結晶性ペプチド配位子を用いた金属酵素活性中心の合成的研究
結晶性ペプチド配位子を用いた金属酵素活性中心の合成的研究
批准号:
16033211
负责人:
奥 浩之
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005
中文摘要
本研究は、結晶性の良いペプチドを用いて金属酵素活性中心を化学合成することを目的としている。これによりアミノ酸に由来する配位環境まで含めた、より複雑で大きな活性中心の構築を目指している。現在までに以下の成果を得た。(1)配位子の基礎設計ペプチドヘリックスを錯体配位子として用いる場合、問題となる点は合成・溶解度・結晶性に加えてコンフォメーションの安定性である。今回、安定なペプチドヘリックスをデザインする必要性から単結晶構造解析を用いて、2次構造の安定化と発生機構について検討を行った。-(Leu-Leu-Lac)-(Lac=L-lactic acid)の場合、βシートの単結晶は6〜2残基に於いて、ヘリックスの単結晶は11〜14残基以上の配列から得られることがわかった。(2)窒素配位子を持つペプチドヘリックス金属酵素活性中心を構成するアミノ酸のうち、窒素配位子としてヒスチジン(His)がよく見られる。しかしペプチド合成に於いてHisは保護基の選択、脱保護、溶解性に問題が多い。そこで始めにHisアナログとして用いられるPal(β-(3-pyridyl)-L-alanine)を組み込んだペプチド配位子と錯体の合成研究を行った。Pal族基を2つ有するペプチドヘリックスとCo(II)の錯形成の場合、無限鎖を除き、分子間と分子内の配位形式が考えられる。配列を変えて合成を行い、この2種類を得ることに成功した。(3)カルボン酸配位子を持つペプチドヘリックス金属酵素活性中心を構成するアミノ酸として、酸素配位子としてアスパラギン酸(Asp)とグルタミン酸(Glu)がよく見られる。GluとAsp残基を有するペプチドヘリックスとCo(II)の錯形成による錯体構造がX線構造解析から得られた。結晶構造中には1:1の錯形成で生じた無限鎖構造が観察された。
英文摘要
本研究は、結晶性の良いペプチドを用いて金属酵素活性中心を化学合成することを目的としている。これによりアミノ酸に由来する配位環境まで含めた、より複雑で大きな活性中心の構築を目指している。現在までに以下の成果を得た。(1)配位子の基礎設計ペプチドヘリックスを錯体配位子として用いる場合、問題となる点は合成・溶解度・結晶性に加えてコンフォメーションの安定性である。今回、安定なペプチドヘリックスをデザインする必要性から単結晶構造解析を用いて、2次構造の安定化と発生機構について検討を行った。-(Leu-Leu-Lac)-(Lac=L-lactic acid)の場合、βシートの単結晶は6〜2残基に於いて、ヘリックスの単結晶は11〜14残基以上の配列から得られることがわかった。(2)窒素配位子を持つペプチドヘリックス金属酵素活性中心を構成するアミノ酸のうち、窒素配位子としてヒスチジン(His)がよく見られる。しかしペプチド合成に於いてHisは保護基の選択、脱保護、溶解性に問題が多い。そこで始めにHisアナログとして用いられるPal(β-(3-pyridyl)-L-alanine)を組み込んだペプチド配位子と錯体の合成研究を行った。Pal族基を2つ有するペプチドヘリックスとCo(II)の錯形成の場合、無限鎖を除き、分子間と分子内の配位形式が考えられる。配列を変えて合成を行い、この2種類を得ることに成功した。(3)カルボン酸配位子を持つペプチドヘリックス金属酵素活性中心を構成するアミノ酸として、酸素配位子としてアスパラギン酸(Asp)とグルタミン酸(Glu)がよく見られる。GluとAsp残基を有するペプチドヘリックスとCo(II)の錯形成による錯体構造がX線構造解析から得られた。結晶構造中には1:1の錯形成で生じた無限鎖構造が観察された。
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Synthesis, Crystal Structure and Molecular Conformation of Na-Boc-L-Leucyl-(Z)-β-(3-pyridyl)-α,β- Dehydroalanyl-L-Leucine Methyl Ester
Na-Boc-L-亮氨酰-(Z)-β-(3-吡啶基)-α,β-脱氢丙氨酰-L-亮氨酸甲酯的合成、晶体结构和分子构象
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
J.Pep.Res. 65巻
影响因子:
--
作者:
[Y.Ohshima, et al., Hiroyuki Oku, Keiichi Yamada]
通讯作者:
Keiichi Yamada
Synthesis of a Model peptide Containing a Metal Binding Site of Carbon Monooxide Dehydrogenase/Acetyl Coenzyme A Synthase(CODH/ACS).
含有一氧化碳脱氢酶/乙酰辅酶 A 合酶 (CODH/ACS) 金属结合位点的模型肽的合成。
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Peptide Science 2004
影响因子:
--
作者:
[H.Tsukamoto, M.Sato, Y.Kondo, Akitake Nakamura, Muneyoshi Makabe, Kazuaki Shichiri, Subaru Kawasaki, Tsuyoshi Kitamura, Ikuo Kondo]
通讯作者:
Ikuo Kondo
A synthetic intermediate of enantiopure N-protected β-hydroxyvalin e, (2R)-2-[N-(tert-butoxycarbonyl) amino]-3-methylbutane-1,3-diol
对映纯 N-保护 β-羟基缬氨酸 e, (2R)-2-[N-(叔丁氧羰基)氨基]-3-甲基丁烷-1,3-二醇的合成中间体
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Acta Cryst. E60巻
影响因子:
--
作者:
[Masakazu Hirotsu, Naoki Ohno, Takashi Nakajima, Keiji Ueno, Hiroyuki Oku, Kozo Toyota, Hiroyuki Oku]
通讯作者:
Hiroyuki Oku
An N-Protected depsipeptide Free Acid Prepared by Direct Synthesis Without Using a Terminal-C Protecting Group : tert-Butoxycarbonyl-L-Alanyl-L-Leucyl-L-Lactic Acid (Boc-L-Ala-L-Leu-Lac-OH)
不使用 C 端保护基直接合成制备的 N-保护缩肽游离酸:叔丁氧基羰基-L-丙氨酰-L-亮氨酰-L-乳酸 (Boc-L-Ala-L-Leu-Lac-OH)
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Acta Cryst. E60巻
影响因子:
--
作者:
[Masakazu Hirotsu, Shinsuke Taruno, Takashi Yoshimura, Keiji Ueno, Masafumi Unno, Hideyuki Matsumoto, Akitake Nakamura, Hiroyuki Oku]
通讯作者:
Hiroyuki Oku
温度応答性デプシペプチドポリマー
温度响应型缩酚肽聚合物
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 12 条
水溶性マラリアワクチンの化学合成とワクチン-抗体相互作用の分子構造解析
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批准号:16750139
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2004
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负责人:奥 浩之
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依托单位:
結晶性ヘリックスペプチドを用いた金属酵素活性中心の合成的研究
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批准号:15036212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:2003
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负责人:奥 浩之
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依托单位:
3_<10>ヘリックスモデル錯体による金属酵素の活性調節機構研究
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批准号:12740356
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2000
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负责人:奥 浩之
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依托单位:
光応答性酵素モデル錯体の合成的研究
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批准号:10740312
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1998
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负责人:奥 浩之
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依托单位:
海外基金