心筋症ハムスターの遺伝的地図作成と原因遺伝子探索

心肌病仓鼠的遗传图谱和寻找致病基因

• 批准号: 06274106
• 负责人: 林崎 良英
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1994
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1994 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-06274106/
• 关键词: 心筋症ハムスター; restriction landmark genamic scanning(RLGS); RLGS spot mapping; RLGS Ver.1.8; 戻し交配; 特発性心筋症

心筋症ハムスターは、ヒト特発性心筋症のモデル動物として重要であるが、常染色体性の単一遺伝形式にて100%の浸透率をもって発症するにも拘わらず、DNAマーカーが存在しないため遺伝的解析が遅れている。今回、心筋症の原因遺伝子座位を同定するために、シリアンハムスターの全染色体地図の作成を目的とした。主な戦略は、restriction landmark genomic scanning(RLGS)を用いて、RLGS spot mapping法により全ゲノムマップを作成し、その中に、心筋症の表現形質を支配する遺伝子をマップする。まず、RLGSゲルの大量生産系(RLGSVer.1.8)を確立した。RLGSVer.1.8は、RLGS prototype(RLGS Ver.1.0)に比してラベリングの反応系の縮小化を行ない、フェノール抽出によるバッファー系の置換の必要性をなくしたため高速にRLGSパターンの生産ができるようにデザインしてある。予備実験の結果、ACNがBio14.6と多型がもっとも多いと考えられたので、Bio14.6とACN系の戻し交配家系60匹を対象とした。制限酵素の組み合せをNotI-PvuII-PstI,NotI-PstI-PvuII,NotI-EcoRV-MboI,BssHII-PvuII-PstI,BssHII-PstI-PvuIIの5種類用い、Bio14.6とACN、およびそのあいだに生まれたF1のRLGSパターンを作成した。約500個の多型マーカーを検出し、戻し交配によって得られた個体についておのおのRLGSパターンを作成後、その伝達を集計した。連鎖解析にはMap Managerを用い、組み替えの頻度が最小限となるようにした、こうしてできた遺伝地図は、全長約1300cMであり、全ゲノムの90%以上カバーすると考えられる。また、27個のリンケージグループからなり、表現形質は、そのうち1つのリンケージグループの上にマップされた。[結論]RLGS法そのものRLGS spot mapping法は、我々の開発したオリジナルな方法であり、これをハムスター亜種間の多型解析に応用し、全染色体地図を作成した。これによる心筋症ハムスターの遺伝学的解析の結果、原因遺伝子のマップされるリンケージグループを同定した。

Heart disease, especially heart disease in animals and important, autosomal genetic form, 100% penetration rate, disease detection, DNA analysis, the existence of genetic analysis. The gene loci of heart disease are identified and the whole chromosome loci are created. Main strategy, restriction landmark genomic scanning(RLGS), RLGS spot mapping method, all kinds of information, all kinds of information. RLS Ver.1.8 was established. RLGSVer.1.8 and RLGS prototype(RLGS Ver.1.0) are compared to the need for downsizing, extraction, and replacement of the RLGS prototype system at high speeds. The results of the study showed that 60 pairs of ACN families were mated with Bio14.6 and ACN polytypes. 5 kinds of restriction enzyme groups: NotI-PvuII-PstI,NotI-PstI-PvuII,NotI-EcoRV-MboI,BssHII-PvuII-PstI,BssHII-PstI-PvuII, Bio14.6, ACN, etc. About 500 polytypes were identified, mated, and collected. The genetic linkage Map Manager is used at a minimum frequency, and more than 90% of the total length of the map is about 1300cM. 27 pieces of paper, paper [Conclusion] The RLGS spot mapping method was used to analyze the polymorphism between species. The results and causes of this disease are determined by the analysis of genetic data.