ジーントラップ・マイクロアレイによるマウス・ゲノムの網羅的な機能解析

使用基因捕获微阵列对小鼠基因组进行综合功能分析

基本信息

批准号：
16011237
负责人：
石田靖雅
金额：
$ 3.33万
依托单位：
Nara Institute of Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

ヒトやマウスのゲノム・プロジェクトの進展によって、近年おびただしい数の遺伝子が見出されつつあるが、いかにして効率良く、迅速にそれぞれの遺伝子の機能を解明して行くかが、我々に残された今後の大きな課題となっている。2004年9月、国際的な共同研究計画「The Knockout Mouse Project」が発表された。遺伝子トラップと遺伝子ターゲティングの手法を組み合わせ、マウスES細胞中の全遺伝子を今後5年以内に破壊するべく、世界中の研究者に協力が呼びかけられたのである。まずその初期段階では、遺伝子トラップの手法を用い、ES細胞中のできるだけ多くの遺伝子を迅速に破壊することが提唱されているが、現在多くの研究者は、特に同細胞中で発現されていない遺伝子をランダムなトラップによって確実に不活性化することは困難だと考えている。今回我々は、新たに開発した手法「UPATrap」を利用してnonsense-mediated mRNA decay (NMD)と呼ばれるmRNAサーベイランス機構を抑制すれば、遺伝子トラップのこの問題点を完全に克服することができる、という事実を見出した。我々が開発した新手法は、「The Knockout Mouse Project」の遂行にとり大きな障害となっているステップを乗り越えるのに役立つと考えられる。この「UPATrap」法により、標的遺伝子のスペクトラムとベクターの挿入部位の両者に「偏り」が存在しない理想的な遺伝子トラップを行い、トラップされた遺伝子断片を用いてマイクロアレイを作製した。このようなマイクロアレイを利用すれば、おびただしい数の遺伝子の機能を効率良く、迅速に解明することが可能になる。

随着人类和老鼠基因组项目的进步，近年来已经发现了大量基因，但是如何有效，快速阐明每个基因的功能是我们将来的主要挑战。 2004年9月，宣布了国际合作研究项目“淘汰鼠标项目”。已邀请世界各地的研究人员合作，将基因捕获和基因靶向技术结合起来，以在未来五年内破坏小鼠ES细胞中的所有基因。首先，在早期阶段，已提出使用基因捕获技术在ES细胞中迅速破坏尽可能多的基因，但是当今许多研究人员认为，很难通过随机捕获在同一细胞中可靠地灭活基因。我们发现，通过使用新开发的方法称为upatrap来抑制称为废话介导的mRNA衰变（NMD）的mRNA监视机制，可以完全克服基因陷阱的这个问题。我们开发的新方法将有助于我们克服已成为淘汰鼠标项目实施的主要障碍的步骤。这种“ upatrap”方法涉及理想的基因捕获，在靶基因谱和载体的插入位点都没有偏差，并使用捕获的基因片段创建了微阵列。使用此类微阵列可以有效，快速阐明大量基因的功能。