ES細胞を用いた未分化細胞が分化する過程の網羅的解析

利用ES细胞全面分析未分化细胞的分化过程

• 批准号: 14011259
• 负责人: 丹羽 仁史
• 金额: $ 3.07万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14011259/
• 关键词: ES細胞; 分化; マイクロアレイ

テトラサイクリンで転写因子Oct-3/4の発現を調節することが可能なES細胞ZHBTc4において、テトラサイクリン投与後0,24,48、72、96時間目の細胞からそれぞれRNAを精製し、これを始原生殖細胞由来cDNAマイクロアレイで解析し、全ての結果の収集を完了した(理化学研究所・阿部博士との共同研究)。一方で、これらのサンプルをNIHの洪博士との共同研究により、23K cDNAマイクロアレイを用いても解析を進めている。今後、全てのデータの収集が完了次第、その解析に着手する予定である。テトラサイクリンで転写因子Gata6の発現を調節することが可能なES細胞G6SKOについては、その発現によって誘導される細胞が壁側内胚葉であることを最終的に確認した(Fujikura J et al.,Genes Dev.,2002)ので、現在マイクロアレイ解析用の時系列RNAサンプルを収集している。また、最近ES細胞における遺伝子マーキングによる解析から、従来均一と考えられていたOct-3/4を発現する未分化細胞集団が、さらに遺伝子発現パターンの異なるサブグループに分離可能であることを見出した。現在、これらのサブグループを系統的に純化する方法の開発を進めており、その進捗を見た後に、マイクロアレイを用いた系統的遺伝子発現解析に進む予定である。マイクロアレイ法による遺伝子発現解析の有効性は、洪博士との共同研究によるES細胞とTS(trophoblast stem)細胞の遺伝子発現比較検討により確認することが出来ているので(Tanaka, TT et al., Genome Res.,2002)、今後同様の手法を用いた上記サンプルの解析結果から、細胞分化のメカニズムの一端が明らかにされるであろう。

It is possible to regulate the expression of Oct-3/4 in ES cells at 0, 24, 48, 72, and 96 hours after injection.(Joint research by Dr. Abe, Institute of Physical Chemistry) The 23K cDNA was analyzed by NIH. In the future, the collection of all data will be completed and the analysis will be carried out. It is possible that the expression of Gata6 in ES cells is regulated by the expression of Gata6 in ES cells (Fujikura J et al., Genes Dev., 2002), the current analysis of the time series RNA file collection. The most recent ES cells were found in undifferentiated cell populations, and the most recent ES cells were found in undifferentiated cell populations, and the most recent ES cells were found in undifferentiated cells. At present, the development of purification methods for this system is expected to progress after the analysis of the gene evolution of this system. A comparative study of gene expression in ES cells and TS(trophoblast stem) cells was carried out by Dr. Hong and Tanaka, TT et al., Genome Res., 2002)In the future, the same method will be used to record the analysis results of cell differentiation.

项目成果

Tateishi, S., et al.: "Enhanced genomic instability and defective postreplication repair in RAD18-knockout mouse embryonic stem cells"Mol Cell Biol. 23・2. 474-481 (2003)

Tateishi, S., et al.：“RAD18 敲除小鼠胚胎干细胞中基因组不稳定性增强和复制后修复缺陷”Mol Cell Biol. 23・2 (2003)。

Takashima, S., et al.: "Targeting of both mouse neuropilin-1 and neuropilin-2 genes severely impairs developmental yolk sac and embryonic angiogenesis"Proc Natl Acad Sci USA. 99・6. 3657-3662 (2002)

Takashima, S., et al.：“靶向小鼠神经毡蛋白-1 和神经毡蛋白-2 基因严重损害发育卵黄囊和胚胎血管生成”Proc Natl Acad Sci USA 99·6 (2002)。

Tanaka, T.T., et al.: "Gene expression profiling of embryo-derived stem cells reveals candidate genes associated with pluripotency and lineage specificity"Genome Res. 12・12. 1921-1928 (2002)

Tanaka, T.T., et al.：“胚胎干细胞的基因表达谱揭示了与多能性和谱系特异性相关的候选基因”Genome Res 12·12 (2002)。

Tomioka, M., et al.: "Identification of Sox-2 reguratory region which is under the control of Oct3/4-Sox-2 complex"Nucleic Acids Res. 30・14. 3202-3213 (2002)

Tomioka, M., et al.：“Oct3/4-Sox-2 复合体控制下的 Sox-2 调节区的鉴定”Nucleic Acids Res. 30・14 (2002)。

Niwa, H., et al.: "Phenotypic complementation establishes requirements for specific POU domain and generic transactivation function of Oct-3/4 in embryonic stem cells"Mol Cell Biol. 22・5. 1526-1536 (2002)

Niwa, H., et al.：“表型互补建立了胚胎干细胞中 Oct-3/4 的特定 POU 结构域和通用反式激活功能的要求”Mol Cell Biol. 22·5 (2002)。