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分子シャペロンのX線結晶構造解析

分子伴侣的X射线晶体结构分析

基本信息

批准号：
17028014
负责人：
深井周也
金额：
$ 8.06万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17028014/
关键词：
X線結晶構造解析シャペロン膜透過装置膜タンパク質 ATPase

项目摘要

分子シャペロンは,ほどけたポリペプチドのフォールディングを助け,タンパク質としての機能を与える.あるいは逆に,固くまとまってしまったポリペプチドを一度ほどくことによって再利用したり,脂質膜で隔てられた領域の間を効率的に輸送したりすることを可能にしている.このようなポリペプチドの動的な構造変化に応じて,分子シャペロン自身も構造を変化させる.本研究では,シャペロン分子全体の結晶構造を決定し,ATP加水分解に伴う構造変化とシャペロン機構についての構造基盤を確立することを目的とした.リボソームで合成されたばかりのポリペプチド鎖のフォールディングを助けるDnaK・DnaJ・DafA複合体,および,小胞輸送の最終段階で膜小胞と標的膜との融合で働くNSFを解析対象として研究を開始した.DnaK・DnaJ・DafA複合体については4.4Å分解能の回折データセットを収集したが構造決定までには至らなかった.DnaJ単体についても3.2Å分解能の回折データセットを収集したが,回折の異方性が高く構造を決定することができなかった.酵母のNSFであるSec18Pについては,10種類の発現コンストラクトについて様々なアデニンヌクレオチド存在下での結晶化スクリーニングを行なったが結晶は得られなかった.一方,ATPに依存した膜透過を行なう膜透過装置複合体SecDFおよびSecYEについて,京大ウイルス研の伊藤維昭教授との共同研究を行なって来た.好熱菌由来のSecDFおよびSecYEについて,分解能3.7Åおよび3.2ÅのMAD回折データセットを収集した.SecYEの構造は,Fabフラグメントとの複合体の状態で3.14Å分解能で決定した(R_<free>=0.32).機能上重要であると示されている領域の電子密度も比較的明瞭であり,膜透過メカニズムがより詳細に明らかになるものと考えている.

Sub-selection, selection, In this case, it is necessary to re-use the lipid membrane and to re-use the lipid membrane. The structure of the molecule itself is changed. This study aims to determine the crystal structure of the whole molecule, and to establish the structural basis for ATP hydrolysis. DnaK·DnaJ·DafA complex, DnaK·DnaJ·DafA Complex 4.4 μ m Decomposition Energy Refraction Energy The structure of the structure is determined by the anisotropy of the fold. Yeast NSF can be found in Sec18P, 10 species of yeast can be found in Sec 18 P, 18 P, 18 P 18 P, 18 P 18 P On the other hand,ATP dependent membrane transmission is a joint study of membrane transmission device complex SecDF and SecYE by Professor Yoshiaki Ito of Kyoto University. SecDF and SecYE of the origin of the good bacteria, decomposition energy <free>3.7 Functionally important, the electron density of the field is compared with the electron density of the membrane.