次世代大型放射光SPring-8タンパク質結晶解析ビームラインの性能評価
下一代大型同步辐射SPring-8蛋白晶体分析光束线性能评估
基本信息
- 批准号:09878142
- 负责人:
- 金额:$ 1.28万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
- 财政年份:1997
- 资助国家:日本
- 起止时间:1997 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
次世代の大型放射光施設として,兵庫県・播磨科学公園都市に8GeVのエネルギーを持つSPring-8が建設され,タンパク質結晶解析用共同利用ビームライン(BL41XU)の利用が開始された.これまでに全く経験のない超高輝度高エネルギーX線を用いて,タンパク質結晶学の研究を遂行する場合,高エネルギーX線によるタンパク質結晶の急激な劣化・損傷の防止,測定時間の大幅な短縮に基づく二次元回折計の特性向上の必要性など,予想を超える実験上の問題が生じる可能性を否定できない.本研究では,SPring-8のタンパク質結晶解析用共同利用ビームラインを利用したタンパク質結晶からの回折強度測定を実際に行い,従来の放射光を利用したデータと比較検討することでその性能評価を行い,実際の利用で生じた諸問題の解決に取り組んだ.このビームラインにおける回折強度測定を、ラン色細菌Anacystis nidulansの光回復酵素,光合成細菌Chromatium tepidumの反応中心複合体などの結晶を用いて実際に行った結果,次のようなことが明らかになった.1)強度,集光性など,ビームの特性は予想を上まわる優れたものであった.ラン色細菌の光回復酵素,光合成細菌の反応中心複合体のいずれでも2A分解能を越える回折が観測でき,これらは従来の放射光を用いた実験結果を凌ぐものであった.しかしながら,ビームラインの立ち上げ時の問題から,電子密度の質,最終構造を精密化した時の結晶学的R値などによる比較には至らなかった.2)放射線によるタンパク質結晶の急激な劣化の問題は深刻で,タンパク質結晶を凍結して行う極低温での測定は不可欠であり,凍結溶剤の検索など技術開発の重要性が再認識された.結論としては,Spring-8のタンパク質結晶学研究への有効性,重要性が明確になり,今後ビームラインにおける測定の自動化などの改良を行うことによって,その利用への重要性はさらに大きくなるものと思われる.
Nextgen の large radiation light facilities と し て, hyogo, 県 sowing grinding science park, urban に 8 gev の エ ネ ル ギ ー を hold つ SPring - 8 が construction さ れ, タ ン パ ク mass crystallization of common used for parsing ビ ー ム ラ イ ン (BL41XU) の using が began さ れ た. こ れ ま で に full く 経 験 の な い ultra high luminance エ ネ ル ギ ー X-ray を い て, タ ン パ ク qualitative research crystallography の を carries out す る occasions, high エ ネ ル ギ ー X-ray に よ る タ ン パ ク mass crystallization の nasty shock な の prevent deterioration, damage, short test time の な significantly shrink に base づ く secondary yuan inflexion meter の necessity upward の な ど, to think を え る be 験 が の problem in raw じ る possibility を negative で き な い. This study で は, SPring - 8 の タ ン パ ク mass crystallization of common used for parsing ビ ー ム ラ イ ン を using し た タ ン パ ク mass crystallization か ら の inflexion strength measurement を be interstate に い, 従 to の ray を using し た デ ー タ と compare beg す 検 る こ と で そ の performance evaluation 価 を い, be interstate の using で raw じ た the の solve に group take り ん だ. こ <s:1> ビ ムラ ムラ ムラ <s:1> における における determination of fold strength を, ラ chromogenic bacteria Anacystis nidulans <s:1> photoresetting enzyme, photosynthetic bacteria Chromatium Tepidum の anti 応 center complex な ど の crystallization を with い て be interstate に line っ た results, time の よ う な こ と が Ming ら か に な っ た. 1) strength, set optical な ど, ビ ー ム の features は to want to ま を わ る optimal れ た も の で あ っ た. ラ ン reply の light color bacteria enzyme, photosynthetic bacteria の anti 応 center complex の い ず れ で も 2 a decomposition can を more え る inflexion が 観 measuring で き, こ れ ら は 従 to の radiation light を using い た be 験 results を ling ぐ も の で あ っ た. し か し な が ら, ビ ー ム ラ イ ン の stand on ち げ の question か ら, electron density の is qualitative, finally constructing を motors し た when の crystallography R nt な ど に よ る compare に は to ら な か っ た. 2) the radiation に よ る タ ン パ ク junction Crystal の nasty shock な degradation の problem は で profoundly, タ ン パ ク mass freezing crystallization を し て line う extremely low temperature で の determination は not owe で あ り, frozen soluble tonic の 検 cable な ど technology open 発 の importance が reinterprets さ れ た. Conclusion と し て は, Spring - 8 の タ ン パ ク qualitative research crystallography へ の is sharper, importance が clear に な り, future ビ ー ム ラ イ ン に お け る determination の automation な ど の improved line を う こ と に よ っ て, そ の using へ の importance は さ ら に big き く な る も の と think わ れ る.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
N.Kamiya et al.: "Bio-Crystallography" SPring-8 Annual Report 1997. (印刷中). (1998)
N. Kamiya 等人:“生物晶体学”SPring-8 年度报告 1997 年。(印刷中)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
三木 邦夫其他文献
超好熱性アーキア Thermococcus kodakarensis 由来ボキナーゼファミリータンパク質TK2285の機能解析
超嗜热古菌Thermococcus kodakarensis的bokinase家族蛋白TK2285的功能分析
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
佐藤 喬章;藤橋 雅宏;宮本 幸花;三木 邦夫;跡見 晴幸 - 通讯作者:
跡見 晴幸
超好熱性アーキア由来 ribokinase family タンパク質の機能解析
超嗜热古菌核糖酶家族蛋白的功能分析
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
佐藤 喬章;藤橋 雅宏;宮本 幸花;桑田 啓子;日下 絵里子;藤田 春雄;三木 邦夫;跡見 晴幸 - 通讯作者:
跡見 晴幸
超好熱性アーキアにおけるmyo-inositol kinaseの同定と解析
超嗜热古菌肌醇激酶的鉴定与分析
- DOI:
- 发表时间:
2016 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
佐藤 喬章;藤橋 雅宏;永田 隆平;宮本 幸花;桑田 啓子;日下 絵里子;藤田 春雄;三木 邦夫;跡見 晴幸 - 通讯作者:
跡見 晴幸
PETをたべるバクテリア
吃 PET 的细菌
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
佐藤 喬章;藤橋 雅宏;永田 隆平;宮本 幸花;桑田 啓子;日下 絵里子;藤田 春雄;三木 邦夫;跡見 晴幸;吉田昭介 - 通讯作者:
吉田昭介
三木 邦夫的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('三木 邦夫', 18)}}的其他基金
放射光と中性子の連携利用による電子伝達タンパク質の精密構造解析
使用同步加速器辐射和中子对电子转移蛋白进行精确结构分析
- 批准号:
20K06523 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
DnaK分子シヤペロンによるDNA複製開始タンパク質の活性化過程の解明
DnaK 分子 shaperone 阐明 DNA 复制起始蛋白的激活过程
- 批准号:
17028029 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
分子シャペロンによるDNA複製開始タンパク質(RepE)の活性化の分子機構:repE遺伝子の転写、翻訳、活性化過程におけるシャペロンの働きとRepE-シャペロン複合体の構造解析
分子伴侣激活DNA复制起始蛋白(RepE)的分子机制:repE基因转录、翻译和激活过程中的伴侣功能以及RepE-伴侣复合物的结构分析
- 批准号:
15032223 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
高エネルギーX線によるXe,Csを用いた多波長異常分散(MAD)法
使用高能 X 射线使用 Xe 和 Cs 的多波长反常色散 (MAD) 方法
- 批准号:
14658216 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
耐熱性光合成細菌Chromatium Tepidum反応中心タンパク質の機能・構造解析
耐热光合细菌Chromatium Tepidum反应中心蛋白的功能和结构分析
- 批准号:
98F00450 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
次世代大型放射光SPring-8での超分子タンパク質結晶学研究の確立
下一代大型同步辐射SPring-8超分子蛋白质晶体学研究的建立
- 批准号:
10878111 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
テトラサイクリン/プロトンアンチポ-タの結晶化とX線構造解析
