アプタマー、Musashi及びhnRNP Dによる遺伝情報発現制御の分子基盤
适体、Musashi 和 hnRNP D 控制遗传信息表达的分子基础
基本信息
- 批准号:14035219
- 负责人:
- 金额:$ 2.05万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2002
- 资助国家:日本
- 起止时间:2002 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
HIVのTatタンパク質に対して高い親和性を示すRNAアプタマーに関し、Tatタンパク質のアナログ分子(アルギニンリッチモチーフ領域の部分ペプチド)との複合体の立体構造を、NMRにより決定した。得られた構造より、高い親和性がもたらされるメカニズムが解明された。さらに遺伝子治療等に応用できる可能性のある、より有用なRNA分子への改変の指針も獲得された。Musashiタンパク質の2つのRNA結合ドメインに関し、立体構造、ダイナミクス及び表面電荷分布を、NMR及びモデルフリー解析により決定した。この結果、RNAへの結合能が2つのドメインで異なるのは、ダイナミクス及び表面電荷の違いに由来する事が明らかになった。また2つのドメインを連結したものに関しても、標的RNAとの相互作用様式を解析した。その結果、各ドメイン単独の時と同様に連結体においてもβシート上で相互作用を行うが、さらにこれに加えて、ドメインをつなぐリンカー部分でも相互作用がなされている事がわかった。hnRNP Dタンパク質及び類縁のhnRNP A1タンパク質には、DNAの4重鎖構造をほどいて1本鎖にする活性がある事を、CD及びNMRによる解析より見い出した。そして両タンパク質のこの作用によって、DNAの複製やテロメアの伸長が保障されている事が生化学的実験よりわかった。即ち、両タンパク質には、DNAの構造を正しい姿に整形する、あたかも「DNAシャペロン」の様な活性がある事が見い出された。両タンパク質のDNAシャペロンとしての働きは、創薬に利用できる可能性がある。
The stereostructure of the complex of the Tat protein with high affinity was determined by NMR. In order to improve the quality of the products, we should pay attention to the quality of the products. For example, if a gene therapy is used, it may be possible to modify the RNA molecule. Musashi's RNA binding properties are determined by the analysis of molecular structure, molecular structure, and surface charge distribution. As a result, the binding energy of RNA molecules varies from 2 to 3. The origin of RNA molecules and surface charges is clear. 2. Analysis of interaction patterns between target RNA and target RNA As a result, the interaction between each link and the interaction between each link and the interaction between each link is different. hRNP A1 DNA DNA The role of DNA replication and elongation in the development of biological processes That is to say, the structure of DNA is correct, and the activity of DNA is very important. The possibility of using the DNA of a human genome is discussed.
项目成果
期刊论文数量(24)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Liu, H.: "Quadruplex structures of RNA 14-mer, r(GGAGGUUUUGGAGG) and DNA 14-mer, d(GGAGGTTTTGGAGG)"Nucleic Acids Res Suppl.. 2. 177-178 (2002)
Liu, H.:“RNA 14 聚体,r(GGAGGUUUUGGAGG) 和 DNA 14 聚体,d(GGAGGTTTTGGAGG) 的四联体结构”《核酸研究增刊》2. 177-178 (2002)
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- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
片平正人: "GGAトリプレットDNAが形成する特異な高次構造とその生物学的な意義"蛋白質核酸酵素. 47. 139-144 (2002)
Masato Katahira:“GGA三联体DNA形成的特殊高阶结构及其生物学意义”蛋白质核酸酶47. 139-144(2002)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Matsugami, A.: "Structural basis of the highly efficient trap of an HIV Tat protein by a new RNA aptamer"Structure. (in press). (2003)
Matsugami, A.:“新型 RNA 适体高效捕获 HIV Tat 蛋白的结构基础”结构。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Matsugami, A.: "Unique quadruplex structures of d(GGA)4 (12-mer) and d(GGA)8 (24-mer)-direct evidence of the formation of non-canonical base pairs and structural comparison"Nucleic Acids Res. Suppl.. 2. 49-50 (2002)
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- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
片平正人(分担): "NMR分光法"学会出版センター. 269 (2003)
Masato Katahira(撰稿人):《NMR 光谱》学会出版中心 269(2003 年)。
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- 作者:
- 通讯作者:
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