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ラフトタンパク質PFOの構造・相互作用解析と核酸性イオンチャネルの創製

筏蛋白 PFO 的结构和相互作用分析以及核酸离子通道的创建

基本信息

批准号：
19036026
负责人：
片平正人
金额：
$ 4.16万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

(1)PFOタンパク質を用いたラフトの機能解析と構造解析に向けた基盤の確立PFOタンパク質のC末端側コレステロール結合ドメイン(D4)を、アルギニン法によってリフォールディングした。これによりコレステロール結合能を有するD4を調製することに成功した。この試料を用いてD4の共鳴線の帰属を進行させた。得られた帰属結果は、今後D4とコレステロールの膜中における相互作用をTCS法等によって解析する際に、基盤として利用する事ができる。(2)核酸性イオンチャンネル創製の試み4重鎖核酸構造の中にカリウムイオン等が結合している様子が、カリウムイオンチャネル中に同イオンが結合している様子によく似ている事から、核酸がイオンチャネルとして動作するのではないかと思い至った。異なる3種の実験系から、核酸を介したイオンの移動が生じている事を示唆する結果が得られた。(3)ロングレンジの構造情報を用いたマルチドメインからなるタンパク質の構造決定法の確立神経幹細胞の分化を制御するMusashiタンパク質は、タンデムに連なった2つのRNA結合ドメインを有している。常磁性緩和促進(PRE)と残余双極子結合(RDC)に基づいたロングレンジの構造情報を含めた結果、2つのドメインの相対配置に関して複合体中で十分な精度(r.m.s.d.0.7A以下)で決定できる事が分かった。(4)抗HlV活性を有するAPOBEC3Gタンパク質によるデアミネーション反応のリアルタイムモニタリングヒトのAPOBEC3Gタンパク質は、HIVが感染した際に生合成される同ゲノムのマイナス鎖DNAに作用し、シチジンをデアミネーションしてウリジンに変換する。これによってHIVのゲノム情報は不活化される為、APOBEC3Gは抗HIV活性を有する。APOBEC3Gの立体構造及び1本鎖DNAとの相互作用様式の決定を行なった。さらにAPOBEC3Gによるデアミネーション反応がNMR試料管内で生じ、それをNMRシグナルを用いてリアルタイムでモニターできる事を示した。1本鎖DNAに複数の反応部位が存在する場合、APOBEC3Gは3'→5'の順序をもってデアミネーション反応を進行させる事が分かった。

(1)PFO quality control system function analysis and structure analysis to establish the PFO quality control system C terminal side control system (D4), the PFO quality control system function analysis and structure analysis to establish the PFO quality control system C terminal side control system This is the first time that I've ever been able to do this. This sample was tested using the resonance line of D4. The results show that the interaction between the membrane and the substrate can be analyzed and utilized in the future. (2)4. The nucleic acid sequence is composed of four parts: the first part is composed of two parts: the second part is composed of two parts: the first part is composed of two parts: the first part is composed of two parts: the second part is composed of two parts: the first part is composed of two parts: the second part is composed of two parts: the first part is composed of two parts: the first part is composed of two parts: the second part is composed of two parts: the third part is composed of two parts: the third part is composed of two parts: the fourth part is composed of three parts: the fourth part is composed of two parts: the fourth part is composed of three parts: the fourth part is composed of four parts: the fourth part is composed of four parts: the fourth part is composed of three parts: the fourth part is composed of four parts: the fourth part is With these three different real-life systems, the result is that the movement of nucleic acids can occur. (3)The structure information of the stem cell is used to determine the differentiation of the stem cell. The structure determination method of the stem cell is used to determine the differentiation of the stem cell. The structure information of the base transition between permanent magnetic relaxation promotion (PRE) and residual dipole bonding (RDC) includes the results and the phase arrangement of the two transition elements. The accuracy of the determination is very high (r.m.s.d.0.7A or less) in the complex. (4)APOBEC3G has anti-HlV activity, and it can be used in the production of anti-HlV DNA, anti-HlV DNA and anti-HlV DNA. This information is not activated, APOBEC3G has anti-HIV activity. APOBEC3G 3D structure and the determination of interaction patterns between DNA and APOBEC 3G In addition, APOBEC3G can be used to detect and detect the occurrence of nuclear magnetic resonance (NMR) in the sample tube. 1. When there are multiple reverse sites in the DNA sequence, APOBEC3G is divided into 3'→5' reverse sites.