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全ゲノム罹患同胞対連鎖解析及び候補遺伝子関連解析による心筋梗塞感受性遺伝子の同定

全基因组受影响同胞对连锁分析和候选基因关联分析鉴定心肌梗死易感基因

基本信息

批准号：
18018020
负责人：
横田充弘
金额：
$ 7.04万
依托单位：
Aichi Gakuin University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

「研究の目的」本研究の目的は、心筋梗塞(MI)・冠動脈疾患(CAD)罹患同胞対を対象としたゲノムワイド罹患同胞対連鎖解析により、MI責任遺伝子座を同定し、その領域内に存在する遺伝子(多型)について大規模症例-対照関連解析を実施し、MI感受性遺伝子を同定することである。「全ゲノム罹患同胞対連鎖解析」MI・CAD罹患同胞対(227対、457例)を対象として、405個のマイクロサテライトマーカーを用いたゲノムワイド連鎖解析(GWLS)を実施し、5染色体6領域に候補連鎖領域を得た。1領域以外の5領域は、国内外の他の論文で未だ報告されていない。さらに、この内の3領域(LOD>2.2)に20マーカーを追加、設定し、連鎖領域の確認と狭小化を実施した。なお、この解析で得られたmax.peak LOD score=2.9である。2番染色体候補連鎖領域に約3,000SNPsを設定し、高密度SNPタイピングをMI症例、対照各約500例で実施し、有力なMI候補遺伝子Aを発見した。現在、約4,000例以上の大規模関連解析を実施している。他の候補連鎖領域に関しても、同様に、大規模関連解析を実施する計画である。「今後の課題」現在、ゲノムワイド関連解析(GWAS)の研究支援を申請中である。受理されれば、GWLSとGWASが同時に可能となり、1)SNPを用いた連鎖解析の実施と、マイクロサテライトを用いた連鎖解析との比較、2)遺伝的素因の強い罹患同胞対症例と孤発例との感受性遺伝子の相同性、3)連鎖領域に位置する遺伝子の同時並行相関解析の実施、など、遺伝学的にも興味深い多面的な解析が可能になると考える。

The objectives of this study were to identify sib pairs of heart infarction (MI) and coronary artery disease (CAD), and to determine the genetic linkage between MI and sib pairs. "All-sib linkage" MI·CAD sib linkage (227 pairs, 457 cases) was carried out on chromosome 5 and candidate linkage domains were obtained on chromosome 6. 5 fields outside 1 field, other papers at home and abroad are not reported. 3 fields (LOD>2.2), 20 fields (LOD>2.2なお、この解析で得られたmax.peak LOD score=2.9である。About 3,000 SNPs were set up for 2 chromosome candidate linkage domains, and about 500 cases of MI syndrome and 500 cases of MI candidate A were detected. At present, more than 4,000 large-scale correlation analyses are being implemented. Other candidate domains are related, homogeneous, and large-scale relational analysis. "Future Issues" Now, the application for research support for GWAS is pending. 1) Comparison of genetic linkage between SNPs, 2) Similarity of susceptible genes among sib cases, 3) Simultaneous correlation analysis of genetic loci, 3) Simultaneous correlation analysis of genetic loci, 4) Genetic linkage analysis of genetic loci, 5) Genetic linkage analysis of genetic loci, 6) Genetic linkage analysis of genetic loci.