に、モジュール構成とDNAとの相互作用を解析した。その結果、機能がモジュールによって分担されていることがわかった。DNAとの相互作用は塩基特異的認識とリン酸基結合とに分けられることを、昨年度までに明らかにしている。DNPポリメラーゼや修復酵素などの触媒機能も、塩基特異的認識やリン酸基結合と同様に、数少ないモジュールに分担されていた。DNAの塩基配列を特異的に認識するモジュールとしては、ヘリックス・ターン・ヘリックス(HTH)モジュールが知られている。塩基の特異的な識別のために、共通の主鎖構造をもつモジュールHTHが使われているが、アミノ酸側鎖に個性があるから特異的な相互作用ができる。一方、DNAの主鎖骨格にはリン酸基があり、リン酸基とタンパク質との相互作用も重要である。このことはこれまであまり注目されていなかった。リン酸基結合モジュールにも、共通性のある立体構造が存在する。原核生物と真核生物由来の3種類の転写因子と真核生物由来のDNAポリメラーゼとの間に、共通のHTHモジュールが存在することを見いだした。リン酸基との相互作用の様式の詳細を調べた結果、水素結合の様式もよく似ているリン酸基結合HTHモジュールであった。これらのモジュールは、一次構造にも共通性をもつことが明らかになった。この結果から、RNAポリメラーゼαサブユニットとDNAとの相互作用部位を、相互作用の様式を含めて推定することができた。HTHモジュールは、塩基特異的認識、リン酸基結合、あるいは他のモジュールの支持台として、何回もタンパク質に組み込まれていったことが示された。

In this study, X-ray crystallographic analysis of DNA complexes was performed to analyze the interaction between DNA and repair enzymes. The results and functions of the project are as follows: DNA interactions are known as DNA binding. DNP is a complex enzyme with catalytic function, enzyme specific recognition, enzyme binding and homology, and a small amount of enzyme sharing. DNA base alignment is unique to the recognition of DNA base alignment, and DNA base alignment is unique to the recognition of DNA base alignment. The unique recognition of the base, the common main lock structure, the HTH, the acid side lock, the unique interaction, and the unique interaction. The main structure of DNA is composed of two groups. This is the first time I've ever seen you. The existence of a three-dimensional structure in which the base is bound to each other and the base is interconnected. Prokaryote and eukaryotic origin of three types of DNA transcription factors, eukaryotic origin of DNA transcription factors, common HTH transcription factors exist The detailed adjustment results of the interaction formula of the acid group and the water element combination formula are as follows: The first structure is commonality. The second structure is commonality. The results of this study include: RNA, DNA, interaction site, interaction formula, etc. HTH is the key to understanding, understanding