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タンパク質のモジュール構造の自動的同定と視覚化

蛋白质模块结构的自动识别和可视化

基本信息

批准号：
62580222
负责人：
郷通子
金额：
$ 0.64万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1987
资助国家：
日本
起止时间：
1987 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

タンパク質の立体構造の単位として, 球状ドメインがよく知られている. 球状ドメインは, さらにコンパクトなサブ構造に分解できることを, 申請者は発見し, このサブ構造をモジュールと命名した. モジュールは, X線結晶解析により, 立体構造が分っているタンパク質について同定可能である. これまでは, 距離地図の方法により, モジュールの同定を行ってきた. しかし, 大きいタンパク質や, モジュール構成が複雑なタンパク質では, この方法には精度的な限界が存在する. この点を改良すべく, 新しいモジュール同定法を開発し, この方法を用いてタンパク質のモジュール同定とその視覚化を実行し, 当初の計画通りの成果を得た.新しく開発された方法は, (1)求心性プロフィールと(2)伸長性プロフィールを用いる. これらはどちらも, 主鎖のα炭素の原子座標を使用しているが, 各々一定長のセグメントの中心又は拡がり度から, モジュールの境界の自動的な同定を可能なものとした. この方法により, X線結晶解析がなされている多くのタンパク質のモジュール同定が大巾に進んだ.モジュールの空間配置を表示するグラフィックス用ソフトを改良し, 高速化を実現した. これによって, パソコン上に, モジュール構造の空間充填モデルの表示が容易になった. 立体的なモジュール構成を, 2台のスライドプロジェクター使用によってスクリーンに表示することにより, トリオース隣酸イソメラーゼとアルコール脱水素酵素の各モジュールについて, その機能的役割を明らかにした. さらに, 2次構造とモジュール構造とに関連があることを見い出した. これらの成果は, 天然タンパク質におけるデザインの原理を明らかにした. 本研究で得られた結果は, 遺伝子工学の技術によって将来可能となる, 新しいタンパク質のデザインにおいて役に立つと考えられる.

The three dimensional structure of the material is simple, spherical and simple. Spherical structure is decomposed into a spherical structure, and the applicant is requested to name the spherical structure. X-ray crystallographic analysis, three-dimensional structure, separation, quality and consistency. This is the first time that we've been able to do this. There is no limit to the accuracy of this method. This paper introduces the development of a new method for simultaneous determination of the mass of particles, and the implementation of the visualization of the method for simultaneous determination of the mass of particles, and the achievement of the original plan. The new development method is: (1) to find the nature of the material;(2) to find the elongation of the material. The atomic coordinates of alpha carbon in the main lock are used in the middle of the lock, and the center of each lock is rotated in the middle of the lock, and the automatic synchronization of the lock is possible. This method is based on X-ray crystallographic analysis and is characterized by a large number of crystal phases. The space layout of the car is improved and the speed is realized. The space filling of the structure is easy to express. The three-dimensional structure of the enzyme, 2 sets of different functions of the enzyme in the use of the enzyme, the expression of the enzyme, the function of the enzyme. The second order structure is related to the second order structure. The result of this is that the natural quality of the product is not obvious. The results of this study indicate that the future of genetic engineering technology may be possible, and that new technologies may be used to improve the quality of genetic engineering.