アプタマー、Musashi及びhnRNP Dによる遺伝情報発現制御の分子基盤
アプタマー、Musashi及びhnRNP Dによる遺伝情報発現制御の分子基盤
批准号:
14035219
负责人:
片平 正人
金额:
$2.05万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 --
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HIVのTatタンパク質に対して高い親和性を示すRNAアプタマーに関し、Tatタンパク質のアナログ分子(アルギニンリッチモチーフ領域の部分ペプチド)との複合体の立体構造を、NMRにより決定した。得られた構造より、高い親和性がもたらされるメカニズムが解明された。さらに遺伝子治療等に応用できる可能性のある、より有用なRNA分子への改変の指針も獲得された。Musashiタンパク質の2つのRNA結合ドメインに関し、立体構造、ダイナミクス及び表面電荷分布を、NMR及びモデルフリー解析により決定した。この結果、RNAへの結合能が2つのドメインで異なるのは、ダイナミクス及び表面電荷の違いに由来する事が明らかになった。また2つのドメインを連結したものに関しても、標的RNAとの相互作用様式を解析した。その結果、各ドメイン単独の時と同様に連結体においてもβシート上で相互作用を行うが、さらにこれに加えて、ドメインをつなぐリンカー部分でも相互作用がなされている事がわかった。hnRNP Dタンパク質及び類縁のhnRNP A1タンパク質には、DNAの4重鎖構造をほどいて1本鎖にする活性がある事を、CD及びNMRによる解析より見い出した。そして両タンパク質のこの作用によって、DNAの複製やテロメアの伸長が保障されている事が生化学的実験よりわかった。即ち、両タンパク質には、DNAの構造を正しい姿に整形する、あたかも「DNAシャペロン」の様な活性がある事が見い出された。両タンパク質のDNAシャペロンとしての働きは、創薬に利用できる可能性がある。
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Liu, H.: "Quadruplex structures of RNA 14-mer, r(GGAGGUUUUGGAGG) and DNA 14-mer, d(GGAGGTTTTGGAGG)"Nucleic Acids Res Suppl.. 2. 177-178 (2002)
Liu, H.:“RNA 14 聚体,r(GGAGGUUUUGGAGG) 和 DNA 14 聚体,d(GGAGGTTTTGGAGG) 的四联体结构”《核酸研究增刊》2. 177-178 (2002)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
片平正人: "GGAトリプレットDNAが形成する特異な高次構造とその生物学的な意義"蛋白質核酸酵素. 47. 139-144 (2002)
Masato Katahira:“GGA三联体DNA形成的特殊高阶结构及其生物学意义”蛋白质核酸酶47. 139-144(2002)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Matsugami, A.: "Structural basis of the highly efficient trap of an HIV Tat protein by a new RNA aptamer"Structure. (in press). (2003)
Matsugami, A.:“新型 RNA 适体高效捕获 HIV Tat 蛋白的结构基础”结构。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Matsugami, A.: "Unique quadruplex structures of d(GGA)4 (12-mer) and d(GGA)8 (24-mer)-direct evidence of the formation of non-canonical base pairs and structural comparison"Nucleic Acids Res. Suppl.. 2. 49-50 (2002)
Matsugami, A.:“d(GGA)4(12-mer)和 d(GGA)8(24-mer)的独特四链体结构 - 非规范碱基对形成的直接证据和结构比较”核酸研究
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
片平正人(分担): "NMR分光法"学会出版センター. 269 (2003)
Masato Katahira(撰稿人):《NMR 光谱》学会出版中心 269(2003 年)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 12 条
核酸の塩基対の開閉挙動及びリガンドとの相互作用の試験管内と生細胞中における違い
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批准号:23K27112
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$6.99万
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财政年份:2024
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负责人:片平 正人
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依托单位:
核酸の塩基対の開閉挙動及びリガンドとの相互作用の試験管内と生細胞中における違い
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批准号:23H02419
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$12.06万
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财政年份:2023
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负责人:片平 正人
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依托单位:
Structural basis of LLPS of RNA repeats related to neurodegenerative diseases
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批准号:20H03192
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.4万
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财政年份:2020
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负责人:片平 正人
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依托单位:
核酸4重鎖構造をベースにした核酸性イオンチャネルの創製
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批准号:19657034
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2007
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负责人:片平 正人
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依托单位:
ラフトタンパク質PFOの構造・相互作用解析と核酸性イオンチャネルの創製
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批准号:19036026
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2007
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负责人:片平 正人
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依托单位:
結合蛋白質によるテロメア長制御の構造基盤の解明と癌治療に向けたデコイ法の試み
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批准号:18011008
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.54万
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财政年份:2006
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负责人:片平 正人
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依托单位:
ラフトのコレステロールに結合するPFOタンパク質の構造遷移と相互作用様式の解明
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批准号:17048009
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.1万
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财政年份:2005
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负责人:片平 正人
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依托单位:
hnRNP A1/D、Musashi及びアプタマーによる遺伝情報制御の分子基盤
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批准号:17026011
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.58万
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财政年份:2005
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负责人:片平 正人
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依托单位:
機能性脂質ドメイン(ラフト)におけるコレステロールとタンパク質の相互作用の解析
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批准号:16048209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2004
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负责人:片平 正人
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依托单位:
hnRNP D、FMRP及びアプタマーによる遺伝情報発現制御の分子基盤
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批准号:15030214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.1万
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财政年份:2003
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负责人:片平 正人
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依托单位:
カリウムイオンが誘起するDNA4重鎖構造とテロメア配列結合性蛋白質によるその破壊
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批准号:11116208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1999
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负责人:片平 正人
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依托单位:
カリウムイオンによるDNAの構造遷移を利用したリボザイム活性のスイッチング
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批准号:10129205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:片平 正人
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依托单位:
カリウムが誘導する核酸の新規2重鎖-4重鎖転移及びリボザイムの構造化学的研究
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批准号:09235209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1997
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负责人:片平 正人
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依托单位:
亜鉛フィンガー蛋白質EIAと鉛リボザイムの生理機能発現機構の構造化学的研究
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批准号:08249212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:片平 正人
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依托单位:
アデニン-カルテットを含む新規核酸4重鎖構造の研究
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批准号:08680715
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:片平 正人
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依托单位:
新しいNMR技術を用いた鉛リボザイムの切断活性具現機構の構造的基盤の解明
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批准号:07680713
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1995
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负责人:片平 正人
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依托单位:
新型リボザイムにおける構造-活性相関及び非標準型塩基対形成能のNMRによる研究
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批准号:05780473
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1993
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负责人:片平 正人
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依托单位:
塩基配列に依存した核酸構造の多様性と蛋白質によるその識別
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批准号:01790611
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1989
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负责人:片平 正人
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依托单位:
海外基金