VR技術を用いた生命機能情報や知識の統合的可視化に関する研究

利用VR技术实现生物功能信息与知识集成可视化研究

基本信息

  • 批准号:
    16014205
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 3.46万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2004 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

DNAチップ(Genotyping Microarray)の情報を用い,ゲノムのコピー数を対立遺伝子ごとに高解像度で見ることが出来るGIM(Genome Imbalance Map)の開発を行った.DNAチップの情報を利用して,ノイズの除去,コピー数推定,可視化という流れのシステムである.この中で,ひとつのサンプルで,あるいは複数サンプルに渡って,染色体のコピー数を一目で見ることの出来る可視化手法を提案した.染色体のコピー数が異常になっている領域(欠損領域や増幅領域)を検出するために,染色体バンドイメージを利用して可視化し,ボタンひとつでコピー数の抽出を可能にし,異常領域のみを動きなどを利用して強調表示させることを行った.これらにより,複数サンプルで比較し,全体の傾向をつかむことが可能になった.このGmの手法について,国際会議や学会にて,発表を行った.文献情報などから作成したゲノムネットワークの可視化手法の開発などを行った.従来の可視化手法においては,ネットワークとして描くと,全く混雑してわからない絵となってしまう.本研究では,ネットワークの性質を利用して,ネットワークのノードに情報を折りたたむことなどをして,まとめていく可視化手法を開発した.この手法を利用することで,ネットワークの骨格を抽出することが可能になった.VR環境として,PCを複数台利用した大規模VR環境の開発を行った.大型コンピュータなしに,PCで構築することが可能になったために,今後の普及が期待できる.また,大規模VR環境だけでなく,裸眼立体視ディスプレイなどを利用した可搬型VR環境システムの構築を行い,3次元立体映像をどこでも提示することが可能となった.また,研究者からの情報発信としてVR環境を利用したゲノム関連展示を実施し,展示の際にアンケート調査などをした結果をまとめ,学会で発表を行った.
DNA チ ッ プ (Genotyping Microarray) の intelligence を い, ゲ ノ ム の コ ピ ー number を state heritage seaborne 伝 son ご と に high resolution で see る こ と が out る GIM (Genome Imbalance Line Map) の open 発 を っ た. DNA チ ッ プ の intelligence を using し て, ノ イ ズ の eliminate, コ ピ ー presumption, visual と い う flow れ の シ ス テ ム で あ る. こ の で, ひ と つ の サ ン プ ル で, あ る い は plural サ ン プ ル に crossing っ て, chromosome の コ ピ ー see an order number を で る こ と の out る visualization technique proposed を し た. Abnormal number of chromosomes の コ ピ ー が に な っ て い る areas (less damage areas や raised picture) を 検 out す る た め に, chromosome バ ン ド イ メ ー ジ を using し て visualization し, ボ タ ン ひ と つ で コ ピ ー number の may take を に し, abnormal areas の み を dynamic き な ど を using し て emphasize said さ せ る こ と を line っ た. こ れ ら に よ り, plural サ ン プ ル で し, all の tendency を つ か む こ と が may に な っ た. こ の Gm の gimmick に つ い て, international society for meeting や に て, 発 table line を っ た. The literature and information な ら ら ら ら is made into a <s:1> たゲノムネットワ たゲノムネットワ <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1> visualization method <s:1> is developed な を を lines った. 従 to の visualization technique に お い て は, ネ ッ ト ワ ー ク と し て tracing く と, full く mixed 雑 し て わ か ら な い 絵 と な っ て し ま う. This study で は, ネ ッ ト ワ ー ク の nature を USES し て, ネ ッ ト ワ ー ク の ノ ー ド に intelligence を fold り た た む こ と な ど を し て, ま と め て い く visualization technique を open 発 し た. こ の technique を USES す る こ と で, ネ ッ ト ワ ー ク の bone を spare す る こ と が may に な っ た. VR environments と し て, PC を plural sets using し た Large-scale VR environment development を line った. Large コ ン ピ ュ ー タ な し に, PC で build す る こ と が may に な っ た た め に, future の popularization が expect で き る. ま た, large-scale VR environments だ け で な く, naked eye stereoscopic デ ィ ス プ レ イ な ど を using し た can move VR environments シ ス テ ム の build を い, 3 dimensional stereoscopic image を ど こ で も prompt す る こ と が may と な っ た. ま た, researchers か ら の intelligence 発 letter と し を て VR environment using し た ゲ ノ ム masato even show を be し, show the event の に ア ン ケ ー ト survey な ど を し た results を ま と め, learn で 発 table line を っ た.

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genome Imbalance Map : Visualization of Allelic Copy Number Using Genotyping Microarray
基因组不平衡图:使用基因分型微阵列可视化等位基因拷贝数
VR環境を用いたゲノム関連展示とその操作ログの可視化
使用 VR 环境可视化基因组相关展品和操作日志
没入型多面ディスプレイの教育応用
沉浸式多屏显示的教育应用
Information visualization of allelic copy number data for genome imbalance analysis
用于基因组不平衡分析的等位基因拷贝数数据的信息可视化
ゲノムコピー数異常検出のための可視化
用于检测基因组拷贝数畸变的可视化
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廣瀬 通孝其他文献

人の触知覚メカニズムと触感デザイン
人类触觉感知机制与触觉设计
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小川 奈美;鳴海 拓志;伴 祐樹;櫻井 翔;谷川 智洋;廣瀬 通孝;篠崎隆宏;田中由浩
  • 通讯作者:
    田中由浩
Effects of alternation latency on the impression of avatars in face-to-face customer training VR
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Perceptual and Cognitive Change in Eating Experience of Tempura by Changing Eating Environment with Projection Mapping
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Combining the Yaw and Roll Visual Manipulation for Redirected Walking
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小川 奈美;鳴海 拓志;伴 祐樹;櫻井 翔;谷川 智洋;廣瀬 通孝;篠崎隆宏;田中由浩;宮内清子
  • 通讯作者:
    宮内清子

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緊張性振動反射(TVR)を用いたNo Motion VRディスプレイの開発
使用音调振动反射 (TVR) 开发 No Motion VR 显示器
  • 批准号:
    22K19806
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 3.46万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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虚拟现实共体现身体方案变换的心理学基础及其应用
  • 批准号:
    19H05661
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 3.46万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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实现高效身体技能学习的融合体VR研究
  • 批准号:
    19H01136
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 3.46万
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  • 批准号:
    20650014
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 3.46万
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    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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  • 批准号:
    19024016
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    $ 3.46万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
粒子型ディスプレイに関する研究
粒子显示研究
  • 批准号:
    18650019
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 3.46万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
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  • 批准号:
    17011019
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 3.46万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
装着型体験記録装置の情報を用いた,体験記憶再生方式に関する研究
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  • 批准号:
    16016222
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 3.46万
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    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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  • 批准号:
    04F04032
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 3.46万
  • 项目类别:
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VR技術を利用した生命機能情報の可視化に関する研究
利用VR技术实现生物功能信息可视化研究
  • 批准号:
    15014209
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 3.46万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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