異物、薬物排出ポンプ蛋白の結晶解析と機能
異物、薬物排出ポンプ蛋白の結晶解析と機能
批准号:
13033038
负责人:
中江 太治
金额:
$2.05万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2002
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英文摘要
病院内感染起因菌の一つである緑膿菌は、構造的にまた作用機作の上からも異なる多くの抗生物質に耐性を示す。この低特異的抗生物質耐性の主たる原因は、この菌がMexAB-OprM異物・抗生物質排出ポンプを発現することに原因している。本研究ではこの異物・抗生物質排出ポンプの作動を明らかとするためポンプサブユニットの結晶回析及び作動機序の研究を行った。ポンプサブユニットの結晶解析に関しては、MexA及びOprMの結晶を取扱った。(i)MexAは元来内膜に結合した膜蛋白であるが、膜結合部位であるN-末の脂肪酸を外したものの結晶化を行った。結晶はPhoton Factory放射光でOscillation angle 1度、カメラ長350mm、100k、distance 350mmでデータ収集を行った。その結果スペースグループP21、格子常数a=90 b=107 c=90Å、解像度3.5Åを得ている。現在のところ重金属置換体を作成中であり、Pt、Os、Sm、Cd、Trなどで安定的なデータが得られており解像度約3.5が恒常的に得られている。(ii)OprMは界面活性剤の存在下に結晶化をすすめており、得られている結果はrhombohedral型R32空間群に属しており、格子常数はa=b=85.24Å、c=1044.96Åである。放射光施設Spring8でのカメラ長350mm、Oscillation angle 1度、温度100k、波長0.9Åでの回析では約2.6Åの解像度を得ている。現在のところ位相を決定すべくHg、Pt及びTh置換体を調整して回析を行っているが、未だ位相の決定には到っていない。この結晶は格子常数c値が高いことから解析の困難さが予想されるが、遠からず構造が解けるものと考えられる。(iii)その他排出ポンプの作動機序の解明のため(a)MexBサブユニットのTMS-4と-10の相互作用の実験、(b)MexEF-OprNポンプの集合体形成及びbiogenesisの実験及び、(c)排出ポンプとDNA-gyrase共役によるキノロン剤高度耐性の機序の解析などを行い各々に成果を得た。
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Guan, L.: "Identification of essential charged residues in transmembrane segments of the multidrug transporter MexB of Pseudomonas aeruginosa"Journal of Bacteriology. 183. 1734-1739 (2001)
管,L.:“铜绿假单胞菌多药转运蛋白 MexB 跨膜片段中必需带电残基的鉴定”细菌学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Hroshi Yoneyama: "Second-site mutation restores the transport defect caused by the transmembrane domain mutation of the xenobiotic transporter MexB in Pseudomonas aeruginosa"Biochemical and Biophysical Research Communications. 292. 513-518 (2002)
Hroshi Yoneyama:“第二位点突变恢复了铜绿假单胞菌中异生物质转运蛋白 MexB 跨膜结构域突变引起的转运缺陷”《生物化学和生物物理研究通讯》。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Taiji Nakae: "The topological localization of the subunit proteins of the three-component RND-efflux pump, MexAB-OprM in Pseudomonas aeruginosa"Proceedings of SPIE. 4625. 106-117 (2002)
Taiji Nakae:“铜绿假单胞菌中三组分 RND 外排泵 MexAB-OprM 亚基蛋白的拓扑定位”SPIE 论文集。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Saito, K.: "Molecular mechanism of MexR-mediated regulation of MexAB-OprM efflux expression in Pseudomonas aeruginosa"FEMS Microbiology Letters. 195. 23-28 (2001)
Saito, K.:“铜绿假单胞菌中 MexR 介导的 MexAB-OprM 外排表达调节的分子机制”FEMS 微生物学快报。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Shima Eda: "An elegant means of self-protection in gram-negative bacteria by recognizing and extruding xenobiotics from the periplasmic space"Journal of Biological Chemistry. 278. 2085-2088 (2003)
Shima Eda:“通过识别并从周质空间中挤出异生物质,是革兰氏阴性细菌自我保护的一种优雅方法”《生物化学杂志》。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 9 条
緑膿菌外膜の透過孔と抗生物質透過性の関連
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批准号:61570217
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1986
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负责人:中江 太治
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依托单位:
細胞外膜 PORIN を介しての透過の機序
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批准号:58480175
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$2.43万
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财政年份:1983
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负责人:中江 太治
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依托单位:
細菌外膜透過孔を介しての抗生物質及び栄養物の透過
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批准号:57570179
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1982
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负责人:中江 太治
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依托单位:
細菌外膜における担体による物質輸送-λ-receptor を介しての透過性-
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批准号:X00040----421334
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1979
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负责人:中江 太治
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依托单位:
細菌外膜に透過孔を形成するたん白質 porin の多様性およびその孔形成
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批准号:X00080----448157
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$2.37万
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财政年份:1979
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负责人:中江 太治
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依托单位:
細菌外膜における透過孔形成の研究
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批准号:X00040----321945
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$0.32万
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财政年份:1978
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负责人:中江 太治
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依托单位:
細菌外膜の構造、機能及びその再構成の研究
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批准号:X00080----248166
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1977
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负责人:中江 太治
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依托单位:
海外基金