课题基金 / 基金详情

時分割ラウエ法による酵素反応機構の動的解析実験法の開発

時分割ラウエ法による酵素反応機構の動的解析実験法の開発
时间分辨劳厄法动态分析酶反应机理实验方法的开发
批准号:
08214204
负责人:
畑 安雄
金额:
$0.77万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1996
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1996 至 --

项目摘要

项目成果

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これまでに、470アミノ酸残基からなるセラライシン族亜鉛プロテアーゼである緑膿菌アルカリプロテアーゼの立体構造を決定し、N末端側活性ドメインとC末端側βヘリックスドメインの二つのドメインからなる分子であることを明らかにしてきた。結晶学的解析の次の段階として、阻害剤との複合体の構造を解析し、酵素自身の構造と比較して得られる構造変化に基づいて反応機構解析を行うのが通常の方法である。しかし、阻害剤を用いる方法を動的結晶構造解析に適用することはできない。そこで、反応機構を動的結晶解析により研究するため、pHジャンプによるトリガー法の開発を行うことにした。まず、動的解析の可能性を有する四残基からなるペプチド基質Z-A-G-G-L-OHと緑膿菌アルカリプロテアーゼとでペプチド基質を分解されない状態で酵素に結合させたミカエリスーメンテン型複合体結晶をpH5.6で調製し、その構造解析を行った。得られた結果は、pHジャンプ法での時分割結晶解析法を本複合体へ適用して酵素反応過程の動的研究を行うことの可能性を示唆するものであった。そこで、次に本複合体結晶のpHを結晶化pH(5.6)から至適pH(8.0)へジャンプさせて反応トリガーをかけることによって、この方法の適用を試みることにした。しかし、pHをジャンプさせることによる環境変化によって緑膿菌アルカリプロテアーゼの複合体結晶は溶解した。これを避けるためにグルタルアルデヒドによる結晶表面での分子間架橋法を用いることにし、条件検索を行った。その結果、0.25%グルタルアルデヒドに1時間浸漬して架橋した結晶の場合に得られたラウエ像は、この方法で調製した結晶の動的解析への適合性を支持するものであった。従って、この方法を用いれば、pHジャンプで白色ラウエ法による時分割動的結晶解析が可能になることが分かった。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Tamao Hisano: "Crystallization and Preliminary X-ray Crystallographic studies of L-2-Haloacid Dehalogenase From Pseudomonas SP.YL" PROTEINS : Structure,Function,and Genetics. 24. 520-522 (1996)
Tamao Hisano:“来自假单胞菌 SP.YL 的 L-2-卤酸脱卤酶的结晶和初步 X 射线晶体学研究”蛋白质:结构、功能和遗传学。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Tamao Hisano: "Crystal Structure of L-2-Haloacid Dehalogenase from Pseudomonas sp.YL" The Journal of Biological Chemistry. 271. 20322-20330 (1996)
Tamao Hisano:“来自假单胞菌 sp.YL 的 L-2-卤酸脱卤酶的晶体结构”生物化学杂志。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
古細菌2-オキソ酸:フェレドキシン酸化還元酵素群の構造生物学研究
  • 批准号:
    13033020
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $2.3万
  • 财政年份:
    2001
  • 负责人:
    畑 安雄
  • 依托单位:
古細菌2-オキソ酸:フェレドキシン酸化還元酵素群の構造生物学研究
  • 批准号:
    11169220
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 资助金额:
    $1.92万
  • 财政年份:
    1999
  • 负责人:
    畑 安雄
  • 依托单位:
亜鉛プロテアーゼの基質分解機構と反応中での亜鉛の役割に関する構造研究
  • 批准号:
    09235214
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $1.34万
  • 财政年份:
    1997
  • 负责人:
    畑 安雄
  • 依托单位:
亜鉛プロテアーゼの基質分解機構と反応中での亜鉛の役割に関する構造研究
  • 批准号:
    08249220
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $1.15万
  • 财政年份:
    1996
  • 负责人:
    畑 安雄
  • 依托单位:
海外基金