天然由来低分子マイクロアレイを発端とした蛋白質機能モジュレーターの探索と創成

使用天然衍生的小分子微阵列搜索和创建蛋白质功能调节剂

• 批准号: 18038044
• 负责人: 叶 直樹
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18038044/
• 关键词: 低分子マイクロアレイ; 低分子アフィニティービーズ; リガンドスクリーニング; 蛋白質機能モジュレーター

研究実施計画に従い、前年度前半に他研究グループから報告された手法、すなわち、RFP結合型リコンビナント蛋白質を過剰発現させたヒト培養細胞の抽出液を、そのまま低分子マイクロアレイを用いたバインディングアッセイに用いる手法を、我々の天然由来低分子マイクロアレイ用に最適化してリガンドスクリーニングを行った。ブレオマイシン結合蛋白質に対して行ったリガンドスクリーニングにおいて、各種のブレオマイシン類縁体がヒットしたため、アレイ上での構造-結合活性相関を解析することにより、両者の相互作用に必須の因子を明らかにした。これらの構造-結合活性相関の結果はITC(等温滴定カロリメトリー)を用いた実験結果ともほぼ一致した。また、現在までに約8,000種類の化合物を固定化した天然および非天然由来低分子マイクロアレイに対して、100種類を超える蛋白質に対してリガンドスクリーニングを実施し、幾つかの新規な蛋白質-リガンドペアを見いだした。さらに、前年度までに化合物固定化アフィニティービーズを用いて同定された、天然由来砕骨細胞分化阻害物質と解毒酵素グリオキサラーゼ1の相互作用と生物学的な意味に関する解析を共同研究者らと行い、(1)この天然由来砕骨細胞分化阻害物質はグリオキサラーゼ1と直接結合してその酵素活性を基質競合的に阻害すること、(2)グリオキサラーゼ酵素活性の阻害が砕骨細胞前駆体から砕骨細胞への分化の阻害を引き起こすこと、および、(3)化合物とグリオキサラーゼ1の共結晶解析による詳細な相互作用機構の解析、を行い、この天然由来砕骨細胞分化阻害物質がグリオキサラーゼ1の新規な機能モジュレーターになることを明らかにした。

In the first half of the previous year, he studied the methods for developing low molecular weight proteins in cultured cells and optimizing the methods for using low molecular weight proteins. The analysis of structure-binding activity correlation between protein binding and protein binding is carried out in detail. The results of structure-binding activity correlation are consistent with ITC(Isothermal Titration). About 8,000 kinds of compounds of natural and unnatural origin have been immobilized, and 100 kinds of proteins have been immobilized. In addition, in the previous year, the use of immobilized compounds was also determined. Co-researchers conducted an analysis on the interaction and biological implications of the naturally derived osteocyte differentiation inhibitor and the detoxifying enzyme Gliocera 1.(1) This naturally derived osteocyte differentiation inhibitor directly binds to Gliocera 1 and its enzyme activity inhibits substrate competition.(2) Inhibition of enzyme activity of osteocyte precursor and differentiation of osteocyte;(3) Analysis of co-crystallization of compounds; Detailed analysis of interaction mechanism;(4) Analysis of function of natural inhibitors of osteocyte differentiation;(5) Analysis of function of natural inhibitors of osteocyte differentiation.

项目成果

マイクロアレイ・バイオチップの最新技術

微阵列和生物芯片的最新技术

• 发表时间: 2007
• 作者: Takahashi;K.;and H. Innan;小倉崇生;清水史郎
• 通讯作者: 清水史郎

分子間相互作用解析ハンドブック(光親和型低分子マイクロアレイを用いた低分子-蛋白質相互作用の検出)

分子相互作用分析手册（使用光亲和小分子微阵列检测小分子-蛋白质相互作用）

• 发表时间: 2007
• 作者: Gao;L.-z.;and H. Innan;伊藤安海;齊藤 安貴子
• 通讯作者: 齊藤 安貴子

Total synthesis of methyl sarcophytoate

• DOI: 10.1021/ja073952e
• 发表时间: 2007-08-15
• 期刊: JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY
• 影响因子: 15
• 作者: Ichige, Takahiro;Okano, Yusuke;Nakata, Masaya
• 通讯作者: Nakata, Masaya

Synthesis of an enantiomeric DNA oligomer and its T-Hg^<II>-T base-pair formation

对映体 DNA 寡聚物的合成及其 T-Hg^<II>-T 碱基对的形成

• 发表时间: 2007
• 期刊: Nucleic Acids Symp. Ser. 51
• 作者: 春田佳一郎;他7名(第2著者)
• 通讯作者: 他7名(第2著者)