繋留因子群の立体構造解析による膜融合制御機構の解明
繋留因子群の立体構造解析による膜融合制御機構の解明
批准号:
16044214
负责人:
深井 周也
金额:
$4.16万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006
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オルガネラ間の物質輸送は小胞を介して行われる.目的の部位に到達した小胞は,標的膜と融合することによって積荷を受け渡す.繋留因子は,膜融合の初期段階で,小胞とその標的膜とを特異的に繋留することによって輸送の特異性を保証する.繋留因子は,3-8個のサブユニットから構成されるタンパク質複合体であり,低分子量GTPaseとの相互作用によってヌクレオチド依存的に制御されている.本研究では,開口放出で働くExocyst複合体の立体構造をX線結晶構造解析あるいは電子顕微鏡によって決定し,繋留の物理的機構とその制御機構を明らかにする.さらに,変異体をつかって細胞レベル,in vitroでの解析を行い,機能の面からの裏付けを行う.今年度は,ほ乳類のExocyst複合体の電子顕微鏡による解析と,酵母のExocyst複合体と結合するSec4のGEFであるSec2のX線結晶構造解析を行なった.Exocyst複合体は,ブタ脳あるいはラット脳から精製し,電子顕微鏡をつかって,酢酸ウラニルによる負染色像を観察した.当初は,粒子の均一性に問題があったが,調製方法を改善することにより,Exocyst複合体全体と考えられる約150Åの大きさの粒子を多く観察できるようになった.しかしながら,解離した複合体と考えられる約60Åと120Åの大きさの粒子が依然として残っており,解析の妨げとなっている.粒子の均一性を高めることにより,単粒子解析が可能な試料調製法を確立することが,今後の課題である.また,Exocyst複合体と相互作用するRalのGTPase活性化タンパク質を新規に同定した.in vitroでの活性測定を終え,現在は,細胞レベルでの解析を行なっている.一方,Sec2については,Sec4との相互作用領域の結晶構造を3.0Å分解能で決定した.Sec2のSec4結合領域は,200Åの長さをもつトロポミオシン様のcoiled coilを形成していた.現在,立体構造にもとついてin vitroでの機能解析を進めている.
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Structural basis for lysidine formation by ATP pyrophosphatase accompanied with a lysine-specific loop and a tRNA-recognition domain.
ATP 焦磷酸酶伴随赖氨酸特异性环和 tRNA 识别域形成赖氨酸的结构基础。
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Proceeding of National Academy of Science U.S.A. 21
影响因子:
--
作者:
[Nakanishi, K., Fukai, S., Ikeuchi, Y., Soma, A., Sekine, Y., Suzuki, T., Nureki, O.]
通讯作者:
O.
Structural basis for sulfur relay to RNA mediated by heterohexametric TusBCD complex
异六角TusBCD复合物介导的硫向RNA传递的结构基础
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Structure 4
影响因子:
--
作者:
[Numata, T., Fukai, S., Ikeuchi, Y., Suzuki, T., Nureki, O.]
通讯作者:
O.
DOI:
10.1074/jbc.m411209200
发表时间:
2005-03-18
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Watanabe, K, Nureki, O, Hori, H]
通讯作者:
Hori, H
DOI:
10.1038/nsmb988
发表时间:
2005-10-01
期刊:
NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY
影响因子:
16.8
作者:
[Nakanishi, K, Ogiso, Y, Nureki, O]
通讯作者:
Nureki, O
PTPδとIL-1受容体様タンパク質の複合体によるシナプス形成誘導の構造基盤の解明
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批准号:23K27113
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.9万
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财政年份:2024
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负责人:深井 周也
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依托单位:
PTPδとIL-1受容体様タンパク質の複合体によるシナプス形成誘導の構造基盤の解明
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批准号:23H02420
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2023
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负责人:深井 周也
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依托单位:
BRCC36複合体によるK63結合型ユビキチン鎖特異的切断メカニズムの解明
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批准号:15F15386
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:深井 周也
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依托单位:
Exocyst複合体の再構成と構造解析
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批准号:20051008
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.22万
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财政年份:2008
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负责人:深井 周也
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依托单位:
Yipタンパク質ファミリーの結晶構造解析
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批准号:19036005
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2007
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负责人:深井 周也
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依托单位:
開口放出で働く繋留因子Exocyst複合体の立体構造解析
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批准号:18054009
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.03万
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财政年份:2006
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负责人:深井 周也
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依托单位:
分子シャペロンのX線結晶構造解析
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批准号:17028014
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$8.06万
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财政年份:2005
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负责人:深井 周也
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依托单位:
開口放出を制御するタンパク質複合体群の立体構造解析
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批准号:17053007
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.98万
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财政年份:2005
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负责人:深井 周也
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依托单位:
X線結晶構造解析に基づく嗅覚・味覚・温覚レセプターの情報変換メカニズムの解明
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批准号:17048007
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.03万
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财政年份:2005
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负责人:深井 周也
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依托单位:
高度好熱菌バリルtRNA合成酵素および基質との三重複合体のX線結晶構造解析
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批准号:99J10300
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.73万
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财政年份:1999
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负责人:深井 周也
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依托单位:
海外基金