X線解析を目指した多剤耐性ポンプMDR1の大量発現系の構築と結晶化
X線解析を目指した多剤耐性ポンプMDR1の大量発現系の構築と結晶化
批准号:
16659012
负责人:
加藤 博章
金额:
$2.18万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005
中文摘要
ヒトの多剤耐性ポンプMDR1を対象として、X線結晶構造解析を目的とした結晶化を達成することを目的として以下の研究を行なった。1.X線結晶解析に適したMDRl結晶の調製結晶化条件探索を広範囲に拡大するため、更なる大量生産系を構築した。すなわち、30リットル/1ヶ月の培養ペースで連続して安定な生産が可能になった。さらに、精製蛋白質の質的改善を目指し、構造安定性の向上に寄与する界面活性剤を検索した。約20種類の界面活性剤を検討した結果、1つの界面活性剤が新たに見つかった。一方、結晶化能を向上させると予想される2種類の部位特異的変異導入蛋白質を大量発現、精製することに成功した。得られた精製標品を用いて結晶化を行なったところ、微針状結晶からキューブ状の微結晶が得られた。しかし、X線を照射してもX線回折像は得られなかった。さらに改良を検討している。2.Fab複合体調製による結晶化の支援MDR1の細胞外ドメインに対するモノクローナル抗体を入手して検索した結果、立体構造特異的な結合をしていると示唆されるFab断片を得ることができた。そして、MDR1との複合体を形成していることがゲル濾過から示された。3.膜蛋白質の結晶化能を把握する手法の確立可溶性蛋白質では、精製した蛋白質溶液の動的光散乱分析により分子量分布の狭い試料は結晶化の可能性が高いことが知られている。そこで、膜タンパク質における同様の方法を検討した。その結果、電子顕微鏡を用いた蛋白質分子の直接観察およびゲル濾過法の利用により、界面活性剤の存在下でも分子量分布の広狭の違いを観測することが可能になった。
英文摘要
ヒトの多剤耐性ポンプMDR1を対象として、X線結晶構造解析を目的とした結晶化を達成することを目的として以下の研究を行なった。1.X線結晶解析に適したMDRl結晶の調製結晶化条件探索を広範囲に拡大するため、更なる大量生産系を構築した。すなわち、30リットル/1ヶ月の培養ペースで連続して安定な生産が可能になった。さらに、精製蛋白質の質的改善を目指し、構造安定性の向上に寄与する界面活性剤を検索した。約20種類の界面活性剤を検討した結果、1つの界面活性剤が新たに見つかった。一方、結晶化能を向上させると予想される2種類の部位特異的変異導入蛋白質を大量発現、精製することに成功した。得られた精製標品を用いて結晶化を行なったところ、微針状結晶からキューブ状の微結晶が得られた。しかし、X線を照射してもX線回折像は得られなかった。さらに改良を検討している。2.Fab複合体調製による結晶化の支援MDR1の細胞外ドメインに対するモノクローナル抗体を入手して検索した結果、立体構造特異的な結合をしていると示唆されるFab断片を得ることができた。そして、MDR1との複合体を形成していることがゲル濾過から示された。3.膜蛋白質の結晶化能を把握する手法の確立可溶性蛋白質では、精製した蛋白質溶液の動的光散乱分析により分子量分布の狭い試料は結晶化の可能性が高いことが知られている。そこで、膜タンパク質における同様の方法を検討した。その結果、電子顕微鏡を用いた蛋白質分子の直接観察およびゲル濾過法の利用により、界面活性剤の存在下でも分子量分布の広狭の違いを観測することが可能になった。
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DOI:
10.1038/sj.emboj.7600093
发表时间:
2004-02-25
期刊:
EMBO JOURNAL
影响因子:
11.4
作者:
[Matsubara, M, Nakatsu, T, Taniguchi, H]
通讯作者:
Taniguchi, H
DOI:
10.1016/j.bbamcr.2005.10.006
发表时间:
2005-12-15
期刊:
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR CELL RESEARCH
影响因子:
5.1
作者:
[Kashiwayama, Y, Asahina, K, Imanaka, T]
通讯作者:
Imanaka, T
DOI:
10.1021/bi0484522
发表时间:
2005-02
期刊:
Biochemistry
影响因子:
2.9
作者:
[T. Nakanishi;T. Nakatsu;M. Matsuoka;K. Sakata;H. Kato]
通讯作者:
T. Nakanishi;T. Nakatsu;M. Matsuoka;K. Sakata;H. Kato
DOI:
10.1038/sj.embor.7400113
发表时间:
2004-04-01
期刊:
EMBO REPORTS
影响因子:
7.7
作者:
[Ifuku, K, Nakatsu, T, Sato, F]
通讯作者:
Sato, F
DOI:
10.1038/nsmb781
发表时间:
2004-07-01
期刊:
NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY
影响因子:
16.8
作者:
[Uzumaki, T, Fujita, M, Ishiura, M]
通讯作者:
Ishiura, M
共 8 条
化学的捕捉による多剤排出輸送体の多様な動的基質認識メカニズムの分子構造基盤
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批准号:24K01637
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2024
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
国際緊急援助活動と日本外交―1987―1993
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批准号:15J02529
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2015
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
糖鎖修飾によるタンパク質構造安定化機構の構造生物学的研究
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批准号:17046008
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.2万
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财政年份:2005
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
ゲンジボタル・ルシフェラーゼ反応中間体アナログ複合体のX線結晶構造解析
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批准号:13024275
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2001
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
糖鎖が構造形成におよぼす要因の解析と膜タンパク質結晶化への応用
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批准号:13033044
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2001
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
ゲンジボタル・ルシフェラーゼ反応中間体アナログ複合体のX線結晶構造解析
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批准号:12045269
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2000
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
膜タンパク質結晶化の支援法の開発-ABCタンパク質を中心に
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批准号:11169222
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.66万
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财政年份:1999
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
X線結晶解析とタンパク質工学的方法によるアスパラギン合成酵素の活性中心の決定
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批准号:08660108
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1996
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
合成酵素によるATPの基質活性化機構-アスパラギン合成酵素のX線結晶解析
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批准号:07660110
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1995
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
迅速冷却によるグルタチオン合成酵素反応中の準安定構造のX線結晶解析
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批准号:06760085
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1994
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
γグルタミルシステイン合成酵素の機能改変
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批准号:03856028
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1991
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
グルタチオン合成酵素におけるフレキシブル・ループの機能解析
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批准号:02856027
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1990
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
グルタチオン合成酵素のX線結晶構造解析
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批准号:01760090
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1989
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负责人:加藤 博章
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依托单位:
海外基金