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劣性遺伝疾患原因遺伝子検索システムの構築

隐性遗传病致病基因检索系统的构建

基本信息

批准号：
17019022
负责人：
石垣靖人
金额：
$ 2.88万
依托单位：
Kanazawa Medical University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

ナンセンス変異の存在を前提として、DNAマイクロアレイによる網羅的遺伝子発現解析を利用した劣性遺伝疾患原因遺伝子探索の新しい方法論を構築すると共に、原因遺伝子が既知の患者由来細胞を用いて構築したシステムの有効性を検証することが本研究の目的である。劣性遺伝疾患ではナンセンス変異が一定の頻度で観察されるが、このタイプの変異をもつ遺伝子のmRNAはナンセンス変異異存mRNA分解機構(Nonsense-mediated mRNA decay、NMDと略される、別名RNA-サーベイランスとも呼ばれる)により正常なmRNAとは分別されて選択的に分解される。そのために、変異遺伝子の発現はmRNAレベルでほぼ消失しており、変異配列から予想されるトランケート型のタンパク質も生成せず、いわゆる"null"の状態にある。そこで、DNAマイクロアレイを利用した網羅的遺伝子発現解析系を利用して発現の消失した遺伝子を同定できれば、遺伝疾患や発がん等の原因遺伝子を速やかに決定できる。ただし、実際のDNAマイクロアレイの測定結果は多数の遺伝子発現を定量化できる一方で、測定自体のノイズおよび個体、実験間のばらつきが大きく単一発現欠損遺伝子の同定は困難である。このため、複数の手法を組み合わせて共通にNMDの標的となりうる遺伝子の候補を選別し、ノイズを軽減することによって再現性をもたせて実際的な候補数まで絞り込む必要がある。そのために、ナンセンス変異による遺伝子発現欠損と併せて、親子関係やNMDの阻害、NMD関連因子のノックダウンにより絞りこむことを試みた。その有用性を検討するために変異既知の患者由来細胞を利用して試験してみると、変異による欠損と阻害剤で発現が上昇する遺伝子の組み合わせが有効であることが明らかとなった。原因遺伝子未知の疾患への応用に向けて症例の収集も併せて行った。

There is a presupposition that there is a premise that there is a problem, and that there is an analysis in the DNA network. The purpose of this study is to explore a new method to explore the cause of a disease by using the etiology of the disease. It is necessary to make sure that the mRNA is stored in the mRNA decomposition mechanism (Nonsense-mediated mRNA decay, NMD, alias, RNA-), and the normal mRNA is selected. You can see that the mRNA is missing, and that you want to make sure that you have a problem, and that you want to make a change in the status that you want to make a change. For reasons such as diagnosis, DNA diagnosis, and other reasons, such as the disappearing child of the Internet, the user of the Internet, the user of the Internet, and the cause of the disease, the user can quickly determine the number of users. The results show that most of the customers are in the same position as those who are currently in arrears. Most of them are able to quantify each other, to determine the size of the system, and to determine the same problem. The data collection system and the multiplicative data system system share the same information as the waiting list of the NMD system. Please check the number of candidates you need to check the number of candidates you need. Please tell me that you are in arrears, that the NMD is blocked, that the NMD factor is blocked, and that the test is not available. Because of the usefulness of the disease, we know that the cause of the patient is known to be the cause of the disease. I know that the patient is suffering from the disease. I know that the patient is suffering from the disease. The cause of the disease is unknown, the disease is unknown, and the disease is related to the disease.