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放射光を利用した時間分割ラウエ法による酵素反応過程追跡実験法とトリガーの開発

放射光を利用した時間分割ラウエ法による酵素反応過程追跡実験法とトリガーの開発
开发使用同步辐射的时间分辨劳厄法跟踪酶反应过程的实验方法和触发器
批准号:
08214202
负责人:
原田 繁春
金额:
$0.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1996
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1996 至 --

项目摘要

项目成果

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どのような構造変化をしながら蛋白質は機能しているのか、すなわち蛋白質が関わっている反応中間体の構造を時間分割ラウエ法を使ってX線結晶構造解析法で決定するための実験法の開発を行った。本研究ではアルカリプロテアーゼ(A)を研究対象とし、APの酵素活性がほとんどないpH4でAP・基質複合体結晶を調製した。この結晶のpHを5.5に上げると基質の種類によっては分オーダーのターンオーバー時間で反応が進行することが期待できる。そこで、まずpHを変化させるために使用するフローセルを試作・改良し実用化した。次にこのフローセルを使ってAP・基質複合体結晶のpHを4から5.5にジャンプさせた後、一定時間毎に(3、5、7、20分後)回折強度を測定した。X線源には高エネルギー研究所放射光実験施設のシンクロトロン放射光から得られる白色X線を使い、BL18Bに設置されているラウエカメラでイメージングプレート上にX線回折パターンを記録した。白色X線は単色化したX線に比べて非常に大きなエネルギーを持ち、結晶に致命的なダメ-ジを与えることがしばしばあるが、結晶化法の改良やアルミ吸収板を使うことでAP・基質複合体結晶はダメ-ジを受けずにデータ測定ができた。データ処理を行った結果、completenessが50%、Rmergeが10%前後の精度の回折強度データが得られた。データベースに登録されているAPの座標を使って差フーリエ図計算したところ、AP-VAAF複合体では3分と20分後のフーリエ図は明らかな違いを示していた。また、pH4のままで測定したAP-ZGGA複合体結晶の回折強度データからはZGGAと考えられる電子密度を活性部位に見ることができた。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Genji Kurisu: "Structure of the zinc endoprotease from Streptomyces caespitosus" Journal of Biochemistry. (印刷中). (1997)
Genji Kurisu:“来自链霉菌的锌内切蛋白酶的结构”生物化学杂志(1997 年)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Genji Kurisu: "A fow cell suitable for time-resolved X-ray crystallography by the Laue method" Journal of Applied Crystallography. (印刷中). (1997)
Genji Kurisu:“适用于劳厄法时间分辨 X 射线晶体学的流池”《应用晶体学杂志》(出版中)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Genji Kurisu: "Characterization of a small metalloprotease from Streptomyces caespitosus with high specificity to aromatic residues" Journal of Fermentation and Bioengineering. (印刷中). (1997)
Genji Kurisu:“对芳香族残基具有高特异性的来自链霉菌的小型金属蛋白酶的表征”《发酵与生物工程杂志》(1997 年出版)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
アフリカ型トリパノソーマ由来グリセロールキナーゼを標的にした阻害剤の論理的開発
  • 批准号:
    12F02102
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.47万
  • 财政年份:
    2012
  • 负责人:
    原田 繁春
  • 依托单位:
ウシ心筋ミトコンドリア電子伝達系に存在する膜蛋白質会合体の構造研究
  • 批准号:
    19036010
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $4.22万
  • 财政年份:
    2007
  • 负责人:
    原田 繁春
  • 依托单位:
膜結合性コハク酸ユビキノン酸化還元酵素複合体のX線結晶解析
  • 批准号:
    16048203
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $2.3万
  • 财政年份:
    2004
  • 负责人:
    原田 繁春
  • 依托单位:
膜結合性コハク酸ユビキノン酸化還元酵素複合体のX線構造解析
  • 批准号:
    13033006
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $2.3万
  • 财政年份:
    2001
  • 负责人:
    原田 繁春
  • 依托单位: