课题基金 / 基金详情

タンパク質の立体構造に基づく超分子形成の分子機構の解明

タンパク質の立体構造に基づく超分子形成の分子機構の解明
基于蛋白质三维结构阐明超分子形成的分子机制
批准号：
08219226
负责人：
三木 邦夫
金额：
$1.34万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1996
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1996 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08219226/
关键词：
X線結晶解析立体構造抗腫瘍抗生物質DNA切断エンジイン型クロモフォア

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究は,天然超分子タンパク質の立体構造をX線結晶構造解析で決定し,超分子形成の必然性,超分子形成の機構などを,決定されたタンパク質の分子構造から理解しようとするものである.本年度は主にタンパク質性抗腫瘍抗生物質C-1027のX線結晶構造解析について研究を進めた.放線菌が産出する抗腫瘍抗生物質C-1027は,分子量約10,000のアポタンパク質とエンジイン型化合物であるクロモフォアからなり,これが属するネオカルチノスタチン族の中でも特に高い抗腫瘍活性を示す。DNA切断活性はクロモフォアにあるが,アポタンパク質はクロモフォアのキャリアとして働き,また,標的細胞の表面タンパク質を認識すると考えられている.昨年度までに,アポタンパク質の構造解析をほぼ完了し,今年度は主としてアポタンパク質-芳香環化クロモフォア複合体の構造解析を遂行した。2-メチル-2,4-ペンタンジオールを沈澱剤として得られた結晶は斜方晶系で,空間群P212121,格子定数はa=23.2,b=59.4,c=66.2Åである。高エネルギー物理学研究所のシンクロトロン放射光を用いて回折強度測定を行い,1.8Å分解能までのデータを集積した.アポタンパク質の分子構造をモデルとする分子置換法によって構造解析が成功し,芳香環化クロモフォア複合体についても,アポタンパク質のループの部分に明確な電子密度図を確認して,その完全な構造を決定することができた.現在,結晶学的R値も20%以下になっている.クロモフォアは,水素結合と疎水性相互作用によってアポタンパク質部分に結合しており,そのエンジイン骨格が外部からの反応を受けることから防御される構造をとっていることがわかった.また,このクロモフォア結合によるアポタンパク質部分の構造変化は小さいこともわかった.
英文摘要
本研究は,天然超分子タンパク質の立体構造をX線結晶構造解析で決定し,超分子形成の必然性,超分子形成の機構などを,決定されたタンパク質の分子構造から理解しようとするものである.本年度は主にタンパク質性抗腫瘍抗生物質C-1027のX線結晶構造解析について研究を進めた.放線菌が産出する抗腫瘍抗生物質C-1027は,分子量約10,000のアポタンパク質とエンジイン型化合物であるクロモフォアからなり,これが属するネオカルチノスタチン族の中でも特に高い抗腫瘍活性を示す。DNA切断活性はクロモフォアにあるが,アポタンパク質はクロモフォアのキャリアとして働き,また,標的細胞の表面タンパク質を認識すると考えられている.昨年度までに,アポタンパク質の構造解析をほぼ完了し,今年度は主としてアポタンパク質-芳香環化クロモフォア複合体の構造解析を遂行した。2-メチル-2,4-ペンタンジオールを沈澱剤として得られた結晶は斜方晶系で,空間群P212121,格子定数はa=23.2,b=59.4,c=66.2Åである。高エネルギー物理学研究所のシンクロトロン放射光を用いて回折強度測定を行い,1.8Å分解能までのデータを集積した.アポタンパク質の分子構造をモデルとする分子置換法によって構造解析が成功し,芳香環化クロモフォア複合体についても,アポタンパク質のループの部分に明確な電子密度図を確認して,その完全な構造を決定することができた.現在,結晶学的R値も20%以下になっている.クロモフォアは,水素結合と疎水性相互作用によってアポタンパク質部分に結合しており,そのエンジイン骨格が外部からの反応を受けることから防御される構造をとっていることがわかった.また,このクロモフォア結合によるアポタンパク質部分の構造変化は小さいこともわかった.
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会议论文
放射光と中性子の連携利用による電子伝達タンパク質の精密構造解析
  • 批准号：
    20K06523
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额：
    $2.75万
  • 财政年份：
    2020
  • 负责人：
    三木 邦夫
  • 依托单位：
    Kyoto University
DnaK分子シヤペロンによるDNA複製開始タンパク質の活性化過程の解明
  • 批准号：
    17028029
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $3.2万
  • 财政年份：
    2005
  • 负责人：
    三木 邦夫
  • 依托单位：
    Kyoto University
分子シャペロンによるDNA複製開始タンパク質(RepE)の活性化の分子機構:repE遺伝子の転写、翻訳、活性化過程におけるシャペロンの働きとRepE-シャペロン複合体の構造解析
  • 批准号：
    15032223
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $4.22万
  • 财政年份：
    2003
  • 负责人：
    三木 邦夫
  • 依托单位：
    Kyoto University
高エネルギーX線によるXe,Csを用いた多波長異常分散(MAD)法
  • 批准号：
    14658216
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.43万
  • 财政年份：
    2002
  • 负责人：
    三木 邦夫
  • 依托单位：
    Kyoto University
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