RLGS法を用いたマウスインプリント遺伝子の系統的探索

使用RLGS方法系统搜索小鼠印记基因

• 批准号: 07282222
• 负责人: 林崎 良英
• 金额: $ 1.34万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1995
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1995 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-07282222/
• 关键词: ゲノムインプリンティング; RLGS; CpG island; くり返し配列; cdc25Mm; U2afbp-ts

本年度はメチル化インプリント座位のスクリーニングを行った。前年度までに報告した結果に加え、更にlandmark座位にNotI,Bss-II,EagIを、C57BL/6JとPWK(Mus musculus musculus)の交配を用いて全CpG islandの約35%まで範囲を拡げスクリーニングを行った。その結果、新たな5つのcandidate imprinted spotsを同定した。また、これまでにスクリーニングの結果を報告したcandidate spotsの内、マウス第9染色体にマップされたIrlgs3よりインプリント遺伝子cdc25Mmを同定した。Irlgs3は母方由来で脱メチル化し父方由来でメチル化するNotI座位であった。Irlgs3に相当するゲノムDNA断片をRLGSゲルからクローニングし、この領域を含むcosmid,P1クローンを単離し転写単位の検索を行った。exon trapの結果ras activatorであるマウスcdc25Mm遺伝子を同定し、その発現が父方由来の染色体特異的であることを示した。また、Irlgs3のNotI座位の近傍には41bp単位のtandem repeatが40回見出され、U2afbp-rsと共通構造としてメチル化インプリント座位近傍のくり返し配列がインプリントの制御に重要であると示唆された。このRLGS法を用いた系統的探索により、これまで2つマウスインプリント遺伝子を同定しており有効なストラテジーと考えられる。

For the current year, メチ メチ メチ will be used to create プリ プリ ト ト seats in ス ス リ ニ ニ グを グを グを った rows った. Report before the annual ま で に し た result に え, more に landmark seat に NotI, Bss - II, EagI を, C57BL / 6 j と PWK (Mus musculus musculus) の を mating with い て CpG island ニ about 35%まで size 囲を拡げス リ リ ニ ニ グを グを lines った. The そ そ result, the new たな5 たな <s:1> candidate imprinted spotsを are the same as the <s:1> た. ま た, こ れ ま で に ス ク リ ー ニ ン グ の results を reports し た candidate spots within の, マ ウ ス chromosome 9 に マ ッ プ さ れ た Irlgs3 よ り イ ン プ リ ン ト heritage 伝 son cdc25Mm を be し た. Irlgs3 origin of the mother で separation メチ sententization origin of the father でメチ sententization するNotI seat であった. Irlgs3 に quite す る ゲ ノ ム DNA fragment を RLGS ゲ ル か ら ク ロ ー ニ ン グ し, こ を の field containing む cosmid, P1 ク ロ ー ン を 単 from し planning write 単 の 検 cable line を っ た. Exon trap の results ras activator で あ る マ ウ ス cdc25Mm posthumous son 伝 を with し, そ の 発 now が paternal origin の chromosome specific で あ る こ と を shown し た. ま た, Irlgs3 の の NotI seat near alongside に は. 41 bp 単 の tandem repeat が 40 toodles out さ れ, common U2afbp - rs と structure と し て メ チ ル change イ ン プ リ ン ト seat near alongside の く り return し match column が イ ン プ リ ン ト の suppression に important で あ る と in stopping さ れ た. を こ の RLGS method with い た system exploration に よ り, こ れ ま で 2 つ マ ウ ス イ ン プ リ ン ト heritage 伝 を son be し て お り have sharper な ス ト ラ テ ジ ー と exam え ら れ る.

项目成果

Okazaki Y.: "An expanded system of restriction landmark genomic scanning(RLGS Ver.1.8)" Electrophoresis. 16. 197-202 (1995)

Okazaki Y.：“限制性标志基因组扫描的扩展系统（RLGS Ver.1.8）”电泳。

Ohsumi T.: "A spot cloning method for restriction landmark genomic scanning" Electrophoresis. 16. 203-209 (1995)

Ohsumi T.：“用于限制性标志基因组扫描的点克隆方法”电泳。

Plass C.: "Comparative analysis of mouse NotI linking clones with mouse and human genomic sequences and transcripts" DNA Res.2. 27-35 (1995)

Plass C.：“小鼠 NotI 连接克隆与小鼠和人类基因组序列和转录物的比较分析”DNA Res.2。

Okuizumi H.: "A single gel analysis of 573 dominant and codominant restriction landmark genomic scanning loci in mice interspecific backcross progeny" Electrophoresis. 16. 253-260 (1995)

Okuizumi H.：“对小鼠种间回交后代中 573 个显性和共显性限制性标志性基因组扫描位点进行单凝胶分析”电泳。

Watanabe s.: "Accessibility to tissue-specific genes from methylation profiles of mouse brain genomic DNA" Electrophoresis. 16. 218-226 (1995)

Watanabe s.：“从小鼠大脑基因组 DNA 的甲基化谱中获取组织特异性基因”电泳。