四环素/质子反向转运蛋白的结晶和X射线结构分析
- 批准号:
08268224 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
タンパク質の立体構造に基づく超分子形成の分子機構の解明
基于蛋白质三维结构阐明超分子形成的分子机制
- 批准号:
08219226 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
テトラサイクリン/プロトンアンチポ-タの結晶化とX線構造解析
四环素/质子反向转运蛋白的结晶和X射线结构分析
- 批准号:
08268224 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
光回復酵素の結晶化とX線構造解析
光活化酶的结晶及X射线结构分析
- 批准号:
07255203 - 财政年份:1995
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
相似海外基金
SPring-8を利用したアキレス腱付着部の3次元構造変化とその力学的特性の解明
使用 SPring-8 阐明跟腱附件的三维结构变化和机械性能
- 批准号:
22K11299 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Species identification of burnt bones excavated from Fukui Cave in the Incipient Jomon period using micro-CT at SPring-8
使用 SPring-8 的显微 CT 对福井洞窟初期绳文时代出土的烧骨进行物种鉴定
- 批准号:
18K18533 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Study of alpha-synuclein propagation by in vivo structural analysis at SPring-8
通过 SPring-8 体内结构分析研究 α-突触核蛋白增殖
- 批准号:
16K09716 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Development of high harmonic beamline with high photon flux comparable to SPring-8
开发出可与 SPring-8 相媲美的高光子通量的高谐波光束线
- 批准号:
23654140 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Inner structure of primitive fossil flowers of early Angiosperms from Upper Cretaceous by the synchrotron radiation facility (Spring-8)
同步辐射装置(Spring-8)研究上白垩纪早期被子植物原始花化石的内部结构
- 批准号:
21570092 - 财政年份:2009
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Two peer-approved experiments at SPring-8: the Fermi surface of Co-doped BaFe2As2 and the electron spin-density in the NbFe2 system
SPring-8 的两个同行认可的实验:共掺杂 BaFe2As2 的费米表面和 NbFe2 系统中的电子自旋密度
- 批准号:
EP/H009140/1 - 财政年份:2009
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Research Grant
Three peer-approved experiments at SPring-8: spin transitions in LaCoO3; magnetism in DyCo2; ferromagnetism and superconductivity at oxide interfaces
SPring-8 的三个同行批准的实验:LaCoO3 中的自旋跃迁;
- 批准号:
EP/F062729/1 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Research Grant
Development of novel methods to diagnose cardiovascular diseases with synchrotron radiation in SPring-8
SPring-8开发同步辐射诊断心血管疾病的新方法
- 批准号:
19590817 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Development of the Gamma-ray detector for the measurement of helicity dependent photo-absorption cross-section for the nucleon at SPring-8.
开发伽马射线探测器,用于测量 SPring-8 核子的螺旋度相关光吸收截面。
- 批准号:
18540249 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Development of Micromechanics-basd Elasto-plastic Constitutive Model for Granular Materials and its validation using SPring-8 Micro X-ray CT experiments
基于微力学的颗粒材料弹塑性本构模型的开发及其使用 SPring-8 显微 X 射线 CT 实验的验证
- 批准号:
18560481 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 1.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)