ゲノム全域罹患同胞対連鎖解析による心筋梗塞責任遺伝子座の同定

通过全基因组受影响的同胞对连锁分析鉴定导致心肌梗死的遗传位点

• 批准号: 16012223
• 负责人: 横田 充弘
• 金额: $ 4.03万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16012223/
• 关键词: 遺伝子; ゲノム; 心筋梗塞; 罹患同胞対; 連鎖解析; ポジショナル候補クローニング; 大規模関連解析

心筋梗塞・冠動脈疾患感受性遺伝子には人種差が存在し、しかも複数存在することが予想される。本研究の目的は、ゲノム全域を網羅する心筋梗塞・冠動脈疾患罹患同胞対連鎖解析により新たな感受性遺伝子領域を同定することである。本研究を達成するために、東海地区を中心とした名古屋大学、岐阜大学、名古屋市立大学、山形大学、藤田保健衛生大学医学部附属病院、浜松医科大学及び愛知医科大学附属病院、昭和大学藤ヶ丘病院を含む公的45協力病院を組織した。本研究は、我々が既に進めている心筋梗塞・冠動脈疾患・高血圧症等生活習慣病感受性遺伝子同定プロジェクトの1つとして行われる。本研究では、冠動脈疾患に関して我が国最初の全ゲノム罹患同胞対連鎖解析を用いて感受性遺伝子座を同定し、既に構築されいる大規模データベースを用いた候補遺伝子/症例-対照研究(ポジショナル候補クローニング)により感受性遺伝子の同定を試みる。平成16年12月末現在までに対照約10000名、心筋梗塞約6000名、その他の冠動脈疾患約7000名からなるゲノムDNA及び臨床データベースを構築した。研究推進の情報基盤の確立は順調に進んでいる。現在、心筋梗塞罹患同胞対201対のゲノムDNAを収集しておりサンプル収集は順調に進んでいる。心筋梗塞罹患同胞対109対を対象とした予備的連鎖解析では、1番染色体をはじめ7染色体において、LOD=2.0前後の連鎖領域を得ており、さらに、同胞対数を増加することにより、有意な染色体連鎖領域を同定することが可能であると考えている。なお、ゲノムDNA提供者に対しては、充分な説明により理解を頂き、書面でインフォームドコンセントを得ている。

There are racial differences in susceptibility to coronary artery disease, and there are multiple factors that can be considered. The aim of this study was to identify new susceptible subdomains for sib genetic linkage to coronary artery disease (CAD). This study was conducted by Nagoya University, Gifu University, Nagoya City University, Yamagata University, Fujita Health University Affiliated Hospital, Hamamatsu Medical University Affiliated Hospital, Aichi Medical University Affiliated Hospital, Showa University Fujigaoka Hospital, and 45 Cooperative Hospitals, including the Public. This study aims to explore the susceptibility of lifestyle diseases such as myocardial infarction, coronary artery disease and hypertension. This study is related to coronary artery disease in our country, the initial need to identify susceptible loci, construct large-scale candidate loci for sib linkage, and test the identification of susceptible loci. At the end of December 2016, about 10000 patients were diagnosed, 6000 patients with myocardial infarction, and 7000 patients with other coronary artery diseases. Research advances the establishment of an information base that is aligned with the sequence. Now, heart attack patients 201 pairs of DNA collection, collection and sequence The genetic linkage of 109 pairs of sibling pairs for heart infarction was prepared. The linkage domain before and after LOD=2.0 was obtained. The number of sibling pairs increased. The linkage domain of intentional chromosome pairs was determined. The DNA provider is responsible for providing information, explaining it fully, understanding it, and writing it to the public.

项目成果

第1章 疾患ゲノム解析 4.遺伝子多型による冠動脈弛緩リスクの予測

第一章 疾病基因组分析 4. 通过基因多态性预测冠状动脉舒张风险

• 发表时间: 2005
• 期刊: 実験医学 23(増刊)
• 作者: Wulf;G.G.;et al.;稲垣暢也;Y.Shimamoto et al.;Y.Kim.et al.;N.Shihara et al.;S.M.Echwald et al.;N.Gu et al.;M.Nishimura et al.;横田充弘
• 通讯作者: 横田充弘

心筋梗塞感受性遺伝子

心肌梗塞易感基因

• 发表时间: 2004
• 期刊: 分子心血管病 5
• 作者: 横田充弘;浅野展行;井澤英夫
• 通讯作者: 井澤英夫