転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識

转录因子的模块域结构和信号识别

基本信息

  • 批准号:
    08260208
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.15万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    1996
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1996 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究で明らかにしたことは、(1)転写因子のモジュール構成と機能相関、(2)プラスチドの転写産物IRF170がコードするタンパク質がホメオドメインとの類似性をもつこと、(3)逆転写酵素はRNaseHドメインと他のドメインとの融合型であるが、ドメイン融合が起きるために必要だったと推定されるアミノ酸置換の位置と数、の3点である。各項の内容は以下の通りである。(1)蛋白質のDNAへの結合は、まずリン酸基に結合し、それから塩基特異的な結合部位を探すと考えられている。塩基特異的な結合には、共通のモジュールが用いられている例が多々ある。リン酸基との結合もまた、モジュールによって担われているか?そうであるなら、リン酸基結合モジュールには共通の立体構造が存在するか?DNAとの複合体として立体構造が判明している転写因子群を対象して研究を行った結果、転写因子は塩基を特異的に認識する塩基認識モジュールと、リン酸基を非特異的に結合するリン酸基結合モジュールとの組み合わせとして構築されていることが、明らかになった。また、原核生物由来の2種類の転写因子と真核生物由来のDNAポリメラーゼとの間に、立体構造がよく似ていてリン酸基との相互作用の様式が同じリン酸基結合モジュールが見つかった。この結果はモジュールのかき混ぜの痕跡であろう。(2)はIRF170がプラスチドの分化を制御していることを示唆した。また、IRF170はらん藻にも存在することから、ホメオドメインによる遺伝子発現の制御は真核生物と原核生物の分岐以前から存在していたことが示唆された。(3)RNaseHドメインと単独ドメイン型であるRNaseHIとの構造比較を行った結果、ドメイン接触部位で最低14個の適応的なアミノ酸置換が必要であったことが示された。
The results of this study show that: (1) the composition and functional correlation of transcription factors;(2) the similarity of transcription products IRF170;(3) the fusion type of reverse transcription enzymes;(4) the number of acid substitutions; 3 o'clock. The content of each item is as follows. (1)DNA binding of proteins is investigated in the presence of binding sites specific to amino acid groups. The base specific binding is common to all types of binding. The acid group is combined with the acid group and the acid group. A common three-dimensional structure exists when the acid group is combined with the acid group. The structure of DNA complex was identified by the study of gene expression, gene expression 2. Prokaryote origin of DNA molecules, eukaryotic origin of DNA molecules, stereostructure of DNA molecules, and interaction patterns of DNA molecules. The result of this is that there is no trace of confusion. (2)IRF 170 is a very important part of the process. IRF 170 is the only one that can control the development of eukaryotes and prokaryotes. (3) RNase H is a unique type of protein. The structure comparison results show that the lowest 14 suitable acid substitutions are necessary.

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Shirai,T: "Adaptive amino acid replacements accompanied by domain fusion in reverse transcriptase." J.Mol.Evol.(in press).
Shirai,T:“逆转录酶中伴随结构域融合的适应性氨基酸替换。”
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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Yura,K:“质体基因组的同源结构域样推定产物:在质体分化中的可能作用”Res.Commu.Biochem.Cell
  • DOI:
  • 发表时间:
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    0
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    $ 1.15万
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  • 资助金额:
    $ 1.15万
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  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 1.15万
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    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 1.15万
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  • 批准号:
    15031201
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 1.15万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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知道了