FK506結合蛋白質(FKBP)のクロマチン構造変換活性の解析

FK506结合蛋白（FKBP）染色质结构转换活性分析

• 批准号: 17659014
• 负责人: 堀越 正美
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17659014/
• 关键词: FKBP; PPIase; クロマチン; rDNA; 免疫抑制剤; CIA; JDP2; NF-κB

1.FKBPによるヒストンのプロリン異性化の発見a.これまでにFK506結合蛋白質(FKBP)がヒストンシャペロン活性を持ち、rDNAサイレンシング反応に関与するといった性質を見出したことから、ヌクレオソーム中のヒストンに働きかけることが考えられた。そこで、ヒストン中に局在するプロリン残基に着目し、FKBPのプロリン異性化酵素活性を指標に異性化を行うターゲットとなるプロリン残基を探し同定に至った。b.ヒストンのプロリン残基周辺アミノ酸配列をGST融合蛋白質として精製し、FKBPと相互作用することを試験管内で確認した。また、細胞内でFKBPと相互作用しrDNAサイレンシング反応に協調的に作用する因子を同定するためのスクリーニングの準備を終え、解析を進めている。c.これまでに示したFKBPのPPIase活性中心に変異を加えた酵母株において、rDNA領域でのサイレンシングが強まるという知見から、FKBPが異性化を行うヒストンの残基に変異を加えることで同じようにサイレンシングが強まることを予測し、検定を進めている。2.DNA、結合性因子JDP2がヒストンシャペロンであることの発見本研究の将来的な見込みを考え、ヒストンシャペロン活性を有する新しいタイプの因子を明らかにする解析を行った。既に我々が示したCIAがNF-κBと立体構造がほぼ同じであるという知見から、ある種のDNA結合性をもつ因子がヒストンシャペロン活性を持つことが考えられた。そこで、今迄に明らかになった物性からヒストンシャペロン活性を有すると考えられるDNA結合性因子に関して、ヒストンシャペロン活性が有するかどうかを検定した。その結果、G1→S期制御因子である因子JDP2がヒストンシャペロン活性を有することを発見した(論文発表済)。

1. Development of FKBP protein heterogeneity a. FK506 binding protein (FKBP) protein heterogeneity activity, rDNA protein heterogeneity and its properties. In addition, FKBP is an indicator of the activity of heteroenzymes in the expression of FKBP residues. b. Identification of GST fusion protein by enzyme digestion and FKBP interaction FKBP interactions in cells are regulated by factors such as rDNA, DNA c. This indicates that FKBP PPIase activity center is different from yeast strain, rDNA domain is different from yeast strain, rDNA residue is different from yeast strain, rDNA domain is different from 2. DNA, binding factor JDP2, and the analysis of gene expression in this study. The DNA binding activity of the three species is determined by the presence of NF-κB and its stereostructure. The activity of DNA binding factors has been determined. The results show that the G1→S control factor JDP2 has a positive effect on the activity of the enzyme.

项目成果

Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the histone chaperone cial from fission yeast

裂殖酵母组蛋白伴侣的纯化、结晶和初步 X 射线衍射分析

• 发表时间: 2005
• 期刊: Acta Crystallogr.F 61
• 作者: Honda K;Ohba Y;Yanai H;Negishi H;Mizutani T;Takaoka A;Taya C;Taniguchi T.;T.Umehara et al.
• 通讯作者: T.Umehara et al.

Structural similarity between histone chaperone Cialp/Asflp and DNA- binding protein NF-κB

组蛋白伴侣 Cialp/Asflp 和 DNA 结合蛋白 NF-κB 之间的结构相似性

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Biochem. 138
• 作者: Nada S;Hondo A;Kasai A;Koike M;Saito K;Uchiyama Y;Okada M.;B.Padmanabhan et al.
• 通讯作者: B.Padmanabhan et al.

Nuclear Dynamics

核动力学

• 发表时间: 2006
• 作者: S.Muto;M.Horikoshi
• 通讯作者: M.Horikoshi

Regulation of histone acetylation and nucleosome assembly by transcription factor JDP2

• DOI: 10.1038/nsmb1063
• 发表时间: 2006-04-01
• 期刊: NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY
• 影响因子: 16.8
• 作者: Jin, CY;Kato, K;Yokoyama, KK
• 通讯作者: Yokoyama, KK

The deacetylase HDAC1 negatively regulates the cardiovascular transcription factor Kruppel-like factor 5

脱乙酰酶 HDAC1 负向调节心血管转录因子 Kruppel 样因子 5

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Biol.Chem. 280
• 作者: Honda K;Yanai H;Negishi H;Asagiri M;Sato M;Mizutani T;Shimada N;Ohba Y;Takaoka A;Yoshida N;Taniguchi T.;T.Matsumura et al.
• 通讯作者: T.Matsumura et al.