低分子マイクロアレイを用いた蛋白質機能モジュレーターの探索と創成

使用小分子微阵列搜索和创建蛋白质功能调节剂

• 批准号: 19021005
• 负责人: 叶 直樹
• 金额: $ 2.94万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19021005/
• 关键词: 低分子マイクロアレイ; 低分子アフィニティービーズ; リガンドスクリーニング; 蛋白質機能モジュレーター

微生物化学研究会(微化研)との共同研究として、微化研が所有する約2,000種の小分子を固定化した小分子アレイ(微化研ライブラリーアレイ)を作成した。微化研の小分子ライブラリーには、50種類以上のブレオマイシン(BLM)類縁体が含まれていることを利用して、放線菌Streptoalloteichus hindustanus由来のBLM結合蛋白質であるShBleとBLMとの構造-結合活性相関を微化研ライブラリーアレイを用いて解析した。モデル動物を用いた実験から、ShBleはBLMが抗がん剤として投与された時の副作用である肺線維症を軽減する作用を持つことが明らかにされているため、ShBleとBLM類との相互作用を十分理解することは低毒性かつ薬効の高い新たなBLM類縁体の創成に役立つと考えられた。微化研ライブラリーアレイとShBle-RFPを用いた結合実験の結果、ShBleとBLMとの結合にはBLM構造中のビスチアゾール部分が必須であるが、グルオースとマンノースからなる2糖部分は必須ではないこと、また、BLM中のピリミジルプロピオンアミドのアミド部分や、ビスチアゾールから伸びた長鎖ポリアミン部分がShBleとの結合を補強していることも強く示唆された。これらの結果はITC(等温滴定カロリメトリー)を用いた熱力学的パラメータ測定や、共同研究で得られた共結晶構造からも支持された。特にこれらの構造の重要性を定量的に論じることは単独の結晶構造やNMR解析からでは難しいため、改めて小分子アレイプラットフォームを起点とした構造-結合活性相間の有用性を示す結果が得られた。

作为与微生物化学研究协会（Mikaken Kenkyusho）的联合研究项目，我们创建了一个小分子阵列（Mikaken Kenkyusho库阵列），其中大约有2,000种由Microkaken Kenkyushosho拥有的小分子被固定了。利用以上50种类型的博来霉素（BLM）类似物包含在微型小分子库中的事实，我们分析了Shble之间的结构结合活性关系，Shble（一种使用Microcaten库的BLM结合蛋白衍生出源自放线症链球菌链球菌链球菌链球菌链球菌的结合蛋白。使用模型动物的实验表明，Shble具有减少肺纤维化的作用，肺纤维化是抗癌剂时的副作用，并且人们认为对Shble和BLMS之间的相互作用的透彻相互作用有助于创建具有低毒性和高药用特性的新的BLM类似物。 As a result of binding experiments using the Microcaten Library Array and ShBle-RFP, it was strongly suggested that the bisthiazole portion in the BLM structure is essential for binding between ShBle and BLM, but the disaccharide portion consisting of gluose and mannose is not essential, and that the amide portion of pyrimidylpropionamide and the long-chain polyamine portion extending from bisthiazole in BLM用Shble加强键。这些结果也通过使用ITC（等热滴定量热法）和联合研究中获得的共结晶的热力学参数测量来支持。特别是，从单个晶体结构或NMR分析中，很难对这些结构的重要性进行定量讨论，并且已经获得了结果表明从小分子阵列平台开始的结构结合活性相之间的有用性。

项目成果

低分子リガンドの網羅的スクリーニングを目指したSPRイメージングの高感度化

提高SPR成像的灵敏度以全面筛选小分子配体

• 发表时间: 2007
• 作者: Osada;N.;H. Innan;伊藤 安海;高山 浩
• 通讯作者: 高山 浩

分子間相互作用解析ハンドブック(光親和型低分子マイクロアレイを用いた低分子-蛋白質相互作用の検出)

分子相互作用分析手册（使用光亲和小分子微阵列检测小分子-蛋白质相互作用）

• 发表时间: 2007
• 作者: Gao;L.-z.;and H. Innan;伊藤安海;齊藤 安貴子
• 通讯作者: 齊藤 安貴子

Total synthesis of methyl sarcophytoate

• DOI: 10.1021/ja073952e
• 发表时间: 2007-08-15
• 期刊: JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY
• 影响因子: 15
• 作者: Ichige, Takahiro;Okano, Yusuke;Nakata, Masaya
• 通讯作者: Nakata, Masaya

Structure-affinity relationship study of bleomycins and Shble protein by use of a chemical array

使用化学阵列研究博莱霉素和 Shble 蛋白的结构亲和关系

• 发表时间: 2009
• 期刊: Chembiochem 10
• 作者: Miyazaki;I.;et al.
• 通讯作者: et al.

SPRイメージング法を用いたp38 MAP kinaseとp62の結合部位の同定

SPR成像方法鉴定p38 MAP激酶和p62的结合位点

• 发表时间: 2008
• 作者: Than;C.;R. Sugino;H. Innan;L. Nakhleh;叶 直樹;山中真;齊藤 安貴子
• 通讯作者: 齊藤 安貴子