立体構造特異性に基づく癌化制御機構の解析

基于构象特异性的癌变控制机制分析

• 批准号: 17012007
• 负责人: 堀越 正美
• 金额: $ 7.17万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17012007/
• 关键词: ガンキリン; p53; TAF-1; CIA; 立体構造; CDK; KLF5; Rb

1.ガンキリンによるCDK-Rbの立体構造特異的制御機構の解明a.重ね合わせモデリングから、Rb-ガンキリン間、ガンキリン-CDK間の相互作用に重要であると予想されるアミノ酸に、点変異を約30種導入した点変異株を作製した。b.a.で作製したRb、ガンキリン、CDKの点変異体と野生体を純度90%以上に調製した。c.Nas6の立体構造から重ね合わせモデリングしたRb-ガンキリン-CDK複合体の予測構造を検証するために精製蛋白質を用いて三者複合体の形成を確認する実験を現在、行っている。2.TAF-Iのzinc finger DNA結合因子阻害機構解明のための立体構造解明a.TAF-Iの結晶化に成功し立体構造解析を行い、立体構造を明らかにした(論文投稿中)。b.癌遺伝子産物であるDNA結合性因子KLF5のDNA結合活性をTAF-Iが阻害することから、KLF5の大量調製を行った。c.TAF-Iの機能ドメイン解析を行うために、18種類の点変異株を作成し、各々ヒストン結合活性、ヒストンシャペロン活性、DNA結合活性を担うドメイン解析を行った(論文投稿中)。d.KLF5による癌関連遺伝子の発現制御機構を明らかにする目的で、KLF5単独、またはKLF5-DNAの結晶化・立体構造解析を進めている。3.CIAの立体構造解析に基づいたp53との機能的・構造的関連性の解析a.CIAの立体構造に基づいた分子表面全体への点変異体約90種を作製した。b.CIAの立体構造解析を行い、決定した(論文発表済)。

1. Explanation of the control mechanism of CDK-Rb with specific stereo structure a. The interaction between CDK and Rb is important to the control of CDK and Rb. b. a. Preparation of Rb, CDK and its impurities with a purity of more than 90% c. The three-dimensional structure of Nas6 was confirmed by the prediction of Rb-CDK complex and the purification of protein. 2. Analysis of the blocking mechanism of zinc finger DNA binding factor of TAF-I and its three-dimensional structure a. Successful crystallization of TAF-I. Analysis of three-dimensional structure and its three-dimensional structure (paper submission). b. The DNA-binding activity of KLF5, a DNA-binding factor in cancer gene products, is inhibited by TAF-I and regulated by KLF5 in large quantities. c. Functional analysis of TAF-I, preparation of 18 different species, binding activity of each species, selection activity of species, and DNA binding activity (paper submission). d. KLF5-DNA Crystallization and Three-dimensional Structure Analysis of Cancer-Related Gene 3. Analysis of the three-dimensional structure of CIA and the relationship between the structure and the function of CIA b. The three-dimensional structure analysis of CIA is carried out and decided (paper report).

项目成果

Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the histone chaperone cial from fission yeast

裂殖酵母组蛋白伴侣的纯化、结晶和初步 X 射线衍射分析

• 发表时间: 2005
• 期刊: Acta Crystallogr.F 61
• 作者: Honda K;Ohba Y;Yanai H;Negishi H;Mizutani T;Takaoka A;Taya C;Taniguchi T.;T.Umehara et al.
• 通讯作者: T.Umehara et al.

Structural similarity between histone chaperone Cialp/Asflp and DNA- binding protein NF-κB

组蛋白伴侣 Cialp/Asflp 和 DNA 结合蛋白 NF-κB 之间的结构相似性

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Biochem. 138
• 作者: Nada S;Hondo A;Kasai A;Koike M;Saito K;Uchiyama Y;Okada M.;B.Padmanabhan et al.
• 通讯作者: B.Padmanabhan et al.

Nuclear Dynamics

核动力学

• 发表时间: 2006
• 作者: S.Muto;M.Horikoshi
• 通讯作者: M.Horikoshi

Regulation of histone acetylation and nucleosome assembly by transcription factor JDP2

• DOI: 10.1038/nsmb1063
• 发表时间: 2006-04-01
• 期刊: NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY
• 影响因子: 16.8
• 作者: Jin, CY;Kato, K;Yokoyama, KK
• 通讯作者: Yokoyama, KK

The deacetylase HDAC1 negatively regulates the cardiovascular transcription factor Kruppel-like factor 5

脱乙酰酶 HDAC1 负向调节心血管转录因子 Kruppel 样因子 5

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Biol.Chem. 280
• 作者: Honda K;Yanai H;Negishi H;Asagiri M;Sato M;Mizutani T;Shimada N;Ohba Y;Takaoka A;Yoshida N;Taniguchi T.;T.Matsumura et al.
• 通讯作者: T.Matsumura et al.